Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5T5

USP16, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 16, humanhuman

Predictions only

Length 823 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP16Q9Y5T5 ATP6V0E1-204ENST00000519911 718 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
USP16Q9Y5T5 AC004803.1-203ENST00000539259 501 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
USP16Q9Y5T5 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
USP16Q9Y5T5 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
USP16Q9Y5T5 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
USP16Q9Y5T5 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
USP16Q9Y5T5 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
USP16Q9Y5T5 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
USP16Q9Y5T5 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
USP16Q9Y5T5 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
USP16Q9Y5T5 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
USP16Q9Y5T5 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
USP16Q9Y5T5 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
USP16Q9Y5T5 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
USP16Q9Y5T5 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
USP16Q9Y5T5 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
USP16Q9Y5T5 METTL21A-201ENST00000272839 1210 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
USP16Q9Y5T5 SNAPIN-201ENST00000368685 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
USP16Q9Y5T5 AL162231.1-203ENST00000416454 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
USP16Q9Y5T5 AC027682.4-201ENST00000605277 798 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
USP16Q9Y5T5 MIR6786-201ENST00000616843 113 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
USP16Q9Y5T5 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
USP16Q9Y5T5 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.65
USP16Q9Y5T5 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
USP16Q9Y5T5 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
USP16Q9Y5T5 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.65
USP16Q9Y5T5 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
USP16Q9Y5T5 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.65
USP16Q9Y5T5 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
USP16Q9Y5T5 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
USP16Q9Y5T5 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
USP16Q9Y5T5 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
USP16Q9Y5T5 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC25.38■■□□□ 1.65
USP16Q9Y5T5 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
USP16Q9Y5T5 AL390955.1-201ENST00000428694 934 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
USP16Q9Y5T5 Z98884.1-201ENST00000451646 830 ntTSL 3 BASIC25.38■■□□□ 1.65
USP16Q9Y5T5 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
USP16Q9Y5T5 CYP2D8P-201ENST00000433633 1490 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
USP16Q9Y5T5 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
USP16Q9Y5T5 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
USP16Q9Y5T5 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
USP16Q9Y5T5 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
USP16Q9Y5T5 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
USP16Q9Y5T5 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
USP16Q9Y5T5 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
USP16Q9Y5T5 IFI6-201ENST00000339145 822 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
USP16Q9Y5T5 MLLT10-205ENST00000377100 1136 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
USP16Q9Y5T5 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
USP16Q9Y5T5 LINC01122-201ENST00000422723 675 ntTSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
USP16Q9Y5T5 BAALC-AS1-207ENST00000522856 594 ntTSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
USP16Q9Y5T5 NCAM1-AS1-201ENST00000526229 1081 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
USP16Q9Y5T5 OAF-202ENST00000531220 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
USP16Q9Y5T5 TK2-213ENST00000563369 882 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
USP16Q9Y5T5 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
USP16Q9Y5T5 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
USP16Q9Y5T5 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
USP16Q9Y5T5 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
USP16Q9Y5T5 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
USP16Q9Y5T5 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
USP16Q9Y5T5 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
USP16Q9Y5T5 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
USP16Q9Y5T5 IGFBP7-AS1-201ENST00000499667 1389 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
USP16Q9Y5T5 HIST2H2AB-201ENST00000331128 393 ntAPPRIS P1 BASIC25.36■■□□□ 1.65
USP16Q9Y5T5 BEX3-204ENST00000372645 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
USP16Q9Y5T5 C1QL1P1-201ENST00000568105 661 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
USP16Q9Y5T5 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC25.36■■□□□ 1.65
USP16Q9Y5T5 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
USP16Q9Y5T5 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
USP16Q9Y5T5 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
USP16Q9Y5T5 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
USP16Q9Y5T5 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
USP16Q9Y5T5 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
USP16Q9Y5T5 RHOC-204ENST00000369633 1295 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
USP16Q9Y5T5 MESTP1-201ENST00000404287 994 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
USP16Q9Y5T5 COQ10B-203ENST00000409398 879 ntTSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
USP16Q9Y5T5 UNC5B-AS1-201ENST00000447119 647 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
USP16Q9Y5T5 GCHFR-205ENST00000559932 695 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
USP16Q9Y5T5 AC145285.6-201ENST00000604632 637 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
USP16Q9Y5T5 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
USP16Q9Y5T5 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
USP16Q9Y5T5 ABBA01031674.1-201ENST00000635145 728 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
USP16Q9Y5T5 GLDC-219ENST00000640208 420 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
USP16Q9Y5T5 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
USP16Q9Y5T5 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
USP16Q9Y5T5 NFKBIL1-201ENST00000376145 1401 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
USP16Q9Y5T5 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
USP16Q9Y5T5 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
USP16Q9Y5T5 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
USP16Q9Y5T5 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
USP16Q9Y5T5 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
USP16Q9Y5T5 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
USP16Q9Y5T5 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
USP16Q9Y5T5 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
USP16Q9Y5T5 CEMP1-202ENST00000567119 1374 ntAPPRIS P2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
USP16Q9Y5T5 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
USP16Q9Y5T5 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC25.34■■□□□ 1.65
USP16Q9Y5T5 RN7SL850P-201ENST00000579959 291 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
USP16Q9Y5T5 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
USP16Q9Y5T5 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
USP16Q9Y5T5 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.6 ms