Protein–RNA interactions for Protein: Q9NUK0

MBNL3, Muscleblind-like protein 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 354 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MBNL3Q9NUK0 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
MBNL3Q9NUK0 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
MBNL3Q9NUK0 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
MBNL3Q9NUK0 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
MBNL3Q9NUK0 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
MBNL3Q9NUK0 AC233280.1-201ENST00000423600 1684 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
MBNL3Q9NUK0 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
MBNL3Q9NUK0 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
MBNL3Q9NUK0 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
MBNL3Q9NUK0 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
MBNL3Q9NUK0 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
MBNL3Q9NUK0 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
MBNL3Q9NUK0 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
MBNL3Q9NUK0 AC087482.1-204ENST00000636067 2431 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
MBNL3Q9NUK0 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
MBNL3Q9NUK0 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
MBNL3Q9NUK0 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
MBNL3Q9NUK0 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
MBNL3Q9NUK0 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
MBNL3Q9NUK0 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
MBNL3Q9NUK0 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
MBNL3Q9NUK0 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
MBNL3Q9NUK0 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
MBNL3Q9NUK0 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
MBNL3Q9NUK0 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
MBNL3Q9NUK0 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
MBNL3Q9NUK0 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
MBNL3Q9NUK0 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
MBNL3Q9NUK0 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
MBNL3Q9NUK0 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
MBNL3Q9NUK0 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
MBNL3Q9NUK0 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
MBNL3Q9NUK0 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
MBNL3Q9NUK0 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
MBNL3Q9NUK0 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
MBNL3Q9NUK0 BX323043.1-201ENST00000641006 1765 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
MBNL3Q9NUK0 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
MBNL3Q9NUK0 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
MBNL3Q9NUK0 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
MBNL3Q9NUK0 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
MBNL3Q9NUK0 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
MBNL3Q9NUK0 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
MBNL3Q9NUK0 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
MBNL3Q9NUK0 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
MBNL3Q9NUK0 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
MBNL3Q9NUK0 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
MBNL3Q9NUK0 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
MBNL3Q9NUK0 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
MBNL3Q9NUK0 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
MBNL3Q9NUK0 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
MBNL3Q9NUK0 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
MBNL3Q9NUK0 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
MBNL3Q9NUK0 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
MBNL3Q9NUK0 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
MBNL3Q9NUK0 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
MBNL3Q9NUK0 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
MBNL3Q9NUK0 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
MBNL3Q9NUK0 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
MBNL3Q9NUK0 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
MBNL3Q9NUK0 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
MBNL3Q9NUK0 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
MBNL3Q9NUK0 ANTXR1-203ENST00000409829 2221 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
MBNL3Q9NUK0 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
MBNL3Q9NUK0 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
MBNL3Q9NUK0 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
MBNL3Q9NUK0 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
MBNL3Q9NUK0 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
MBNL3Q9NUK0 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
MBNL3Q9NUK0 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
MBNL3Q9NUK0 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
MBNL3Q9NUK0 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
MBNL3Q9NUK0 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
MBNL3Q9NUK0 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
MBNL3Q9NUK0 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
MBNL3Q9NUK0 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
MBNL3Q9NUK0 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
MBNL3Q9NUK0 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
MBNL3Q9NUK0 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
MBNL3Q9NUK0 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
MBNL3Q9NUK0 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
MBNL3Q9NUK0 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
MBNL3Q9NUK0 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
MBNL3Q9NUK0 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
MBNL3Q9NUK0 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
MBNL3Q9NUK0 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
MBNL3Q9NUK0 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
MBNL3Q9NUK0 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
MBNL3Q9NUK0 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
MBNL3Q9NUK0 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
MBNL3Q9NUK0 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
MBNL3Q9NUK0 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
MBNL3Q9NUK0 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
MBNL3Q9NUK0 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
MBNL3Q9NUK0 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
MBNL3Q9NUK0 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
MBNL3Q9NUK0 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
MBNL3Q9NUK0 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC16.41■□□□□ 0.22
MBNL3Q9NUK0 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
MBNL3Q9NUK0 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC16.41■□□□□ 0.22
MBNL3Q9NUK0 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.3 ms