Protein–RNA interactions for Protein: Q99956

DUSP9, Dual specificity protein phosphatase 9, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 384 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DUSP9Q99956 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
DUSP9Q99956 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
DUSP9Q99956 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
DUSP9Q99956 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
DUSP9Q99956 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
DUSP9Q99956 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
DUSP9Q99956 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
DUSP9Q99956 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
DUSP9Q99956 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
DUSP9Q99956 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
DUSP9Q99956 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC21.79■■□□□ 1.08
DUSP9Q99956 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
DUSP9Q99956 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
DUSP9Q99956 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
DUSP9Q99956 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
DUSP9Q99956 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
DUSP9Q99956 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
DUSP9Q99956 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
DUSP9Q99956 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
DUSP9Q99956 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
DUSP9Q99956 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
DUSP9Q99956 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
DUSP9Q99956 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
DUSP9Q99956 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC21.78■■□□□ 1.08
DUSP9Q99956 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
DUSP9Q99956 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
DUSP9Q99956 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
DUSP9Q99956 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
DUSP9Q99956 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
DUSP9Q99956 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
DUSP9Q99956 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
DUSP9Q99956 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
DUSP9Q99956 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC21.77■■□□□ 1.08
DUSP9Q99956 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
DUSP9Q99956 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
DUSP9Q99956 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
DUSP9Q99956 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
DUSP9Q99956 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
DUSP9Q99956 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
DUSP9Q99956 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
DUSP9Q99956 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
DUSP9Q99956 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
DUSP9Q99956 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
DUSP9Q99956 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
DUSP9Q99956 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
DUSP9Q99956 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
DUSP9Q99956 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
DUSP9Q99956 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
DUSP9Q99956 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.07
DUSP9Q99956 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
DUSP9Q99956 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
DUSP9Q99956 GPR31-201ENST00000366834 2059 ntAPPRIS P1 BASIC21.76■■□□□ 1.07
DUSP9Q99956 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
DUSP9Q99956 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
DUSP9Q99956 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
DUSP9Q99956 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
DUSP9Q99956 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
DUSP9Q99956 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC21.76■■□□□ 1.07
DUSP9Q99956 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
DUSP9Q99956 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
DUSP9Q99956 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
DUSP9Q99956 TOM1L1-202ENST00000445275 2228 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
DUSP9Q99956 SLC3A2-206ENST00000535296 2084 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
DUSP9Q99956 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
DUSP9Q99956 STARD3-219ENST00000580611 1989 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
DUSP9Q99956 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
DUSP9Q99956 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
DUSP9Q99956 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
DUSP9Q99956 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
DUSP9Q99956 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
DUSP9Q99956 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
DUSP9Q99956 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
DUSP9Q99956 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
DUSP9Q99956 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
DUSP9Q99956 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC21.75■■□□□ 1.07
DUSP9Q99956 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
DUSP9Q99956 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
DUSP9Q99956 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
DUSP9Q99956 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
DUSP9Q99956 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
DUSP9Q99956 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
DUSP9Q99956 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
DUSP9Q99956 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
DUSP9Q99956 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
DUSP9Q99956 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
DUSP9Q99956 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
DUSP9Q99956 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
DUSP9Q99956 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
DUSP9Q99956 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
DUSP9Q99956 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
DUSP9Q99956 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
DUSP9Q99956 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
DUSP9Q99956 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
DUSP9Q99956 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
DUSP9Q99956 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
DUSP9Q99956 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
DUSP9Q99956 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
DUSP9Q99956 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
DUSP9Q99956 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
DUSP9Q99956 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.6 ms