Protein–RNA interactions for Protein: Q96I25

RBM17, Splicing factor 45, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 401 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBM17Q96I25 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
RBM17Q96I25 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
RBM17Q96I25 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
RBM17Q96I25 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC24.46■■□□□ 1.51
RBM17Q96I25 IMMP2L-202ENST00000405709 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
RBM17Q96I25 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
RBM17Q96I25 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
RBM17Q96I25 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
RBM17Q96I25 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
RBM17Q96I25 ARFIP2-204ENST00000445086 1300 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
RBM17Q96I25 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
RBM17Q96I25 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
RBM17Q96I25 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
RBM17Q96I25 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
RBM17Q96I25 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
RBM17Q96I25 MIEN1-201ENST00000394231 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
RBM17Q96I25 GEMIN7-203ENST00000591607 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
RBM17Q96I25 AC006011.2-201ENST00000621313 1158 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
RBM17Q96I25 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
RBM17Q96I25 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC24.46■■□□□ 1.51
RBM17Q96I25 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
RBM17Q96I25 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
RBM17Q96I25 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
RBM17Q96I25 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.51
RBM17Q96I25 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
RBM17Q96I25 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
RBM17Q96I25 PLCG1-AS1-201ENST00000454626 1462 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
RBM17Q96I25 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
RBM17Q96I25 INSIG1-202ENST00000342407 1127 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
RBM17Q96I25 LY6E-211ENST00000521699 1256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
RBM17Q96I25 WWOX-216ENST00000569818 525 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
RBM17Q96I25 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
RBM17Q96I25 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
RBM17Q96I25 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
RBM17Q96I25 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
RBM17Q96I25 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
RBM17Q96I25 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
RBM17Q96I25 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
RBM17Q96I25 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
RBM17Q96I25 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
RBM17Q96I25 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
RBM17Q96I25 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
RBM17Q96I25 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
RBM17Q96I25 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
RBM17Q96I25 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
RBM17Q96I25 SLC25A48-202ENST00000412661 1148 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
RBM17Q96I25 SLC25A48-204ENST00000433282 1111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
RBM17Q96I25 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
RBM17Q96I25 AC012213.1-202ENST00000523422 449 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
RBM17Q96I25 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
RBM17Q96I25 AP001922.1-201ENST00000499390 1504 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
RBM17Q96I25 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
RBM17Q96I25 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
RBM17Q96I25 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
RBM17Q96I25 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
RBM17Q96I25 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
RBM17Q96I25 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
RBM17Q96I25 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
RBM17Q96I25 RXFP4-201ENST00000368318 1240 ntAPPRIS P1 BASIC24.43■■□□□ 1.5
RBM17Q96I25 PBXIP1-201ENST00000368460 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
RBM17Q96I25 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
RBM17Q96I25 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
RBM17Q96I25 AC130371.2-201ENST00000619443 611 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
RBM17Q96I25 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
RBM17Q96I25 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
RBM17Q96I25 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
RBM17Q96I25 TRAK2-202ENST00000430254 1436 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
RBM17Q96I25 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
RBM17Q96I25 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
RBM17Q96I25 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
RBM17Q96I25 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
RBM17Q96I25 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
RBM17Q96I25 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
RBM17Q96I25 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
RBM17Q96I25 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
RBM17Q96I25 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
RBM17Q96I25 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
RBM17Q96I25 GPR6-201ENST00000275169 1089 ntAPPRIS P1 BASIC24.42■■□□□ 1.5
RBM17Q96I25 PMVK-201ENST00000368467 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
RBM17Q96I25 AL139246.2-201ENST00000456687 1297 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
RBM17Q96I25 CHAC1-203ENST00000487220 853 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
RBM17Q96I25 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
RBM17Q96I25 AP002807.1-202ENST00000526897 791 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
RBM17Q96I25 LTBR-211ENST00000543190 785 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
RBM17Q96I25 SLC25A1P4-201ENST00000567977 778 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
RBM17Q96I25 FFAR4-203ENST00000604414 1142 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
RBM17Q96I25 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
RBM17Q96I25 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
RBM17Q96I25 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
RBM17Q96I25 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
RBM17Q96I25 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
RBM17Q96I25 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
RBM17Q96I25 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
RBM17Q96I25 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
RBM17Q96I25 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
RBM17Q96I25 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
RBM17Q96I25 HS2ST1-202ENST00000370551 1585 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
RBM17Q96I25 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
RBM17Q96I25 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC24.41■■□□□ 1.5
RBM17Q96I25 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.8 ms