Protein–RNA interactions for Protein: Q9UNY4

TTF2, Transcription termination factor 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,162 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTF2Q9UNY4 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
TTF2Q9UNY4 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
TTF2Q9UNY4 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
TTF2Q9UNY4 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
TTF2Q9UNY4 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
TTF2Q9UNY4 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
TTF2Q9UNY4 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
TTF2Q9UNY4 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
TTF2Q9UNY4 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
TTF2Q9UNY4 AC116562.2-201ENST00000507042 360 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
TTF2Q9UNY4 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
TTF2Q9UNY4 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
TTF2Q9UNY4 GLDC-219ENST00000640208 420 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
TTF2Q9UNY4 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
TTF2Q9UNY4 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
TTF2Q9UNY4 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
TTF2Q9UNY4 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
TTF2Q9UNY4 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
TTF2Q9UNY4 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
TTF2Q9UNY4 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
TTF2Q9UNY4 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
TTF2Q9UNY4 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
TTF2Q9UNY4 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
TTF2Q9UNY4 CCT7-202ENST00000398422 1234 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
TTF2Q9UNY4 CACYBP-202ENST00000405362 1059 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
TTF2Q9UNY4 AL390955.1-201ENST00000428694 934 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
TTF2Q9UNY4 AC103855.2-201ENST00000533315 573 ntTSL 4 BASIC23.9■■□□□ 1.42
TTF2Q9UNY4 AC100839.1-201ENST00000559589 577 ntTSL 4 BASIC23.9■■□□□ 1.42
TTF2Q9UNY4 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
TTF2Q9UNY4 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
TTF2Q9UNY4 NFKBIL1-201ENST00000376145 1401 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
TTF2Q9UNY4 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
TTF2Q9UNY4 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
TTF2Q9UNY4 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
TTF2Q9UNY4 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
TTF2Q9UNY4 METTL21A-201ENST00000272839 1210 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
TTF2Q9UNY4 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
TTF2Q9UNY4 LCN8-201ENST00000371688 867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
TTF2Q9UNY4 LINC01122-201ENST00000422723 675 ntTSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.41
TTF2Q9UNY4 AC009487.1-202ENST00000437683 402 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
TTF2Q9UNY4 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
TTF2Q9UNY4 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
TTF2Q9UNY4 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
TTF2Q9UNY4 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
TTF2Q9UNY4 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
TTF2Q9UNY4 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
TTF2Q9UNY4 IGFBP7-AS1-201ENST00000499667 1389 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
TTF2Q9UNY4 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
TTF2Q9UNY4 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
TTF2Q9UNY4 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
TTF2Q9UNY4 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
TTF2Q9UNY4 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
TTF2Q9UNY4 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
TTF2Q9UNY4 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
TTF2Q9UNY4 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
TTF2Q9UNY4 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
TTF2Q9UNY4 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
TTF2Q9UNY4 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
TTF2Q9UNY4 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
TTF2Q9UNY4 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
TTF2Q9UNY4 UNC5B-AS1-201ENST00000447119 647 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
TTF2Q9UNY4 Z98884.1-201ENST00000451646 830 ntTSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
TTF2Q9UNY4 NCAM1-AS1-201ENST00000526229 1081 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
TTF2Q9UNY4 AC004803.1-203ENST00000539259 501 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
TTF2Q9UNY4 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
TTF2Q9UNY4 SLC39A11-207ENST00000579732 1004 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
TTF2Q9UNY4 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
TTF2Q9UNY4 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
TTF2Q9UNY4 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
TTF2Q9UNY4 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
TTF2Q9UNY4 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.87■■□□□ 1.41
TTF2Q9UNY4 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
TTF2Q9UNY4 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
TTF2Q9UNY4 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
TTF2Q9UNY4 SELENOF-203ENST00000401030 727 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
TTF2Q9UNY4 AL954642.1-201ENST00000428088 538 ntTSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
TTF2Q9UNY4 NDUFA13-201ENST00000428459 576 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
TTF2Q9UNY4 TGIF1-222ENST00000577543 729 ntTSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
TTF2Q9UNY4 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
TTF2Q9UNY4 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
TTF2Q9UNY4 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
TTF2Q9UNY4 BTBD1-202ENST00000379403 1467 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
TTF2Q9UNY4 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
TTF2Q9UNY4 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
TTF2Q9UNY4 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
TTF2Q9UNY4 C1QL1P1-201ENST00000568105 661 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
TTF2Q9UNY4 DEDD2-209ENST00000598727 1037 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
TTF2Q9UNY4 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
TTF2Q9UNY4 AC005363.2-201ENST00000618631 242 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
TTF2Q9UNY4 CEMP1-202ENST00000567119 1374 ntAPPRIS P2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
TTF2Q9UNY4 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
TTF2Q9UNY4 CYP2D8P-201ENST00000433633 1490 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
TTF2Q9UNY4 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
TTF2Q9UNY4 AC116351.2-201ENST00000606540 1585 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
TTF2Q9UNY4 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
TTF2Q9UNY4 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
TTF2Q9UNY4 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
TTF2Q9UNY4 HIST2H2AB-201ENST00000331128 393 ntAPPRIS P1 BASIC23.85■■□□□ 1.41
TTF2Q9UNY4 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
TTF2Q9UNY4 RHOC-204ENST00000369633 1295 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.6 ms