Protein–RNA interactions for Protein: Q96LX7

CCDC17, Coiled-coil domain-containing protein 17, humanhuman

Predictions only

Length 622 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC17Q96LX7 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CCDC17Q96LX7 ACVR1C-203ENST00000348328 1270 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CCDC17Q96LX7 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
CCDC17Q96LX7 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CCDC17Q96LX7 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CCDC17Q96LX7 AL355075.4-201ENST00000554988 638 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
CCDC17Q96LX7 ANAPC11-207ENST00000572639 578 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CCDC17Q96LX7 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CCDC17Q96LX7 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CCDC17Q96LX7 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CCDC17Q96LX7 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CCDC17Q96LX7 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CCDC17Q96LX7 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CCDC17Q96LX7 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CCDC17Q96LX7 COQ10B-203ENST00000409398 879 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CCDC17Q96LX7 METTL21A-206ENST00000432416 869 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CCDC17Q96LX7 PHF11-218ENST00000496623 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CCDC17Q96LX7 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
CCDC17Q96LX7 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CCDC17Q96LX7 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CCDC17Q96LX7 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CCDC17Q96LX7 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CCDC17Q96LX7 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CCDC17Q96LX7 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CCDC17Q96LX7 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CCDC17Q96LX7 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CCDC17Q96LX7 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CCDC17Q96LX7 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CCDC17Q96LX7 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CCDC17Q96LX7 TSPY15P-201ENST00000457163 923 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
CCDC17Q96LX7 ATP6V0E1-204ENST00000519911 718 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CCDC17Q96LX7 C12orf76-208ENST00000551185 496 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CCDC17Q96LX7 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CCDC17Q96LX7 C1QL1P1-201ENST00000568105 661 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
CCDC17Q96LX7 TNFRSF12A-206ENST00000575124 1133 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CCDC17Q96LX7 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
CCDC17Q96LX7 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CCDC17Q96LX7 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CCDC17Q96LX7 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CCDC17Q96LX7 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CCDC17Q96LX7 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CCDC17Q96LX7 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CCDC17Q96LX7 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CCDC17Q96LX7 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CCDC17Q96LX7 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CCDC17Q96LX7 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CCDC17Q96LX7 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CCDC17Q96LX7 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CCDC17Q96LX7 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CCDC17Q96LX7 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CCDC17Q96LX7 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CCDC17Q96LX7 OR10H2-201ENST00000305899 1041 ntAPPRIS P1 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CCDC17Q96LX7 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CCDC17Q96LX7 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CCDC17Q96LX7 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CCDC17Q96LX7 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
CCDC17Q96LX7 AC016582.3-201ENST00000589653 561 ntTSL 4 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CCDC17Q96LX7 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CCDC17Q96LX7 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CCDC17Q96LX7 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CCDC17Q96LX7 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CCDC17Q96LX7 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CCDC17Q96LX7 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CCDC17Q96LX7 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CCDC17Q96LX7 CCT7-202ENST00000398422 1234 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CCDC17Q96LX7 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CCDC17Q96LX7 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CCDC17Q96LX7 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CCDC17Q96LX7 AC020913.2-201ENST00000601929 629 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CCDC17Q96LX7 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CCDC17Q96LX7 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CCDC17Q96LX7 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CCDC17Q96LX7 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CCDC17Q96LX7 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CCDC17Q96LX7 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CCDC17Q96LX7 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CCDC17Q96LX7 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CCDC17Q96LX7 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CCDC17Q96LX7 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CCDC17Q96LX7 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CCDC17Q96LX7 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CCDC17Q96LX7 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CCDC17Q96LX7 WDR37-206ENST00000620998 1303 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CCDC17Q96LX7 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CCDC17Q96LX7 AC211429.1-201ENST00000415277 523 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
CCDC17Q96LX7 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
CCDC17Q96LX7 MFSD4A-206ENST00000489709 1136 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CCDC17Q96LX7 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CCDC17Q96LX7 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CCDC17Q96LX7 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CCDC17Q96LX7 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
CCDC17Q96LX7 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CCDC17Q96LX7 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CCDC17Q96LX7 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CCDC17Q96LX7 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CCDC17Q96LX7 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CCDC17Q96LX7 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CCDC17Q96LX7 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CCDC17Q96LX7 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CCDC17Q96LX7 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30 ms