Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXE9

VN1R3, Vomeronasal type-1 receptor 3, humanhuman

Predictions only

Length 311 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VN1R3Q9BXE9 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
VN1R3Q9BXE9 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
VN1R3Q9BXE9 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
VN1R3Q9BXE9 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
VN1R3Q9BXE9 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
VN1R3Q9BXE9 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
VN1R3Q9BXE9 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
VN1R3Q9BXE9 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
VN1R3Q9BXE9 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
VN1R3Q9BXE9 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
VN1R3Q9BXE9 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
VN1R3Q9BXE9 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
VN1R3Q9BXE9 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
VN1R3Q9BXE9 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
VN1R3Q9BXE9 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
VN1R3Q9BXE9 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
VN1R3Q9BXE9 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
VN1R3Q9BXE9 CRAT-202ENST00000393384 973 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
VN1R3Q9BXE9 AC103564.1-201ENST00000437330 562 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
VN1R3Q9BXE9 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
VN1R3Q9BXE9 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
VN1R3Q9BXE9 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
VN1R3Q9BXE9 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
VN1R3Q9BXE9 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
VN1R3Q9BXE9 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
VN1R3Q9BXE9 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
VN1R3Q9BXE9 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
VN1R3Q9BXE9 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
VN1R3Q9BXE9 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
VN1R3Q9BXE9 OXT-201ENST00000217386 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
VN1R3Q9BXE9 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
VN1R3Q9BXE9 RXFP4-201ENST00000368318 1240 ntAPPRIS P1 BASIC21.03■□□□□ 0.96
VN1R3Q9BXE9 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
VN1R3Q9BXE9 B3GAT3P1-201ENST00000471720 806 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
VN1R3Q9BXE9 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
VN1R3Q9BXE9 TMA16-209ENST00000513272 803 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
VN1R3Q9BXE9 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC21.03■□□□□ 0.96
VN1R3Q9BXE9 SLC39A2-203ENST00000554422 1259 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
VN1R3Q9BXE9 AC026271.3-201ENST00000571884 352 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
VN1R3Q9BXE9 CIRBP-217ENST00000588230 1013 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
VN1R3Q9BXE9 ISOC2-201ENST00000085068 1122 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
VN1R3Q9BXE9 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
VN1R3Q9BXE9 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
VN1R3Q9BXE9 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
VN1R3Q9BXE9 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
VN1R3Q9BXE9 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
VN1R3Q9BXE9 AL445686.2-201ENST00000577528 1445 ntTSL 3 BASIC21.03■□□□□ 0.96
VN1R3Q9BXE9 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
VN1R3Q9BXE9 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
VN1R3Q9BXE9 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
VN1R3Q9BXE9 ILK-203ENST00000420936 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
VN1R3Q9BXE9 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
VN1R3Q9BXE9 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
VN1R3Q9BXE9 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
VN1R3Q9BXE9 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
VN1R3Q9BXE9 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
VN1R3Q9BXE9 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC21.02■□□□□ 0.96
VN1R3Q9BXE9 METTL5-201ENST00000260953 1010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
VN1R3Q9BXE9 HES7-201ENST00000317814 678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
VN1R3Q9BXE9 MAGI2-AS3-203ENST00000424477 520 ntTSL 4 BASIC21.02■□□□□ 0.96
VN1R3Q9BXE9 AC134772.1-201ENST00000438872 885 ntTSL 3 BASIC21.02■□□□□ 0.96
VN1R3Q9BXE9 SLC25A3P1-201ENST00000443844 931 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
VN1R3Q9BXE9 AL049597.2-201ENST00000565575 961 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
VN1R3Q9BXE9 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
VN1R3Q9BXE9 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
VN1R3Q9BXE9 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
VN1R3Q9BXE9 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.95
VN1R3Q9BXE9 KRT18P22-201ENST00000402024 1347 ntBASIC21.02■□□□□ 0.95
VN1R3Q9BXE9 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.95
VN1R3Q9BXE9 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC21.01■□□□□ 0.95
VN1R3Q9BXE9 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
VN1R3Q9BXE9 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
VN1R3Q9BXE9 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
VN1R3Q9BXE9 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
VN1R3Q9BXE9 POMZP3-201ENST00000275569 1259 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
VN1R3Q9BXE9 ZNF337-AS1-204ENST00000428254 817 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
VN1R3Q9BXE9 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
VN1R3Q9BXE9 NOL7-202ENST00000451315 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
VN1R3Q9BXE9 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
VN1R3Q9BXE9 STAC3-202ENST00000546246 1014 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
VN1R3Q9BXE9 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC21.01■□□□□ 0.95
VN1R3Q9BXE9 AC002310.4-201ENST00000568114 377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
VN1R3Q9BXE9 PRR29-205ENST00000579184 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
VN1R3Q9BXE9 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
VN1R3Q9BXE9 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
VN1R3Q9BXE9 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
VN1R3Q9BXE9 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
VN1R3Q9BXE9 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
VN1R3Q9BXE9 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
VN1R3Q9BXE9 FSCN1P1-201ENST00000568912 1481 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
VN1R3Q9BXE9 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
VN1R3Q9BXE9 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
VN1R3Q9BXE9 AL731557.1-201ENST00000425264 744 ntTSL 3 BASIC21■□□□□ 0.95
VN1R3Q9BXE9 CFL2-205ENST00000555765 632 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
VN1R3Q9BXE9 AC020911.2-202ENST00000588945 593 ntTSL 3 BASIC21■□□□□ 0.95
VN1R3Q9BXE9 SCPEP1-216ENST00000631024 444 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
VN1R3Q9BXE9 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
VN1R3Q9BXE9 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
VN1R3Q9BXE9 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
VN1R3Q9BXE9 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.3 ms