Protein–RNA interactions for Protein: Q9NVF7

FBXO28, F-box only protein 28, humanhuman

Predictions only

Length 368 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FBXO28Q9NVF7 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
FBXO28Q9NVF7 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
FBXO28Q9NVF7 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
FBXO28Q9NVF7 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
FBXO28Q9NVF7 MIR1224-201ENST00000408193 85 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
FBXO28Q9NVF7 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
FBXO28Q9NVF7 AC010531.1-201ENST00000568879 953 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.9■■□□□ 1.26
FBXO28Q9NVF7 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
FBXO28Q9NVF7 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
FBXO28Q9NVF7 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
FBXO28Q9NVF7 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
FBXO28Q9NVF7 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
FBXO28Q9NVF7 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
FBXO28Q9NVF7 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
FBXO28Q9NVF7 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
FBXO28Q9NVF7 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
FBXO28Q9NVF7 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
FBXO28Q9NVF7 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
FBXO28Q9NVF7 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
FBXO28Q9NVF7 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
FBXO28Q9NVF7 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
FBXO28Q9NVF7 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
FBXO28Q9NVF7 RCN1P1-201ENST00000400413 996 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
FBXO28Q9NVF7 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
FBXO28Q9NVF7 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
FBXO28Q9NVF7 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
FBXO28Q9NVF7 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
FBXO28Q9NVF7 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
FBXO28Q9NVF7 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
FBXO28Q9NVF7 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
FBXO28Q9NVF7 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
FBXO28Q9NVF7 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
FBXO28Q9NVF7 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
FBXO28Q9NVF7 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
FBXO28Q9NVF7 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
FBXO28Q9NVF7 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
FBXO28Q9NVF7 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
FBXO28Q9NVF7 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
FBXO28Q9NVF7 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
FBXO28Q9NVF7 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
FBXO28Q9NVF7 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
FBXO28Q9NVF7 CCT7-202ENST00000398422 1234 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
FBXO28Q9NVF7 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
FBXO28Q9NVF7 C1QL1P1-201ENST00000568105 661 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
FBXO28Q9NVF7 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
FBXO28Q9NVF7 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
FBXO28Q9NVF7 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
FBXO28Q9NVF7 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
FBXO28Q9NVF7 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
FBXO28Q9NVF7 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
FBXO28Q9NVF7 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
FBXO28Q9NVF7 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
FBXO28Q9NVF7 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
FBXO28Q9NVF7 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
FBXO28Q9NVF7 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
FBXO28Q9NVF7 AC008105.2-201ENST00000420431 579 ntTSL 4 BASIC22.87■■□□□ 1.25
FBXO28Q9NVF7 AL390955.1-201ENST00000428694 934 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
FBXO28Q9NVF7 ATP6V0E1-204ENST00000519911 718 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
FBXO28Q9NVF7 AC103855.2-201ENST00000533315 573 ntTSL 4 BASIC22.87■■□□□ 1.25
FBXO28Q9NVF7 AC100839.1-201ENST00000559589 577 ntTSL 4 BASIC22.87■■□□□ 1.25
FBXO28Q9NVF7 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
FBXO28Q9NVF7 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
FBXO28Q9NVF7 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
FBXO28Q9NVF7 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
FBXO28Q9NVF7 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
FBXO28Q9NVF7 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
FBXO28Q9NVF7 METTL21A-201ENST00000272839 1210 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
FBXO28Q9NVF7 AC004803.1-203ENST00000539259 501 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
FBXO28Q9NVF7 PPOX-219ENST00000544598 813 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
FBXO28Q9NVF7 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC22.86■■□□□ 1.25
FBXO28Q9NVF7 AC010331.1-201ENST00000611423 582 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
FBXO28Q9NVF7 SPINK2-206ENST00000618802 608 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
FBXO28Q9NVF7 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
FBXO28Q9NVF7 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
FBXO28Q9NVF7 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
FBXO28Q9NVF7 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
FBXO28Q9NVF7 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
FBXO28Q9NVF7 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
FBXO28Q9NVF7 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
FBXO28Q9NVF7 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
FBXO28Q9NVF7 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC22.85■■□□□ 1.25
FBXO28Q9NVF7 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
FBXO28Q9NVF7 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
FBXO28Q9NVF7 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
FBXO28Q9NVF7 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
FBXO28Q9NVF7 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
FBXO28Q9NVF7 AL162231.1-203ENST00000416454 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
FBXO28Q9NVF7 AC116562.2-201ENST00000507042 360 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
FBXO28Q9NVF7 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC22.85■■□□□ 1.25
FBXO28Q9NVF7 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
FBXO28Q9NVF7 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
FBXO28Q9NVF7 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
FBXO28Q9NVF7 CEMP1-202ENST00000567119 1374 ntAPPRIS P2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
FBXO28Q9NVF7 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
FBXO28Q9NVF7 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
FBXO28Q9NVF7 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
FBXO28Q9NVF7 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
FBXO28Q9NVF7 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
FBXO28Q9NVF7 GSTM4-201ENST00000326729 1321 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
FBXO28Q9NVF7 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.2 ms