Protein–RNA interactions for Protein: Q9HB65

ELL3, RNA polymerase II elongation factor ELL3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 397 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ELL3Q9HB65 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
ELL3Q9HB65 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
ELL3Q9HB65 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
ELL3Q9HB65 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
ELL3Q9HB65 HMGXB3-206ENST00000613459 5567 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
ELL3Q9HB65 COL4A2-201ENST00000360467 6281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
ELL3Q9HB65 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
ELL3Q9HB65 ADCY3-201ENST00000260600 5050 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
ELL3Q9HB65 NOMO2-212ENST00000622306 4252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
ELL3Q9HB65 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
ELL3Q9HB65 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
ELL3Q9HB65 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC17.27■□□□□ 0.36
ELL3Q9HB65 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
ELL3Q9HB65 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
ELL3Q9HB65 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
ELL3Q9HB65 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
ELL3Q9HB65 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
ELL3Q9HB65 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC17.27■□□□□ 0.36
ELL3Q9HB65 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
ELL3Q9HB65 UBE3A-201ENST00000232165 5051 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
ELL3Q9HB65 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
ELL3Q9HB65 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
ELL3Q9HB65 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
ELL3Q9HB65 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC17.27■□□□□ 0.35
ELL3Q9HB65 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
ELL3Q9HB65 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
ELL3Q9HB65 IQSEC2-202ENST00000396435 6015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
ELL3Q9HB65 TRIM24-201ENST00000343526 8410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
ELL3Q9HB65 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
ELL3Q9HB65 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
ELL3Q9HB65 COBLL1-201ENST00000342193 4898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
ELL3Q9HB65 PRR36-202ENST00000618550 4456 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
ELL3Q9HB65 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
ELL3Q9HB65 RHOU-201ENST00000366691 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
ELL3Q9HB65 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
ELL3Q9HB65 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
ELL3Q9HB65 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
ELL3Q9HB65 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
ELL3Q9HB65 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
ELL3Q9HB65 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
ELL3Q9HB65 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
ELL3Q9HB65 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
ELL3Q9HB65 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
ELL3Q9HB65 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
ELL3Q9HB65 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
ELL3Q9HB65 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
ELL3Q9HB65 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
ELL3Q9HB65 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
ELL3Q9HB65 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
ELL3Q9HB65 MPV17L-201ENST00000287594 5820 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
ELL3Q9HB65 OXSR1-201ENST00000311806 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
ELL3Q9HB65 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
ELL3Q9HB65 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
ELL3Q9HB65 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
ELL3Q9HB65 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
ELL3Q9HB65 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
ELL3Q9HB65 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
ELL3Q9HB65 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
ELL3Q9HB65 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
ELL3Q9HB65 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
ELL3Q9HB65 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
ELL3Q9HB65 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
ELL3Q9HB65 OR6D1P-202ENST00000641007 5290 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
ELL3Q9HB65 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
ELL3Q9HB65 E2F2-201ENST00000361729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
ELL3Q9HB65 BCL11B-202ENST00000357195 7559 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
ELL3Q9HB65 ROCK2-209ENST00000616279 6401 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
ELL3Q9HB65 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
ELL3Q9HB65 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
ELL3Q9HB65 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
ELL3Q9HB65 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
ELL3Q9HB65 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
ELL3Q9HB65 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
ELL3Q9HB65 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
ELL3Q9HB65 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC17.25■□□□□ 0.35
ELL3Q9HB65 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
ELL3Q9HB65 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
ELL3Q9HB65 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
ELL3Q9HB65 PTPDC1-202ENST00000375360 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
ELL3Q9HB65 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
ELL3Q9HB65 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
ELL3Q9HB65 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
ELL3Q9HB65 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
ELL3Q9HB65 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
ELL3Q9HB65 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
ELL3Q9HB65 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
ELL3Q9HB65 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
ELL3Q9HB65 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
ELL3Q9HB65 TMEM110-201ENST00000355083 4769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
ELL3Q9HB65 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
ELL3Q9HB65 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
ELL3Q9HB65 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
ELL3Q9HB65 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
ELL3Q9HB65 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
ELL3Q9HB65 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
ELL3Q9HB65 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
ELL3Q9HB65 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
ELL3Q9HB65 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
ELL3Q9HB65 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
ELL3Q9HB65 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.8 ms