Protein–RNA interactions for Protein: S4R3C0

Uncharacterized protein (Fragment), humanhuman

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Length 116 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
S4R3C0 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
S4R3C0 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
S4R3C0 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
S4R3C0 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
S4R3C0 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
S4R3C0 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
S4R3C0 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
S4R3C0 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
S4R3C0 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
S4R3C0 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
S4R3C0 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
S4R3C0 DAG1-221ENST00000541308 5676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
S4R3C0 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
S4R3C0 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
S4R3C0 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
S4R3C0 WNK2-202ENST00000395477 6834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
S4R3C0 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
S4R3C0 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
S4R3C0 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
S4R3C0 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
S4R3C0 ADAMTS8-201ENST00000257359 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
S4R3C0 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
S4R3C0 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
S4R3C0 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
S4R3C0 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
S4R3C0 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
S4R3C0 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
S4R3C0 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
S4R3C0 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
S4R3C0 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
S4R3C0 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
S4R3C0 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC15.63■□□□□ 0.09
S4R3C0 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
S4R3C0 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
S4R3C0 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
S4R3C0 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
S4R3C0 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
S4R3C0 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
S4R3C0 TMEM255B-202ENST00000375353 6100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
S4R3C0 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
S4R3C0 HR-202ENST00000381418 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
S4R3C0 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
S4R3C0 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
S4R3C0 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
S4R3C0 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
S4R3C0 ABHD13-201ENST00000375898 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
S4R3C0 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
S4R3C0 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
S4R3C0 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
S4R3C0 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
S4R3C0 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
S4R3C0 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
S4R3C0 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
S4R3C0 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
S4R3C0 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
S4R3C0 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
S4R3C0 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
S4R3C0 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
S4R3C0 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
S4R3C0 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
S4R3C0 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
S4R3C0 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
S4R3C0 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
S4R3C0 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
S4R3C0 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
S4R3C0 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
S4R3C0 CDH23-212ENST00000616684 4814 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
S4R3C0 RIOX2-201ENST00000333396 5347 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
S4R3C0 TP53BP2-202ENST00000391878 4741 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
S4R3C0 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
S4R3C0 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
S4R3C0 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
S4R3C0 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
S4R3C0 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
S4R3C0 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
S4R3C0 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
S4R3C0 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
S4R3C0 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
S4R3C0 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
S4R3C0 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
S4R3C0 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
S4R3C0 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
S4R3C0 ZC3H12D-201ENST00000409806 5791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
S4R3C0 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
S4R3C0 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
S4R3C0 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
S4R3C0 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
S4R3C0 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
S4R3C0 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
S4R3C0 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
S4R3C0 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
S4R3C0 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
S4R3C0 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
S4R3C0 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
S4R3C0 CADPS-201ENST00000283269 4591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
S4R3C0 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
S4R3C0 IRS2-201ENST00000375856 8138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
S4R3C0 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
S4R3C0 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
S4R3C0 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
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