Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHX1

PUF60, Poly(U)-binding-splicing factor PUF60, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 559 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PUF60Q9UHX1 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PUF60Q9UHX1 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PUF60Q9UHX1 ADGRG2-210ENST00000379878 4803 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
PUF60Q9UHX1 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
PUF60Q9UHX1 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
PUF60Q9UHX1 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
PUF60Q9UHX1 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
PUF60Q9UHX1 RIMBP3-201ENST00000619918 6105 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.14
PUF60Q9UHX1 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PUF60Q9UHX1 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PUF60Q9UHX1 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PUF60Q9UHX1 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.13
PUF60Q9UHX1 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
PUF60Q9UHX1 GALNT13-201ENST00000392825 5536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
PUF60Q9UHX1 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
PUF60Q9UHX1 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
PUF60Q9UHX1 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
PUF60Q9UHX1 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PUF60Q9UHX1 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PUF60Q9UHX1 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC22.14■■□□□ 1.13
PUF60Q9UHX1 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PUF60Q9UHX1 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
PUF60Q9UHX1 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
PUF60Q9UHX1 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PUF60Q9UHX1 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PUF60Q9UHX1 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PUF60Q9UHX1 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PUF60Q9UHX1 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PUF60Q9UHX1 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PUF60Q9UHX1 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PUF60Q9UHX1 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PUF60Q9UHX1 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PUF60Q9UHX1 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PUF60Q9UHX1 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PUF60Q9UHX1 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PUF60Q9UHX1 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PUF60Q9UHX1 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PUF60Q9UHX1 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PUF60Q9UHX1 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PUF60Q9UHX1 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PUF60Q9UHX1 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PUF60Q9UHX1 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PUF60Q9UHX1 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PUF60Q9UHX1 AL020996.1-203ENST00000536896 2307 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
PUF60Q9UHX1 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PUF60Q9UHX1 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PUF60Q9UHX1 NECTIN1-201ENST00000264025 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PUF60Q9UHX1 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PUF60Q9UHX1 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PUF60Q9UHX1 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PUF60Q9UHX1 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PUF60Q9UHX1 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PUF60Q9UHX1 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PUF60Q9UHX1 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PUF60Q9UHX1 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PUF60Q9UHX1 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PUF60Q9UHX1 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PUF60Q9UHX1 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PUF60Q9UHX1 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PUF60Q9UHX1 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PUF60Q9UHX1 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PUF60Q9UHX1 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PUF60Q9UHX1 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PUF60Q9UHX1 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PUF60Q9UHX1 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
PUF60Q9UHX1 C1QTNF1-201ENST00000311661 2624 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PUF60Q9UHX1 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PUF60Q9UHX1 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PUF60Q9UHX1 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PUF60Q9UHX1 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PUF60Q9UHX1 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PUF60Q9UHX1 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PUF60Q9UHX1 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PUF60Q9UHX1 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
PUF60Q9UHX1 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PUF60Q9UHX1 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PUF60Q9UHX1 CDKN2C-201ENST00000262662 2904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PUF60Q9UHX1 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PUF60Q9UHX1 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PUF60Q9UHX1 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PUF60Q9UHX1 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PUF60Q9UHX1 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PUF60Q9UHX1 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PUF60Q9UHX1 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PUF60Q9UHX1 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PUF60Q9UHX1 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PUF60Q9UHX1 INSR-201ENST00000302850 4721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PUF60Q9UHX1 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PUF60Q9UHX1 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PUF60Q9UHX1 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PUF60Q9UHX1 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PUF60Q9UHX1 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PUF60Q9UHX1 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PUF60Q9UHX1 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PUF60Q9UHX1 YKT6-207ENST00000496112 1270 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PUF60Q9UHX1 DEUP1-206ENST00000530273 410 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PUF60Q9UHX1 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PUF60Q9UHX1 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PUF60Q9UHX1 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PUF60Q9UHX1 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.6 ms