Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZQ6

EDEM3, ER degradation-enhancing alpha-mannosidase-like protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 932 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EDEM3Q9BZQ6 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
EDEM3Q9BZQ6 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
EDEM3Q9BZQ6 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
EDEM3Q9BZQ6 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
EDEM3Q9BZQ6 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
EDEM3Q9BZQ6 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC21.38■■□□□ 1.01
EDEM3Q9BZQ6 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
EDEM3Q9BZQ6 TOM1L1-202ENST00000445275 2228 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
EDEM3Q9BZQ6 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
EDEM3Q9BZQ6 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
EDEM3Q9BZQ6 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
EDEM3Q9BZQ6 TP73-202ENST00000354437 2140 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
EDEM3Q9BZQ6 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
EDEM3Q9BZQ6 GPR31-201ENST00000366834 2059 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
EDEM3Q9BZQ6 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
EDEM3Q9BZQ6 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
EDEM3Q9BZQ6 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
EDEM3Q9BZQ6 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
EDEM3Q9BZQ6 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
EDEM3Q9BZQ6 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
EDEM3Q9BZQ6 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
EDEM3Q9BZQ6 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
EDEM3Q9BZQ6 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
EDEM3Q9BZQ6 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
EDEM3Q9BZQ6 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
EDEM3Q9BZQ6 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
EDEM3Q9BZQ6 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
EDEM3Q9BZQ6 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
EDEM3Q9BZQ6 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
EDEM3Q9BZQ6 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
EDEM3Q9BZQ6 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
EDEM3Q9BZQ6 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
EDEM3Q9BZQ6 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
EDEM3Q9BZQ6 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
EDEM3Q9BZQ6 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
EDEM3Q9BZQ6 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
EDEM3Q9BZQ6 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
EDEM3Q9BZQ6 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
EDEM3Q9BZQ6 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
EDEM3Q9BZQ6 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
EDEM3Q9BZQ6 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
EDEM3Q9BZQ6 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
EDEM3Q9BZQ6 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
EDEM3Q9BZQ6 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
EDEM3Q9BZQ6 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
EDEM3Q9BZQ6 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
EDEM3Q9BZQ6 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
EDEM3Q9BZQ6 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
EDEM3Q9BZQ6 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
EDEM3Q9BZQ6 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
EDEM3Q9BZQ6 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
EDEM3Q9BZQ6 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
EDEM3Q9BZQ6 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
EDEM3Q9BZQ6 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
EDEM3Q9BZQ6 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
EDEM3Q9BZQ6 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
EDEM3Q9BZQ6 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
EDEM3Q9BZQ6 AP000974.1-201ENST00000623909 2387 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
EDEM3Q9BZQ6 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
EDEM3Q9BZQ6 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
EDEM3Q9BZQ6 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
EDEM3Q9BZQ6 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
EDEM3Q9BZQ6 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
EDEM3Q9BZQ6 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
EDEM3Q9BZQ6 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
EDEM3Q9BZQ6 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
EDEM3Q9BZQ6 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
EDEM3Q9BZQ6 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
EDEM3Q9BZQ6 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
EDEM3Q9BZQ6 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
EDEM3Q9BZQ6 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
EDEM3Q9BZQ6 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
EDEM3Q9BZQ6 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
EDEM3Q9BZQ6 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
EDEM3Q9BZQ6 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
EDEM3Q9BZQ6 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
EDEM3Q9BZQ6 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
EDEM3Q9BZQ6 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
EDEM3Q9BZQ6 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
EDEM3Q9BZQ6 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
EDEM3Q9BZQ6 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
EDEM3Q9BZQ6 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
EDEM3Q9BZQ6 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
EDEM3Q9BZQ6 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
EDEM3Q9BZQ6 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
EDEM3Q9BZQ6 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
EDEM3Q9BZQ6 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
EDEM3Q9BZQ6 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
EDEM3Q9BZQ6 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
EDEM3Q9BZQ6 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
EDEM3Q9BZQ6 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
EDEM3Q9BZQ6 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
EDEM3Q9BZQ6 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
EDEM3Q9BZQ6 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
EDEM3Q9BZQ6 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
EDEM3Q9BZQ6 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
EDEM3Q9BZQ6 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
EDEM3Q9BZQ6 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
EDEM3Q9BZQ6 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
EDEM3Q9BZQ6 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.6 ms