Protein–RNA interactions for Protein: Q96MK3

FAM20A, Pseudokinase FAM20A, humanhuman

Predictions only

Length 541 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM20AQ96MK3 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
FAM20AQ96MK3 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
FAM20AQ96MK3 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
FAM20AQ96MK3 SLC35A2-213ENST00000635015 1008 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
FAM20AQ96MK3 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
FAM20AQ96MK3 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
FAM20AQ96MK3 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
FAM20AQ96MK3 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
FAM20AQ96MK3 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
FAM20AQ96MK3 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
FAM20AQ96MK3 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
FAM20AQ96MK3 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
FAM20AQ96MK3 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
FAM20AQ96MK3 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
FAM20AQ96MK3 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
FAM20AQ96MK3 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
FAM20AQ96MK3 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
FAM20AQ96MK3 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
FAM20AQ96MK3 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
FAM20AQ96MK3 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
FAM20AQ96MK3 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
FAM20AQ96MK3 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
FAM20AQ96MK3 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
FAM20AQ96MK3 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
FAM20AQ96MK3 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
FAM20AQ96MK3 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
FAM20AQ96MK3 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
FAM20AQ96MK3 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
FAM20AQ96MK3 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
FAM20AQ96MK3 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
FAM20AQ96MK3 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
FAM20AQ96MK3 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
FAM20AQ96MK3 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
FAM20AQ96MK3 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
FAM20AQ96MK3 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
FAM20AQ96MK3 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
FAM20AQ96MK3 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
FAM20AQ96MK3 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
FAM20AQ96MK3 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
FAM20AQ96MK3 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
FAM20AQ96MK3 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
FAM20AQ96MK3 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
FAM20AQ96MK3 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
FAM20AQ96MK3 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
FAM20AQ96MK3 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
FAM20AQ96MK3 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
FAM20AQ96MK3 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
FAM20AQ96MK3 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
FAM20AQ96MK3 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
FAM20AQ96MK3 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
FAM20AQ96MK3 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
FAM20AQ96MK3 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
FAM20AQ96MK3 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
FAM20AQ96MK3 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
FAM20AQ96MK3 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
FAM20AQ96MK3 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
FAM20AQ96MK3 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
FAM20AQ96MK3 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
FAM20AQ96MK3 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
FAM20AQ96MK3 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
FAM20AQ96MK3 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
FAM20AQ96MK3 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
FAM20AQ96MK3 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
FAM20AQ96MK3 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
FAM20AQ96MK3 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
FAM20AQ96MK3 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
FAM20AQ96MK3 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
FAM20AQ96MK3 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
FAM20AQ96MK3 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
FAM20AQ96MK3 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
FAM20AQ96MK3 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
FAM20AQ96MK3 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
FAM20AQ96MK3 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
FAM20AQ96MK3 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
FAM20AQ96MK3 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
FAM20AQ96MK3 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
FAM20AQ96MK3 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
FAM20AQ96MK3 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
FAM20AQ96MK3 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
FAM20AQ96MK3 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
FAM20AQ96MK3 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
FAM20AQ96MK3 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
FAM20AQ96MK3 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
FAM20AQ96MK3 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
FAM20AQ96MK3 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
FAM20AQ96MK3 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
FAM20AQ96MK3 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
FAM20AQ96MK3 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
FAM20AQ96MK3 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
FAM20AQ96MK3 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
FAM20AQ96MK3 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
FAM20AQ96MK3 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
FAM20AQ96MK3 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
FAM20AQ96MK3 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
FAM20AQ96MK3 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
FAM20AQ96MK3 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
FAM20AQ96MK3 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
FAM20AQ96MK3 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
FAM20AQ96MK3 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
FAM20AQ96MK3 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.4 ms