Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPV9

TRAK1, Trafficking kinesin-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 953 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAK1Q9UPV9 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
TRAK1Q9UPV9 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
TRAK1Q9UPV9 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
TRAK1Q9UPV9 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
TRAK1Q9UPV9 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
TRAK1Q9UPV9 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
TRAK1Q9UPV9 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
TRAK1Q9UPV9 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
TRAK1Q9UPV9 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
TRAK1Q9UPV9 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
TRAK1Q9UPV9 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
TRAK1Q9UPV9 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
TRAK1Q9UPV9 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
TRAK1Q9UPV9 COQ10B-203ENST00000409398 879 ntTSL 3 BASIC27.84■■■□□ 2.05
TRAK1Q9UPV9 BAALC-AS1-207ENST00000522856 594 ntTSL 3 BASIC27.84■■■□□ 2.05
TRAK1Q9UPV9 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
TRAK1Q9UPV9 GCHFR-205ENST00000559932 695 ntTSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
TRAK1Q9UPV9 ABBA01031674.1-201ENST00000635145 728 ntBASIC27.84■■■□□ 2.05
TRAK1Q9UPV9 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
TRAK1Q9UPV9 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
TRAK1Q9UPV9 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
TRAK1Q9UPV9 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
TRAK1Q9UPV9 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
TRAK1Q9UPV9 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
TRAK1Q9UPV9 SELENOF-203ENST00000401030 727 ntTSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
TRAK1Q9UPV9 MESTP1-201ENST00000404287 994 ntBASIC27.83■■■□□ 2.05
TRAK1Q9UPV9 NDUFA13-201ENST00000428459 576 ntTSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
TRAK1Q9UPV9 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
TRAK1Q9UPV9 AZIN1-AS1-215ENST00000522939 644 ntTSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
TRAK1Q9UPV9 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC27.83■■■□□ 2.05
TRAK1Q9UPV9 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
TRAK1Q9UPV9 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
TRAK1Q9UPV9 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
TRAK1Q9UPV9 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
TRAK1Q9UPV9 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
TRAK1Q9UPV9 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
TRAK1Q9UPV9 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
TRAK1Q9UPV9 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
TRAK1Q9UPV9 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
TRAK1Q9UPV9 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
TRAK1Q9UPV9 AC009487.1-202ENST00000437683 402 ntTSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
TRAK1Q9UPV9 AP001059.1-201ENST00000442785 523 ntTSL 3 BASIC27.82■■■□□ 2.04
TRAK1Q9UPV9 SLC39A11-207ENST00000579732 1004 ntTSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
TRAK1Q9UPV9 DEDD2-209ENST00000598727 1037 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
TRAK1Q9UPV9 AC010947.1-201ENST00000623454 693 ntBASIC27.82■■■□□ 2.04
TRAK1Q9UPV9 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
TRAK1Q9UPV9 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
TRAK1Q9UPV9 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
TRAK1Q9UPV9 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
TRAK1Q9UPV9 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
TRAK1Q9UPV9 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
TRAK1Q9UPV9 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
TRAK1Q9UPV9 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
TRAK1Q9UPV9 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
TRAK1Q9UPV9 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
TRAK1Q9UPV9 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
TRAK1Q9UPV9 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
TRAK1Q9UPV9 AL158152.2-201ENST00000602703 235 ntTSL 3 BASIC27.81■■■□□ 2.04
TRAK1Q9UPV9 KANK3-205ENST00000610351 1191 ntTSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
TRAK1Q9UPV9 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
TRAK1Q9UPV9 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
TRAK1Q9UPV9 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
TRAK1Q9UPV9 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
TRAK1Q9UPV9 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
TRAK1Q9UPV9 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
TRAK1Q9UPV9 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
TRAK1Q9UPV9 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
TRAK1Q9UPV9 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
TRAK1Q9UPV9 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
TRAK1Q9UPV9 ING1-202ENST00000338450 1189 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
TRAK1Q9UPV9 PMF1-BGLAP-202ENST00000368276 852 ntTSL 3 BASIC27.8■■■□□ 2.04
TRAK1Q9UPV9 LCN8-201ENST00000371688 867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
TRAK1Q9UPV9 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
TRAK1Q9UPV9 FBXO32-202ENST00000443022 1227 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
TRAK1Q9UPV9 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC27.8■■■□□ 2.04
TRAK1Q9UPV9 NEURL1B-202ENST00000520919 1089 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
TRAK1Q9UPV9 AL031600.3-201ENST00000566287 1124 ntTSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
TRAK1Q9UPV9 P4HB-223ENST00000576390 439 ntTSL 4 BASIC27.8■■■□□ 2.04
TRAK1Q9UPV9 AC006942.1-201ENST00000600669 520 ntTSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
TRAK1Q9UPV9 LINC01568-207ENST00000641790 1380 ntBASIC27.8■■■□□ 2.04
TRAK1Q9UPV9 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
TRAK1Q9UPV9 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
TRAK1Q9UPV9 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
TRAK1Q9UPV9 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
TRAK1Q9UPV9 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
TRAK1Q9UPV9 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
TRAK1Q9UPV9 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
TRAK1Q9UPV9 BTBD1-202ENST00000379403 1467 ntTSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
TRAK1Q9UPV9 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
TRAK1Q9UPV9 AC005521.1-201ENST00000393351 872 ntBASIC27.79■■■□□ 2.04
TRAK1Q9UPV9 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC27.79■■■□□ 2.04
TRAK1Q9UPV9 PPP1R14BP5-201ENST00000440334 435 ntBASIC27.79■■■□□ 2.04
TRAK1Q9UPV9 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC27.79■■■□□ 2.04
TRAK1Q9UPV9 AL109797.1-201ENST00000452501 835 ntTSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
TRAK1Q9UPV9 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC27.79■■■□□ 2.04
TRAK1Q9UPV9 DUT-205ENST00000558813 769 ntTSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
TRAK1Q9UPV9 AL031985.4-201ENST00000642138 673 ntBASIC27.79■■■□□ 2.04
TRAK1Q9UPV9 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
TRAK1Q9UPV9 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
TRAK1Q9UPV9 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.7 ms