Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYL9

TMOD3, Tropomodulin-3, humanhuman

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Length 352 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMOD3Q9NYL9 WWOX-216ENST00000569818 525 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
TMOD3Q9NYL9 AC087388.1-201ENST00000571370 1112 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
TMOD3Q9NYL9 AC103746.1-201ENST00000617440 1133 ntTSL 3 BASIC25.66■■□□□ 1.7
TMOD3Q9NYL9 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
TMOD3Q9NYL9 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
TMOD3Q9NYL9 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
TMOD3Q9NYL9 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
TMOD3Q9NYL9 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
TMOD3Q9NYL9 AP001922.1-201ENST00000499390 1504 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
TMOD3Q9NYL9 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
TMOD3Q9NYL9 LGALS8-AS1-201ENST00000487567 1457 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
TMOD3Q9NYL9 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
TMOD3Q9NYL9 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
TMOD3Q9NYL9 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
TMOD3Q9NYL9 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
TMOD3Q9NYL9 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
TMOD3Q9NYL9 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
TMOD3Q9NYL9 PSMD8-210ENST00000620216 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
TMOD3Q9NYL9 MIEN1-201ENST00000394231 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
TMOD3Q9NYL9 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
TMOD3Q9NYL9 AC131212.4-201ENST00000623606 975 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
TMOD3Q9NYL9 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
TMOD3Q9NYL9 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
TMOD3Q9NYL9 PLCG1-AS1-201ENST00000454626 1462 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
TMOD3Q9NYL9 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
TMOD3Q9NYL9 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
TMOD3Q9NYL9 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
TMOD3Q9NYL9 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
TMOD3Q9NYL9 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC25.64■■□□□ 1.7
TMOD3Q9NYL9 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
TMOD3Q9NYL9 RXFP4-201ENST00000368318 1240 ntAPPRIS P1 BASIC25.64■■□□□ 1.7
TMOD3Q9NYL9 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
TMOD3Q9NYL9 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
TMOD3Q9NYL9 TARBP2-220ENST00000552857 916 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
TMOD3Q9NYL9 GEMIN7-203ENST00000591607 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.64■■□□□ 1.7
TMOD3Q9NYL9 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
TMOD3Q9NYL9 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
TMOD3Q9NYL9 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC25.64■■□□□ 1.69
TMOD3Q9NYL9 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
TMOD3Q9NYL9 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
TMOD3Q9NYL9 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
TMOD3Q9NYL9 IMMP2L-202ENST00000405709 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
TMOD3Q9NYL9 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
TMOD3Q9NYL9 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
TMOD3Q9NYL9 DUSP23-203ENST00000368109 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
TMOD3Q9NYL9 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
TMOD3Q9NYL9 ERICH4-201ENST00000378187 946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
TMOD3Q9NYL9 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
TMOD3Q9NYL9 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
TMOD3Q9NYL9 AL513320.1-201ENST00000435049 622 ntTSL 3 BASIC25.63■■□□□ 1.69
TMOD3Q9NYL9 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
TMOD3Q9NYL9 CENPX-206ENST00000580435 710 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
TMOD3Q9NYL9 PRSS50-202ENST00000315170 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
TMOD3Q9NYL9 HS2ST1-202ENST00000370551 1585 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
TMOD3Q9NYL9 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
TMOD3Q9NYL9 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
TMOD3Q9NYL9 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
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TMOD3Q9NYL9 PBXIP1-201ENST00000368460 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.62■■□□□ 1.69
TMOD3Q9NYL9 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
TMOD3Q9NYL9 LY6E-211ENST00000521699 1256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
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TMOD3Q9NYL9 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
TMOD3Q9NYL9 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
TMOD3Q9NYL9 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
TMOD3Q9NYL9 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
TMOD3Q9NYL9 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
TMOD3Q9NYL9 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
TMOD3Q9NYL9 INGX-201ENST00000359239 846 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
TMOD3Q9NYL9 PMVK-201ENST00000368467 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
TMOD3Q9NYL9 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
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TMOD3Q9NYL9 SLC25A48-204ENST00000433282 1111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
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TMOD3Q9NYL9 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
TMOD3Q9NYL9 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC25.61■■□□□ 1.69
TMOD3Q9NYL9 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
TMOD3Q9NYL9 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
TMOD3Q9NYL9 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
TMOD3Q9NYL9 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
TMOD3Q9NYL9 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
TMOD3Q9NYL9 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.61■■□□□ 1.69
TMOD3Q9NYL9 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
TMOD3Q9NYL9 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
TMOD3Q9NYL9 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
TMOD3Q9NYL9 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
TMOD3Q9NYL9 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
TMOD3Q9NYL9 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.6■■□□□ 1.69
TMOD3Q9NYL9 GPR6-201ENST00000275169 1089 ntAPPRIS P1 BASIC25.6■■□□□ 1.69
TMOD3Q9NYL9 CHCHD6-201ENST00000290913 1006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
TMOD3Q9NYL9 BX890604.1-205ENST00000425492 856 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
TMOD3Q9NYL9 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
TMOD3Q9NYL9 CHAC1-203ENST00000487220 853 ntTSL 3 BASIC25.6■■□□□ 1.69
TMOD3Q9NYL9 FDX2-206ENST00000492239 773 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
TMOD3Q9NYL9 AP002807.1-202ENST00000526897 791 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
TMOD3Q9NYL9 LTBR-211ENST00000543190 785 ntTSL 3 BASIC25.6■■□□□ 1.69
TMOD3Q9NYL9 ABCD4-228ENST00000557588 763 ntTSL 3 BASIC25.6■■□□□ 1.69
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