Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZI7

UBP1, Upstream-binding protein 1, humanhuman

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Length 540 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBP1Q9NZI7 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
UBP1Q9NZI7 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
UBP1Q9NZI7 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
UBP1Q9NZI7 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
UBP1Q9NZI7 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
UBP1Q9NZI7 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
UBP1Q9NZI7 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
UBP1Q9NZI7 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
UBP1Q9NZI7 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
UBP1Q9NZI7 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
UBP1Q9NZI7 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
UBP1Q9NZI7 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
UBP1Q9NZI7 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
UBP1Q9NZI7 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
UBP1Q9NZI7 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
UBP1Q9NZI7 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
UBP1Q9NZI7 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
UBP1Q9NZI7 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
UBP1Q9NZI7 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
UBP1Q9NZI7 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
UBP1Q9NZI7 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
UBP1Q9NZI7 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC20.2■□□□□ 0.82
UBP1Q9NZI7 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
UBP1Q9NZI7 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
UBP1Q9NZI7 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
UBP1Q9NZI7 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
UBP1Q9NZI7 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
UBP1Q9NZI7 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
UBP1Q9NZI7 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
UBP1Q9NZI7 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
UBP1Q9NZI7 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
UBP1Q9NZI7 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
UBP1Q9NZI7 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
UBP1Q9NZI7 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
UBP1Q9NZI7 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
UBP1Q9NZI7 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
UBP1Q9NZI7 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
UBP1Q9NZI7 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
UBP1Q9NZI7 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
UBP1Q9NZI7 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
UBP1Q9NZI7 PIGQ-206ENST00000422307 2052 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
UBP1Q9NZI7 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
UBP1Q9NZI7 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
UBP1Q9NZI7 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
UBP1Q9NZI7 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
UBP1Q9NZI7 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
UBP1Q9NZI7 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
UBP1Q9NZI7 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
UBP1Q9NZI7 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
UBP1Q9NZI7 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
UBP1Q9NZI7 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
UBP1Q9NZI7 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
UBP1Q9NZI7 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
UBP1Q9NZI7 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
UBP1Q9NZI7 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
UBP1Q9NZI7 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
UBP1Q9NZI7 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC20.18■□□□□ 0.82
UBP1Q9NZI7 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
UBP1Q9NZI7 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
UBP1Q9NZI7 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
UBP1Q9NZI7 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
UBP1Q9NZI7 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
UBP1Q9NZI7 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
UBP1Q9NZI7 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
UBP1Q9NZI7 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
UBP1Q9NZI7 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
UBP1Q9NZI7 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC20.18■□□□□ 0.82
UBP1Q9NZI7 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
UBP1Q9NZI7 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
UBP1Q9NZI7 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
UBP1Q9NZI7 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
UBP1Q9NZI7 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
UBP1Q9NZI7 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
UBP1Q9NZI7 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
UBP1Q9NZI7 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
UBP1Q9NZI7 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
UBP1Q9NZI7 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
UBP1Q9NZI7 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
UBP1Q9NZI7 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
UBP1Q9NZI7 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
UBP1Q9NZI7 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
UBP1Q9NZI7 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
UBP1Q9NZI7 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
UBP1Q9NZI7 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
UBP1Q9NZI7 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
UBP1Q9NZI7 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC20.17■□□□□ 0.82
UBP1Q9NZI7 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
UBP1Q9NZI7 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
UBP1Q9NZI7 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
UBP1Q9NZI7 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
UBP1Q9NZI7 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
UBP1Q9NZI7 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
UBP1Q9NZI7 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
UBP1Q9NZI7 QKI-201ENST00000275262 6964 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
UBP1Q9NZI7 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
UBP1Q9NZI7 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
UBP1Q9NZI7 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
UBP1Q9NZI7 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
UBP1Q9NZI7 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
UBP1Q9NZI7 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC20.16■□□□□ 0.82
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