Protein–RNA interactions for Protein: Q9NX77

ERVK13-1, Endogenous retrovirus group K member 13-1 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 482 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVK13-1Q9NX77 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
ERVK13-1Q9NX77 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
ERVK13-1Q9NX77 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
ERVK13-1Q9NX77 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
ERVK13-1Q9NX77 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
ERVK13-1Q9NX77 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
ERVK13-1Q9NX77 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
ERVK13-1Q9NX77 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
ERVK13-1Q9NX77 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
ERVK13-1Q9NX77 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
ERVK13-1Q9NX77 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
ERVK13-1Q9NX77 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
ERVK13-1Q9NX77 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
ERVK13-1Q9NX77 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
ERVK13-1Q9NX77 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
ERVK13-1Q9NX77 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
ERVK13-1Q9NX77 ZBTB10-205ENST00000610895 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
ERVK13-1Q9NX77 BLOC1S3-201ENST00000433642 2601 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
ERVK13-1Q9NX77 CABIN1-202ENST00000337989 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ERVK13-1Q9NX77 PHF12-202ENST00000332830 4759 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
ERVK13-1Q9NX77 GGT2-201ENST00000401924 2366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
ERVK13-1Q9NX77 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ERVK13-1Q9NX77 NLGN2-204ENST00000575301 4374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
ERVK13-1Q9NX77 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
ERVK13-1Q9NX77 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ERVK13-1Q9NX77 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
ERVK13-1Q9NX77 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ERVK13-1Q9NX77 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
ERVK13-1Q9NX77 FAM222A-202ENST00000538780 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ERVK13-1Q9NX77 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ERVK13-1Q9NX77 WAC-202ENST00000347934 2839 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
ERVK13-1Q9NX77 RAPGEF5-203ENST00000405243 2800 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ERVK13-1Q9NX77 SLC35F3-201ENST00000366617 2762 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ERVK13-1Q9NX77 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
ERVK13-1Q9NX77 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ERVK13-1Q9NX77 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ERVK13-1Q9NX77 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
ERVK13-1Q9NX77 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
ERVK13-1Q9NX77 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
ERVK13-1Q9NX77 FZD10-202ENST00000539839 3282 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
ERVK13-1Q9NX77 FIP1L1-203ENST00000358575 2180 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
ERVK13-1Q9NX77 ARID1A-201ENST00000324856 8577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ERVK13-1Q9NX77 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ERVK13-1Q9NX77 CHPF-203ENST00000535926 2634 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
ERVK13-1Q9NX77 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
ERVK13-1Q9NX77 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
ERVK13-1Q9NX77 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC17.83■□□□□ 0.45
ERVK13-1Q9NX77 LDLRAD4-211ENST00000587757 2171 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
ERVK13-1Q9NX77 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
ERVK13-1Q9NX77 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
ERVK13-1Q9NX77 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
ERVK13-1Q9NX77 ADORA2A-213ENST00000610595 2736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
ERVK13-1Q9NX77 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
ERVK13-1Q9NX77 MB21D1-202ENST00000370318 1917 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
ERVK13-1Q9NX77 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
ERVK13-1Q9NX77 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
ERVK13-1Q9NX77 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
ERVK13-1Q9NX77 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
ERVK13-1Q9NX77 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
ERVK13-1Q9NX77 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
ERVK13-1Q9NX77 SEPT8-201ENST00000296873 4394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
ERVK13-1Q9NX77 DSCAM-201ENST00000400454 8552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
ERVK13-1Q9NX77 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
ERVK13-1Q9NX77 SKOR1-203ENST00000554054 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
ERVK13-1Q9NX77 KIAA1324L-208ENST00000450689 6841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
ERVK13-1Q9NX77 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
ERVK13-1Q9NX77 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
ERVK13-1Q9NX77 STARD3-201ENST00000336308 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
ERVK13-1Q9NX77 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
ERVK13-1Q9NX77 EDEM1-201ENST00000256497 6146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
ERVK13-1Q9NX77 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ERVK13-1Q9NX77 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
ERVK13-1Q9NX77 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ERVK13-1Q9NX77 CARMIL2-201ENST00000334583 4687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ERVK13-1Q9NX77 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
ERVK13-1Q9NX77 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
ERVK13-1Q9NX77 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC17.82■□□□□ 0.44
ERVK13-1Q9NX77 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
ERVK13-1Q9NX77 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
ERVK13-1Q9NX77 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
ERVK13-1Q9NX77 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
ERVK13-1Q9NX77 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
ERVK13-1Q9NX77 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ERVK13-1Q9NX77 RILPL2-201ENST00000280571 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ERVK13-1Q9NX77 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ERVK13-1Q9NX77 GCGR-202ENST00000570996 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
ERVK13-1Q9NX77 TMEM79-203ENST00000405535 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ERVK13-1Q9NX77 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ERVK13-1Q9NX77 KRT8-216ENST00000552551 2126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
ERVK13-1Q9NX77 PAQR4-202ENST00000318782 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ERVK13-1Q9NX77 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
ERVK13-1Q9NX77 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
ERVK13-1Q9NX77 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ERVK13-1Q9NX77 RBM24-202ENST00000379052 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ERVK13-1Q9NX77 BANP-223ENST00000538234 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ERVK13-1Q9NX77 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
ERVK13-1Q9NX77 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ERVK13-1Q9NX77 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
ERVK13-1Q9NX77 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ERVK13-1Q9NX77 CMIP-209ENST00000566513 2288 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.4 ms