Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6D6

ARFGEF1, Brefeldin A-inhibited guanine nucleotide-exchange protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,849 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARFGEF1Q9Y6D6 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
ARFGEF1Q9Y6D6 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
ARFGEF1Q9Y6D6 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
ARFGEF1Q9Y6D6 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
ARFGEF1Q9Y6D6 DGCR6L-201ENST00000248879 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
ARFGEF1Q9Y6D6 MCFD2-203ENST00000409147 671 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
ARFGEF1Q9Y6D6 AC246785.2-201ENST00000432512 513 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
ARFGEF1Q9Y6D6 TSPY21P-201ENST00000433481 731 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
ARFGEF1Q9Y6D6 AP000347.1-209ENST00000437294 557 ntTSL 4 BASIC24.4■■□□□ 1.5
ARFGEF1Q9Y6D6 TSPY23P-201ENST00000440136 739 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
ARFGEF1Q9Y6D6 AC135586.2-201ENST00000537262 567 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.4■■□□□ 1.5
ARFGEF1Q9Y6D6 PSMD9-208ENST00000542602 516 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
ARFGEF1Q9Y6D6 DUX4-205ENST00000570263 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
ARFGEF1Q9Y6D6 RAB11B-AS1-201ENST00000593581 1013 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
ARFGEF1Q9Y6D6 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
ARFGEF1Q9Y6D6 CALHM3-201ENST00000369783 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
ARFGEF1Q9Y6D6 AC012414.5-201ENST00000564214 1602 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
ARFGEF1Q9Y6D6 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
ARFGEF1Q9Y6D6 NAA50-209ENST00000497525 1385 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
ARFGEF1Q9Y6D6 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
ARFGEF1Q9Y6D6 YPEL3-201ENST00000398838 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
ARFGEF1Q9Y6D6 AC023511.2-201ENST00000618803 211 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
ARFGEF1Q9Y6D6 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
ARFGEF1Q9Y6D6 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
ARFGEF1Q9Y6D6 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC24.39■■□□□ 1.49
ARFGEF1Q9Y6D6 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
ARFGEF1Q9Y6D6 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
ARFGEF1Q9Y6D6 PPHLN1-213ENST00000549190 1777 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
ARFGEF1Q9Y6D6 SERPINH1-212ENST00000530284 1358 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
ARFGEF1Q9Y6D6 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
ARFGEF1Q9Y6D6 ACY1-206ENST00000476351 1409 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
ARFGEF1Q9Y6D6 YDJC-201ENST00000292778 1351 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
ARFGEF1Q9Y6D6 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC24.38■■□□□ 1.49
ARFGEF1Q9Y6D6 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
ARFGEF1Q9Y6D6 NAT6-202ENST00000417393 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
ARFGEF1Q9Y6D6 PRAP1-202ENST00000463201 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
ARFGEF1Q9Y6D6 LCN10-205ENST00000497771 723 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
ARFGEF1Q9Y6D6 ANKRD34C-AS1-201ENST00000557790 594 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
ARFGEF1Q9Y6D6 AP000692.2-201ENST00000608391 879 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
ARFGEF1Q9Y6D6 mascRNA-menRNA.2-201ENST00000616984 58 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
ARFGEF1Q9Y6D6 AC131212.4-201ENST00000623606 975 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
ARFGEF1Q9Y6D6 SPACA6-213ENST00000637797 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
ARFGEF1Q9Y6D6 AC116562.4-202ENST00000641738 218 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
ARFGEF1Q9Y6D6 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
ARFGEF1Q9Y6D6 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
ARFGEF1Q9Y6D6 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
ARFGEF1Q9Y6D6 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
ARFGEF1Q9Y6D6 SLC25A39-202ENST00000377095 1565 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
ARFGEF1Q9Y6D6 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
ARFGEF1Q9Y6D6 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
ARFGEF1Q9Y6D6 OR10H5-201ENST00000308940 1132 ntAPPRIS P1 BASIC24.37■■□□□ 1.49
ARFGEF1Q9Y6D6 AC037459.1-202ENST00000430850 531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.37■■□□□ 1.49
ARFGEF1Q9Y6D6 NDUFV2-AS1-203ENST00000608008 779 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
ARFGEF1Q9Y6D6 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
ARFGEF1Q9Y6D6 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
ARFGEF1Q9Y6D6 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
ARFGEF1Q9Y6D6 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
ARFGEF1Q9Y6D6 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
ARFGEF1Q9Y6D6 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
ARFGEF1Q9Y6D6 KRTAP5-3-201ENST00000399685 899 ntAPPRIS P1 BASIC24.36■■□□□ 1.49
ARFGEF1Q9Y6D6 DECR2-202ENST00000424398 1012 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
ARFGEF1Q9Y6D6 AC008763.3-201ENST00000597959 777 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.36■■□□□ 1.49
ARFGEF1Q9Y6D6 AC011558.1-201ENST00000623459 338 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
ARFGEF1Q9Y6D6 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
ARFGEF1Q9Y6D6 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
ARFGEF1Q9Y6D6 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
ARFGEF1Q9Y6D6 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
ARFGEF1Q9Y6D6 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
ARFGEF1Q9Y6D6 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
ARFGEF1Q9Y6D6 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
ARFGEF1Q9Y6D6 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
ARFGEF1Q9Y6D6 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
ARFGEF1Q9Y6D6 PDLIM4-202ENST00000379018 1006 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
ARFGEF1Q9Y6D6 AC008738.3-201ENST00000589932 659 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
ARFGEF1Q9Y6D6 GPX4-210ENST00000611653 793 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
ARFGEF1Q9Y6D6 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
ARFGEF1Q9Y6D6 ZMYM5-202ENST00000382905 1382 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
ARFGEF1Q9Y6D6 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
ARFGEF1Q9Y6D6 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
ARFGEF1Q9Y6D6 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
ARFGEF1Q9Y6D6 INS-201ENST00000250971 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
ARFGEF1Q9Y6D6 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
ARFGEF1Q9Y6D6 SLX1A-202ENST00000345535 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
ARFGEF1Q9Y6D6 SLX1B-202ENST00000351581 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
ARFGEF1Q9Y6D6 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
ARFGEF1Q9Y6D6 CCDC124-201ENST00000445755 938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
ARFGEF1Q9Y6D6 HOMER2P1-201ENST00000455653 964 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
ARFGEF1Q9Y6D6 ASH1L-AS1-202ENST00000456633 911 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
ARFGEF1Q9Y6D6 CCNG1-211ENST00000512163 919 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
ARFGEF1Q9Y6D6 CSRP1-214ENST00000531916 890 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
ARFGEF1Q9Y6D6 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
ARFGEF1Q9Y6D6 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
ARFGEF1Q9Y6D6 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
ARFGEF1Q9Y6D6 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
ARFGEF1Q9Y6D6 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
ARFGEF1Q9Y6D6 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
ARFGEF1Q9Y6D6 CYP2D6-201ENST00000359033 1433 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
ARFGEF1Q9Y6D6 KRT8P10-201ENST00000450021 1447 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
ARFGEF1Q9Y6D6 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
ARFGEF1Q9Y6D6 GPX4-201ENST00000354171 919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25 ms