Protein–RNA interactions for Protein: Q99687

MEIS3, Homeobox protein Meis3, humanhuman

Predictions only

Length 375 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MEIS3Q99687 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
MEIS3Q99687 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
MEIS3Q99687 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
MEIS3Q99687 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
MEIS3Q99687 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.92■■□□□ 1.58
MEIS3Q99687 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC24.92■■□□□ 1.58
MEIS3Q99687 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
MEIS3Q99687 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
MEIS3Q99687 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
MEIS3Q99687 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
MEIS3Q99687 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
MEIS3Q99687 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
MEIS3Q99687 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
MEIS3Q99687 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
MEIS3Q99687 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
MEIS3Q99687 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
MEIS3Q99687 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
MEIS3Q99687 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
MEIS3Q99687 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
MEIS3Q99687 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
MEIS3Q99687 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
MEIS3Q99687 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
MEIS3Q99687 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
MEIS3Q99687 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
MEIS3Q99687 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
MEIS3Q99687 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
MEIS3Q99687 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
MEIS3Q99687 PIGQ-206ENST00000422307 2052 ntTSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
MEIS3Q99687 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
MEIS3Q99687 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
MEIS3Q99687 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
MEIS3Q99687 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
MEIS3Q99687 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
MEIS3Q99687 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
MEIS3Q99687 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
MEIS3Q99687 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
MEIS3Q99687 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
MEIS3Q99687 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
MEIS3Q99687 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
MEIS3Q99687 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
MEIS3Q99687 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
MEIS3Q99687 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
MEIS3Q99687 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
MEIS3Q99687 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
MEIS3Q99687 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
MEIS3Q99687 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
MEIS3Q99687 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
MEIS3Q99687 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
MEIS3Q99687 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
MEIS3Q99687 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
MEIS3Q99687 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
MEIS3Q99687 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
MEIS3Q99687 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
MEIS3Q99687 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
MEIS3Q99687 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
MEIS3Q99687 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
MEIS3Q99687 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
MEIS3Q99687 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.57
MEIS3Q99687 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
MEIS3Q99687 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
MEIS3Q99687 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
MEIS3Q99687 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
MEIS3Q99687 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
MEIS3Q99687 TFP1-202ENST00000475455 1573 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
MEIS3Q99687 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
MEIS3Q99687 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
MEIS3Q99687 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
MEIS3Q99687 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
MEIS3Q99687 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
MEIS3Q99687 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
MEIS3Q99687 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC24.88■■□□□ 1.57
MEIS3Q99687 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
MEIS3Q99687 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
MEIS3Q99687 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
MEIS3Q99687 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
MEIS3Q99687 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
MEIS3Q99687 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
MEIS3Q99687 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
MEIS3Q99687 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
MEIS3Q99687 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
MEIS3Q99687 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
MEIS3Q99687 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
MEIS3Q99687 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
MEIS3Q99687 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
MEIS3Q99687 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
MEIS3Q99687 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
MEIS3Q99687 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
MEIS3Q99687 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
MEIS3Q99687 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
MEIS3Q99687 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
MEIS3Q99687 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
MEIS3Q99687 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
MEIS3Q99687 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
MEIS3Q99687 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
MEIS3Q99687 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
MEIS3Q99687 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
MEIS3Q99687 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC24.86■■□□□ 1.57
MEIS3Q99687 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
MEIS3Q99687 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
MEIS3Q99687 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.9 ms