Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0F0

ASXL3, Putative Polycomb group protein ASXL3, humanhuman

Predictions only

Length 2,248 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ASXL3Q9C0F0 TBC1D7-205ENST00000379307 1084 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
ASXL3Q9C0F0 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
ASXL3Q9C0F0 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
ASXL3Q9C0F0 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
ASXL3Q9C0F0 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
ASXL3Q9C0F0 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
ASXL3Q9C0F0 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
ASXL3Q9C0F0 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
ASXL3Q9C0F0 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
ASXL3Q9C0F0 NT5C2-211ENST00000470299 249 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
ASXL3Q9C0F0 SURF4-206ENST00000485435 1206 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
ASXL3Q9C0F0 TMEM235-204ENST00000551068 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
ASXL3Q9C0F0 USF2-205ENST00000594064 1179 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
ASXL3Q9C0F0 AC010947.1-201ENST00000623454 693 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
ASXL3Q9C0F0 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
ASXL3Q9C0F0 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
ASXL3Q9C0F0 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
ASXL3Q9C0F0 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
ASXL3Q9C0F0 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
ASXL3Q9C0F0 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
ASXL3Q9C0F0 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
ASXL3Q9C0F0 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
ASXL3Q9C0F0 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
ASXL3Q9C0F0 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
ASXL3Q9C0F0 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
ASXL3Q9C0F0 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
ASXL3Q9C0F0 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
ASXL3Q9C0F0 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
ASXL3Q9C0F0 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
ASXL3Q9C0F0 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
ASXL3Q9C0F0 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
ASXL3Q9C0F0 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC19.16■□□□□ 0.66
ASXL3Q9C0F0 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
ASXL3Q9C0F0 ING1-202ENST00000338450 1189 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
ASXL3Q9C0F0 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
ASXL3Q9C0F0 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
ASXL3Q9C0F0 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
ASXL3Q9C0F0 BDKRB1-204ENST00000611804 1085 ntAPPRIS P1 BASIC19.16■□□□□ 0.66
ASXL3Q9C0F0 DECR2-212ENST00000627716 352 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
ASXL3Q9C0F0 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
ASXL3Q9C0F0 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
ASXL3Q9C0F0 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
ASXL3Q9C0F0 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
ASXL3Q9C0F0 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
ASXL3Q9C0F0 AP000525.1-201ENST00000608286 694 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
ASXL3Q9C0F0 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
ASXL3Q9C0F0 KRT18P22-201ENST00000402024 1347 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
ASXL3Q9C0F0 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
ASXL3Q9C0F0 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
ASXL3Q9C0F0 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
ASXL3Q9C0F0 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
ASXL3Q9C0F0 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
ASXL3Q9C0F0 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC19.15■□□□□ 0.66
ASXL3Q9C0F0 LINC01122-201ENST00000422723 675 ntTSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
ASXL3Q9C0F0 AC008735.6-201ENST00000635964 1292 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
ASXL3Q9C0F0 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
ASXL3Q9C0F0 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
ASXL3Q9C0F0 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
ASXL3Q9C0F0 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
ASXL3Q9C0F0 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
ASXL3Q9C0F0 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC19.14■□□□□ 0.65
ASXL3Q9C0F0 DHRS4L2-202ENST00000397071 1117 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
ASXL3Q9C0F0 ELOB-202ENST00000409477 997 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
ASXL3Q9C0F0 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
ASXL3Q9C0F0 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
ASXL3Q9C0F0 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
ASXL3Q9C0F0 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
ASXL3Q9C0F0 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
ASXL3Q9C0F0 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
ASXL3Q9C0F0 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
ASXL3Q9C0F0 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
ASXL3Q9C0F0 LINC01568-207ENST00000641790 1380 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
ASXL3Q9C0F0 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
ASXL3Q9C0F0 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
ASXL3Q9C0F0 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
ASXL3Q9C0F0 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
ASXL3Q9C0F0 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
ASXL3Q9C0F0 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
ASXL3Q9C0F0 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
ASXL3Q9C0F0 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
ASXL3Q9C0F0 ATP5S-204ENST00000426751 1171 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
ASXL3Q9C0F0 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
ASXL3Q9C0F0 RAP1B-228ENST00000542145 1060 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
ASXL3Q9C0F0 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
ASXL3Q9C0F0 LY6L-201ENST00000562505 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
ASXL3Q9C0F0 AC002094.1-201ENST00000591482 1050 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
ASXL3Q9C0F0 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
ASXL3Q9C0F0 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
ASXL3Q9C0F0 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
ASXL3Q9C0F0 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
ASXL3Q9C0F0 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
ASXL3Q9C0F0 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
ASXL3Q9C0F0 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
ASXL3Q9C0F0 YBEY-201ENST00000329319 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
ASXL3Q9C0F0 YBEY-206ENST00000397701 744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
ASXL3Q9C0F0 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
ASXL3Q9C0F0 AC011506.1-201ENST00000474329 610 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
ASXL3Q9C0F0 TMEM64-204ENST00000519519 873 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
ASXL3Q9C0F0 AC006942.1-201ENST00000600669 520 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
ASXL3Q9C0F0 AC005363.2-201ENST00000618631 242 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.7 ms