Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBV8

PEF1, Peflin, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 284 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PEF1Q9UBV8 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PEF1Q9UBV8 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PEF1Q9UBV8 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PEF1Q9UBV8 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PEF1Q9UBV8 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PEF1Q9UBV8 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PEF1Q9UBV8 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PEF1Q9UBV8 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PEF1Q9UBV8 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PEF1Q9UBV8 WWC3-201ENST00000380861 6647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PEF1Q9UBV8 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PEF1Q9UBV8 EVX2-201ENST00000308618 4203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PEF1Q9UBV8 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PEF1Q9UBV8 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PEF1Q9UBV8 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PEF1Q9UBV8 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PEF1Q9UBV8 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PEF1Q9UBV8 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PEF1Q9UBV8 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PEF1Q9UBV8 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PEF1Q9UBV8 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PEF1Q9UBV8 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PEF1Q9UBV8 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
PEF1Q9UBV8 DCBLD2-201ENST00000326840 6122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PEF1Q9UBV8 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PEF1Q9UBV8 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PEF1Q9UBV8 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PEF1Q9UBV8 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PEF1Q9UBV8 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PEF1Q9UBV8 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PEF1Q9UBV8 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PEF1Q9UBV8 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PEF1Q9UBV8 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PEF1Q9UBV8 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PEF1Q9UBV8 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PEF1Q9UBV8 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PEF1Q9UBV8 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PEF1Q9UBV8 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
PEF1Q9UBV8 AC026471.1-201ENST00000564629 3026 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
PEF1Q9UBV8 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PEF1Q9UBV8 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PEF1Q9UBV8 BMP1-202ENST00000306385 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PEF1Q9UBV8 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
PEF1Q9UBV8 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PEF1Q9UBV8 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PEF1Q9UBV8 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PEF1Q9UBV8 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PEF1Q9UBV8 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PEF1Q9UBV8 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PEF1Q9UBV8 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PEF1Q9UBV8 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PEF1Q9UBV8 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PEF1Q9UBV8 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PEF1Q9UBV8 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PEF1Q9UBV8 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PEF1Q9UBV8 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
PEF1Q9UBV8 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
PEF1Q9UBV8 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PEF1Q9UBV8 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
PEF1Q9UBV8 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PEF1Q9UBV8 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PEF1Q9UBV8 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PEF1Q9UBV8 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PEF1Q9UBV8 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
PEF1Q9UBV8 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PEF1Q9UBV8 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
PEF1Q9UBV8 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
PEF1Q9UBV8 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PEF1Q9UBV8 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PEF1Q9UBV8 PTPRE-201ENST00000254667 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PEF1Q9UBV8 MRC2-201ENST00000303375 5988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PEF1Q9UBV8 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PEF1Q9UBV8 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PEF1Q9UBV8 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PEF1Q9UBV8 SCRIB-201ENST00000320476 5143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PEF1Q9UBV8 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PEF1Q9UBV8 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PEF1Q9UBV8 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PEF1Q9UBV8 AZIN1-201ENST00000337198 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PEF1Q9UBV8 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PEF1Q9UBV8 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PEF1Q9UBV8 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PEF1Q9UBV8 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PEF1Q9UBV8 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PEF1Q9UBV8 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PEF1Q9UBV8 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PEF1Q9UBV8 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PEF1Q9UBV8 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PEF1Q9UBV8 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PEF1Q9UBV8 LTBP4-201ENST00000204005 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PEF1Q9UBV8 NUP153-202ENST00000537253 6030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PEF1Q9UBV8 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PEF1Q9UBV8 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PEF1Q9UBV8 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PEF1Q9UBV8 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PEF1Q9UBV8 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PEF1Q9UBV8 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PEF1Q9UBV8 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PEF1Q9UBV8 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
PEF1Q9UBV8 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.8 ms