Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYG8

KCNK4, Potassium channel subfamily K member 4, humanhuman

Predictions only

Length 393 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNK4Q9NYG8 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
KCNK4Q9NYG8 STMN4-202ENST00000350889 2288 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
KCNK4Q9NYG8 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
KCNK4Q9NYG8 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
KCNK4Q9NYG8 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
KCNK4Q9NYG8 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
KCNK4Q9NYG8 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
KCNK4Q9NYG8 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
KCNK4Q9NYG8 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC20.03■□□□□ 0.8
KCNK4Q9NYG8 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.03■□□□□ 0.8
KCNK4Q9NYG8 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
KCNK4Q9NYG8 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
KCNK4Q9NYG8 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
KCNK4Q9NYG8 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
KCNK4Q9NYG8 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
KCNK4Q9NYG8 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
KCNK4Q9NYG8 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
KCNK4Q9NYG8 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
KCNK4Q9NYG8 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
KCNK4Q9NYG8 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
KCNK4Q9NYG8 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
KCNK4Q9NYG8 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
KCNK4Q9NYG8 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
KCNK4Q9NYG8 FOXL2-201ENST00000330315 2917 ntAPPRIS P1 BASIC20.03■□□□□ 0.8
KCNK4Q9NYG8 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
KCNK4Q9NYG8 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
KCNK4Q9NYG8 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC20.02■□□□□ 0.8
KCNK4Q9NYG8 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
KCNK4Q9NYG8 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
KCNK4Q9NYG8 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
KCNK4Q9NYG8 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
KCNK4Q9NYG8 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
KCNK4Q9NYG8 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
KCNK4Q9NYG8 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
KCNK4Q9NYG8 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
KCNK4Q9NYG8 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
KCNK4Q9NYG8 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.8
KCNK4Q9NYG8 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
KCNK4Q9NYG8 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.8
KCNK4Q9NYG8 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
KCNK4Q9NYG8 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
KCNK4Q9NYG8 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
KCNK4Q9NYG8 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
KCNK4Q9NYG8 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
KCNK4Q9NYG8 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
KCNK4Q9NYG8 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
KCNK4Q9NYG8 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.79
KCNK4Q9NYG8 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
KCNK4Q9NYG8 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
KCNK4Q9NYG8 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
KCNK4Q9NYG8 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
KCNK4Q9NYG8 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
KCNK4Q9NYG8 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
KCNK4Q9NYG8 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
KCNK4Q9NYG8 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
KCNK4Q9NYG8 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
KCNK4Q9NYG8 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
KCNK4Q9NYG8 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC20.01■□□□□ 0.79
KCNK4Q9NYG8 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
KCNK4Q9NYG8 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
KCNK4Q9NYG8 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
KCNK4Q9NYG8 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
KCNK4Q9NYG8 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
KCNK4Q9NYG8 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
KCNK4Q9NYG8 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
KCNK4Q9NYG8 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
KCNK4Q9NYG8 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
KCNK4Q9NYG8 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
KCNK4Q9NYG8 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
KCNK4Q9NYG8 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
KCNK4Q9NYG8 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
KCNK4Q9NYG8 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
KCNK4Q9NYG8 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
KCNK4Q9NYG8 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
KCNK4Q9NYG8 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
KCNK4Q9NYG8 TMSB15B-201ENST00000419165 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
KCNK4Q9NYG8 AP000974.1-201ENST00000623909 2387 ntBASIC20■□□□□ 0.79
KCNK4Q9NYG8 FBXO24-202ENST00000427939 2087 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
KCNK4Q9NYG8 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
KCNK4Q9NYG8 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC20■□□□□ 0.79
KCNK4Q9NYG8 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
KCNK4Q9NYG8 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
KCNK4Q9NYG8 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
KCNK4Q9NYG8 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
KCNK4Q9NYG8 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
KCNK4Q9NYG8 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
KCNK4Q9NYG8 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
KCNK4Q9NYG8 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
KCNK4Q9NYG8 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
KCNK4Q9NYG8 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
KCNK4Q9NYG8 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
KCNK4Q9NYG8 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
KCNK4Q9NYG8 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
KCNK4Q9NYG8 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
KCNK4Q9NYG8 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
KCNK4Q9NYG8 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
KCNK4Q9NYG8 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
KCNK4Q9NYG8 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
KCNK4Q9NYG8 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
KCNK4Q9NYG8 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.7 ms