Protein–RNA interactions for Protein: Q9H9D4

ZNF408, Zinc finger protein 408, humanhuman

Predictions only

Length 720 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF408Q9H9D4 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
ZNF408Q9H9D4 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ZNF408Q9H9D4 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
ZNF408Q9H9D4 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ZNF408Q9H9D4 RFXANK-205ENST00000456252 1325 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ZNF408Q9H9D4 GPR32-201ENST00000270590 1269 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
ZNF408Q9H9D4 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ZNF408Q9H9D4 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ZNF408Q9H9D4 RPL39L-203ENST00000455270 653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
ZNF408Q9H9D4 AL671277.2-201ENST00000458060 996 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
ZNF408Q9H9D4 IFI27L2-206ENST00000556727 556 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
ZNF408Q9H9D4 AC011498.2-201ENST00000588798 540 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
ZNF408Q9H9D4 ELAVL1-202ENST00000593807 856 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
ZNF408Q9H9D4 AP000692.2-201ENST00000608391 879 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
ZNF408Q9H9D4 AC011298.2-201ENST00000617989 482 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
ZNF408Q9H9D4 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
ZNF408Q9H9D4 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ZNF408Q9H9D4 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ZNF408Q9H9D4 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ZNF408Q9H9D4 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
ZNF408Q9H9D4 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ZNF408Q9H9D4 ELP5-204ENST00000396628 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ZNF408Q9H9D4 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ZNF408Q9H9D4 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ZNF408Q9H9D4 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ZNF408Q9H9D4 SLC25A29-215ENST00000556505 1540 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
ZNF408Q9H9D4 ISCU-201ENST00000311893 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ZNF408Q9H9D4 ELK1-202ENST00000343894 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ZNF408Q9H9D4 UBE2J2-205ENST00000400930 1021 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
ZNF408Q9H9D4 AC037459.1-202ENST00000430850 531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.4■■□□□ 1.34
ZNF408Q9H9D4 AF250324.1-201ENST00000506276 703 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
ZNF408Q9H9D4 AC130371.2-201ENST00000619443 611 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
ZNF408Q9H9D4 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ZNF408Q9H9D4 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ZNF408Q9H9D4 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
ZNF408Q9H9D4 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ZNF408Q9H9D4 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
ZNF408Q9H9D4 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
ZNF408Q9H9D4 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
ZNF408Q9H9D4 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
ZNF408Q9H9D4 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
ZNF408Q9H9D4 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
ZNF408Q9H9D4 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
ZNF408Q9H9D4 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
ZNF408Q9H9D4 ASH1L-AS1-202ENST00000456633 911 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
ZNF408Q9H9D4 AP000777.3-201ENST00000538705 491 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
ZNF408Q9H9D4 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
ZNF408Q9H9D4 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
ZNF408Q9H9D4 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
ZNF408Q9H9D4 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
ZNF408Q9H9D4 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
ZNF408Q9H9D4 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
ZNF408Q9H9D4 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
ZNF408Q9H9D4 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
ZNF408Q9H9D4 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
ZNF408Q9H9D4 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
ZNF408Q9H9D4 AC005332.1-201ENST00000577698 1310 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
ZNF408Q9H9D4 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
ZNF408Q9H9D4 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
ZNF408Q9H9D4 TRPT1-202ENST00000394546 1058 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
ZNF408Q9H9D4 AC114763.1-202ENST00000414911 867 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
ZNF408Q9H9D4 SHBG-203ENST00000416273 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
ZNF408Q9H9D4 MRPL2-208ENST00000489623 570 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
ZNF408Q9H9D4 AC091153.3-201ENST00000497885 472 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
ZNF408Q9H9D4 AC022424.1-201ENST00000512155 889 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
ZNF408Q9H9D4 TRPT1-210ENST00000541278 941 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
ZNF408Q9H9D4 SHBG-215ENST00000575903 1196 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
ZNF408Q9H9D4 AC069148.1-201ENST00000608741 768 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
ZNF408Q9H9D4 RCC2P6-201ENST00000526625 1557 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
ZNF408Q9H9D4 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
ZNF408Q9H9D4 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
ZNF408Q9H9D4 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
ZNF408Q9H9D4 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
ZNF408Q9H9D4 TSGA10IP-203ENST00000532620 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
ZNF408Q9H9D4 C14orf180-201ENST00000331952 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
ZNF408Q9H9D4 OGFOD2-222ENST00000545317 1481 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
ZNF408Q9H9D4 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
ZNF408Q9H9D4 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
ZNF408Q9H9D4 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
ZNF408Q9H9D4 PXMP4-201ENST00000217398 979 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
ZNF408Q9H9D4 AC007663.1-201ENST00000438948 1240 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
ZNF408Q9H9D4 MUC1-212ENST00000457295 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
ZNF408Q9H9D4 AC008040.2-201ENST00000461049 708 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
ZNF408Q9H9D4 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
ZNF408Q9H9D4 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
ZNF408Q9H9D4 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
ZNF408Q9H9D4 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
ZNF408Q9H9D4 PTGER3-209ENST00000460330 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
ZNF408Q9H9D4 GPRIN2-201ENST00000374314 1696 ntAPPRIS P1 BASIC23.36■■□□□ 1.33
ZNF408Q9H9D4 AANAT-202ENST00000392492 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
ZNF408Q9H9D4 POLR2D-202ENST00000409698 806 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
ZNF408Q9H9D4 PRAP1-202ENST00000463201 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
ZNF408Q9H9D4 AC106771.1-201ENST00000502209 372 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
ZNF408Q9H9D4 LINC01385-201ENST00000512310 780 ntTSL 4 BASIC23.36■■□□□ 1.33
ZNF408Q9H9D4 AC087498.1-201ENST00000572493 945 ntAPPRIS P1 BASIC23.36■■□□□ 1.33
ZNF408Q9H9D4 C17orf62-221ENST00000581196 668 ntTSL 4 BASIC23.36■■□□□ 1.33
ZNF408Q9H9D4 OAZ1-211ENST00000602676 1148 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
ZNF408Q9H9D4 TXNDC12-205ENST00000610127 806 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
ZNF408Q9H9D4 Metazoa_SRP.33-201ENST00000613468 285 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
ZNF408Q9H9D4 IRF5-214ENST00000613821 595 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28 ms