Protein–RNA interactions for Protein: Q9H4D5

NXF3, Nuclear RNA export factor 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 531 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NXF3Q9H4D5 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
NXF3Q9H4D5 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
NXF3Q9H4D5 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
NXF3Q9H4D5 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
NXF3Q9H4D5 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
NXF3Q9H4D5 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
NXF3Q9H4D5 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
NXF3Q9H4D5 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
NXF3Q9H4D5 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
NXF3Q9H4D5 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
NXF3Q9H4D5 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
NXF3Q9H4D5 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
NXF3Q9H4D5 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
NXF3Q9H4D5 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
NXF3Q9H4D5 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
NXF3Q9H4D5 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
NXF3Q9H4D5 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
NXF3Q9H4D5 FAM197Y1-201ENST00000421178 764 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
NXF3Q9H4D5 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
NXF3Q9H4D5 ANAPC11-207ENST00000572639 578 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
NXF3Q9H4D5 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
NXF3Q9H4D5 AC073912.3-201ENST00000624414 853 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
NXF3Q9H4D5 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
NXF3Q9H4D5 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
NXF3Q9H4D5 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
NXF3Q9H4D5 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
NXF3Q9H4D5 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
NXF3Q9H4D5 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
NXF3Q9H4D5 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
NXF3Q9H4D5 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
NXF3Q9H4D5 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
NXF3Q9H4D5 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
NXF3Q9H4D5 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
NXF3Q9H4D5 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
NXF3Q9H4D5 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
NXF3Q9H4D5 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
NXF3Q9H4D5 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
NXF3Q9H4D5 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
NXF3Q9H4D5 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
NXF3Q9H4D5 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
NXF3Q9H4D5 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
NXF3Q9H4D5 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
NXF3Q9H4D5 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
NXF3Q9H4D5 YKT6-207ENST00000496112 1270 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
NXF3Q9H4D5 AF131216.3-201ENST00000525867 1099 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
NXF3Q9H4D5 AL355075.4-201ENST00000554988 638 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
NXF3Q9H4D5 LINC02256-201ENST00000561999 366 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
NXF3Q9H4D5 AC026471.5-201ENST00000615068 467 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
NXF3Q9H4D5 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
NXF3Q9H4D5 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
NXF3Q9H4D5 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
NXF3Q9H4D5 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
NXF3Q9H4D5 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
NXF3Q9H4D5 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.03
NXF3Q9H4D5 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
NXF3Q9H4D5 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
NXF3Q9H4D5 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
NXF3Q9H4D5 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
NXF3Q9H4D5 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
NXF3Q9H4D5 RAP1B-203ENST00000378985 1017 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
NXF3Q9H4D5 ZFYVE1-202ENST00000394207 1183 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
NXF3Q9H4D5 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
NXF3Q9H4D5 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
NXF3Q9H4D5 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
NXF3Q9H4D5 AP002982.1-201ENST00000492365 877 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
NXF3Q9H4D5 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
NXF3Q9H4D5 RAP1B-221ENST00000540209 1264 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
NXF3Q9H4D5 BX088651.1-201ENST00000540551 451 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
NXF3Q9H4D5 C12orf76-208ENST00000551185 496 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
NXF3Q9H4D5 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
NXF3Q9H4D5 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
NXF3Q9H4D5 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
NXF3Q9H4D5 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
NXF3Q9H4D5 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
NXF3Q9H4D5 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
NXF3Q9H4D5 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
NXF3Q9H4D5 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
NXF3Q9H4D5 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
NXF3Q9H4D5 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
NXF3Q9H4D5 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
NXF3Q9H4D5 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
NXF3Q9H4D5 BX322234.1-201ENST00000444188 980 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
NXF3Q9H4D5 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC21.44■■□□□ 1.02
NXF3Q9H4D5 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
NXF3Q9H4D5 AC073195.1-201ENST00000607241 877 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
NXF3Q9H4D5 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
NXF3Q9H4D5 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
NXF3Q9H4D5 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
NXF3Q9H4D5 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
NXF3Q9H4D5 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
NXF3Q9H4D5 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
NXF3Q9H4D5 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
NXF3Q9H4D5 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
NXF3Q9H4D5 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
NXF3Q9H4D5 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
NXF3Q9H4D5 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
NXF3Q9H4D5 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
NXF3Q9H4D5 OR10H2-201ENST00000305899 1041 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
NXF3Q9H4D5 ACVR1C-203ENST00000348328 1270 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
NXF3Q9H4D5 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
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