Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y376

CAB39, Calcium-binding protein 39, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 341 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAB39Q9Y376 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CAB39Q9Y376 NOMO3-202ENST00000399336 4356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CAB39Q9Y376 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CAB39Q9Y376 ITGA8-201ENST00000378076 6755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CAB39Q9Y376 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
CAB39Q9Y376 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CAB39Q9Y376 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CAB39Q9Y376 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
CAB39Q9Y376 KIAA1522-202ENST00000373480 5294 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CAB39Q9Y376 KIAA1522-203ENST00000373481 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CAB39Q9Y376 GPRC5B-201ENST00000300571 5213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CAB39Q9Y376 TMEM214-201ENST00000238788 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CAB39Q9Y376 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CAB39Q9Y376 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CAB39Q9Y376 ASXL1-212ENST00000620121 5374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CAB39Q9Y376 MZF1-206ENST00000599369 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CAB39Q9Y376 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CAB39Q9Y376 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CAB39Q9Y376 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CAB39Q9Y376 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CAB39Q9Y376 ADAMTS8-201ENST00000257359 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CAB39Q9Y376 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CAB39Q9Y376 GTF2IP4-202ENST00000544802 3609 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CAB39Q9Y376 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CAB39Q9Y376 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CAB39Q9Y376 MAP3K6-207ENST00000493901 4309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CAB39Q9Y376 URI1-202ENST00000392271 3444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CAB39Q9Y376 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CAB39Q9Y376 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CAB39Q9Y376 ATP2A3-201ENST00000309890 4826 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CAB39Q9Y376 MSL1-202ENST00000398532 4707 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CAB39Q9Y376 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CAB39Q9Y376 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CAB39Q9Y376 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CAB39Q9Y376 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CAB39Q9Y376 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CAB39Q9Y376 AC093503.3-201ENST00000624917 2352 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
CAB39Q9Y376 SNAI3-AS1-202ENST00000563475 2081 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CAB39Q9Y376 SMG5-201ENST00000361813 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CAB39Q9Y376 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CAB39Q9Y376 DIAPH2-205ENST00000373061 4983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CAB39Q9Y376 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CAB39Q9Y376 LEMD2-214ENST00000614475 2883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CAB39Q9Y376 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CAB39Q9Y376 AHSA2-202ENST00000394457 6574 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CAB39Q9Y376 DOC2B-203ENST00000613549 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CAB39Q9Y376 KLHL17-201ENST00000338591 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CAB39Q9Y376 SLC3A2-206ENST00000535296 2084 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CAB39Q9Y376 LUC7L2-210ENST00000619796 2783 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CAB39Q9Y376 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CAB39Q9Y376 KIF21B-203ENST00000422435 5519 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CAB39Q9Y376 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CAB39Q9Y376 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CAB39Q9Y376 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CAB39Q9Y376 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CAB39Q9Y376 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CAB39Q9Y376 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CAB39Q9Y376 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CAB39Q9Y376 RGS9BP-201ENST00000334176 2894 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CAB39Q9Y376 EPB41L4B-201ENST00000374557 4006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CAB39Q9Y376 SYNPO-201ENST00000307662 5374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CAB39Q9Y376 LTB4R2-202ENST00000528054 3092 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
CAB39Q9Y376 IQSEC2-202ENST00000396435 6015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CAB39Q9Y376 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CAB39Q9Y376 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CAB39Q9Y376 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CAB39Q9Y376 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CAB39Q9Y376 ETS1-208ENST00000535549 4594 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CAB39Q9Y376 CABP7-201ENST00000216144 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CAB39Q9Y376 CROCC2-201ENST00000443866 5382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CAB39Q9Y376 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CAB39Q9Y376 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
CAB39Q9Y376 CACNA1A-253ENST00000637927 6847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CAB39Q9Y376 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CAB39Q9Y376 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CAB39Q9Y376 SGSM2-201ENST00000268989 4863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CAB39Q9Y376 PTH2R-204ENST00000617735 2472 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CAB39Q9Y376 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CAB39Q9Y376 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
CAB39Q9Y376 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CAB39Q9Y376 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
CAB39Q9Y376 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CAB39Q9Y376 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CAB39Q9Y376 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CAB39Q9Y376 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CAB39Q9Y376 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
CAB39Q9Y376 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CAB39Q9Y376 ALDH5A1-202ENST00000357578 5248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CAB39Q9Y376 ZNF512B-201ENST00000369888 5919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CAB39Q9Y376 AC069544.2-201ENST00000640019 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CAB39Q9Y376 ARNT-212ENST00000515192 2892 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CAB39Q9Y376 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CAB39Q9Y376 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CAB39Q9Y376 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CAB39Q9Y376 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CAB39Q9Y376 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CAB39Q9Y376 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CAB39Q9Y376 ZNF710-201ENST00000268154 4617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CAB39Q9Y376 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CAB39Q9Y376 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.1 ms