Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2E7

PCDH10, Protocadherin-10, humanhuman

Predictions only

Length 1,040 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCDH10Q9P2E7 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PCDH10Q9P2E7 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PCDH10Q9P2E7 ABCD1-202ENST00000370129 1016 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PCDH10Q9P2E7 C2orf82-202ENST00000409230 663 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PCDH10Q9P2E7 SATB1-AS1-201ENST00000414198 737 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PCDH10Q9P2E7 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
PCDH10Q9P2E7 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PCDH10Q9P2E7 DUX4-205ENST00000570263 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PCDH10Q9P2E7 ZNF324B-203ENST00000594214 564 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PCDH10Q9P2E7 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PCDH10Q9P2E7 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PCDH10Q9P2E7 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PCDH10Q9P2E7 ELP5-204ENST00000396628 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PCDH10Q9P2E7 TRIM73-205ENST00000450434 1425 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PCDH10Q9P2E7 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PCDH10Q9P2E7 SCRN1-203ENST00000409570 535 ntTSL 4 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PCDH10Q9P2E7 ATP5G2P1-201ENST00000433580 426 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
PCDH10Q9P2E7 HRASLS5-205ENST00000539221 1167 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PCDH10Q9P2E7 AL512357.1-201ENST00000557687 518 ntTSL 4 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PCDH10Q9P2E7 KANK3-205ENST00000610351 1191 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PCDH10Q9P2E7 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PCDH10Q9P2E7 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PCDH10Q9P2E7 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PCDH10Q9P2E7 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PCDH10Q9P2E7 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PCDH10Q9P2E7 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PCDH10Q9P2E7 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PCDH10Q9P2E7 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PCDH10Q9P2E7 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PCDH10Q9P2E7 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PCDH10Q9P2E7 PAFAH1B3-201ENST00000262890 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PCDH10Q9P2E7 GRM5-203ENST00000393294 1268 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PCDH10Q9P2E7 CCT7-202ENST00000398422 1234 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PCDH10Q9P2E7 MSRB1-202ENST00000399753 847 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PCDH10Q9P2E7 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PCDH10Q9P2E7 STMN4-207ENST00000523048 1224 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PCDH10Q9P2E7 AL160237.2-201ENST00000556165 472 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
PCDH10Q9P2E7 AC097662.2-201ENST00000641359 267 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PCDH10Q9P2E7 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PCDH10Q9P2E7 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PCDH10Q9P2E7 ETV2-204ENST00000403402 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PCDH10Q9P2E7 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PCDH10Q9P2E7 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PCDH10Q9P2E7 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PCDH10Q9P2E7 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PCDH10Q9P2E7 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PCDH10Q9P2E7 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
PCDH10Q9P2E7 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PCDH10Q9P2E7 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
PCDH10Q9P2E7 GGCT-202ENST00000275428 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PCDH10Q9P2E7 SDR39U1-201ENST00000399395 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PCDH10Q9P2E7 POLR2D-202ENST00000409698 806 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
PCDH10Q9P2E7 TSPY5P-201ENST00000426936 936 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
PCDH10Q9P2E7 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PCDH10Q9P2E7 C17orf49-208ENST00000552402 760 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
PCDH10Q9P2E7 ELAC2-212ENST00000578071 579 ntTSL 4 BASIC21.96■■□□□ 1.11
PCDH10Q9P2E7 MIR3652-201ENST00000579335 131 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
PCDH10Q9P2E7 AC011455.1-201ENST00000593830 504 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
PCDH10Q9P2E7 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
PCDH10Q9P2E7 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PCDH10Q9P2E7 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PCDH10Q9P2E7 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
PCDH10Q9P2E7 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC21.95■■□□□ 1.11
PCDH10Q9P2E7 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
PCDH10Q9P2E7 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PCDH10Q9P2E7 PMVK-201ENST00000368467 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PCDH10Q9P2E7 YBX1P2-201ENST00000489612 999 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
PCDH10Q9P2E7 ATP6V0E1-204ENST00000519911 718 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
PCDH10Q9P2E7 TPGS2-221ENST00000614939 1268 ntTSL 4 BASIC21.95■■□□□ 1.1
PCDH10Q9P2E7 BX640515.1-201ENST00000617215 977 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
PCDH10Q9P2E7 SPACA6-213ENST00000637797 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PCDH10Q9P2E7 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PCDH10Q9P2E7 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PCDH10Q9P2E7 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PCDH10Q9P2E7 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PCDH10Q9P2E7 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PCDH10Q9P2E7 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
PCDH10Q9P2E7 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
PCDH10Q9P2E7 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
PCDH10Q9P2E7 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PCDH10Q9P2E7 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PCDH10Q9P2E7 TSPY14P-201ENST00000303979 915 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
PCDH10Q9P2E7 NECTIN1-202ENST00000340882 1059 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PCDH10Q9P2E7 MIR564-202ENST00000385049 94 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
PCDH10Q9P2E7 B3GAT3P1-201ENST00000471720 806 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
PCDH10Q9P2E7 SNCB-205ENST00000510387 730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
PCDH10Q9P2E7 AC098864.1-204ENST00000513752 805 ntTSL 4 BASIC21.94■■□□□ 1.1
PCDH10Q9P2E7 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
PCDH10Q9P2E7 RAB2A-211ENST00000531289 1058 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
PCDH10Q9P2E7 ORAOV1-210ENST00000539414 817 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
PCDH10Q9P2E7 AC005332.1-201ENST00000577698 1310 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
PCDH10Q9P2E7 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
PCDH10Q9P2E7 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PCDH10Q9P2E7 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PCDH10Q9P2E7 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PCDH10Q9P2E7 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC21.93■■□□□ 1.1
PCDH10Q9P2E7 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
PCDH10Q9P2E7 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
PCDH10Q9P2E7 RABAC1-201ENST00000222008 821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
PCDH10Q9P2E7 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.4 ms