Protein–RNA interactions for Protein: Q96DM3

C18orf8, Uncharacterized protein C18orf8, humanhuman

Predictions only

Length 657 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C18orf8Q96DM3 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
C18orf8Q96DM3 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
C18orf8Q96DM3 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
C18orf8Q96DM3 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
C18orf8Q96DM3 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
C18orf8Q96DM3 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
C18orf8Q96DM3 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
C18orf8Q96DM3 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
C18orf8Q96DM3 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
C18orf8Q96DM3 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
C18orf8Q96DM3 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
C18orf8Q96DM3 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
C18orf8Q96DM3 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
C18orf8Q96DM3 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
C18orf8Q96DM3 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
C18orf8Q96DM3 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
C18orf8Q96DM3 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
C18orf8Q96DM3 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
C18orf8Q96DM3 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
C18orf8Q96DM3 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
C18orf8Q96DM3 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
C18orf8Q96DM3 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
C18orf8Q96DM3 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
C18orf8Q96DM3 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
C18orf8Q96DM3 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
C18orf8Q96DM3 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
C18orf8Q96DM3 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
C18orf8Q96DM3 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
C18orf8Q96DM3 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
C18orf8Q96DM3 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
C18orf8Q96DM3 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
C18orf8Q96DM3 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
C18orf8Q96DM3 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
C18orf8Q96DM3 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
C18orf8Q96DM3 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
C18orf8Q96DM3 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
C18orf8Q96DM3 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
C18orf8Q96DM3 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
C18orf8Q96DM3 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
C18orf8Q96DM3 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
C18orf8Q96DM3 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
C18orf8Q96DM3 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC21.08■□□□□ 0.96
C18orf8Q96DM3 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
C18orf8Q96DM3 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.96
C18orf8Q96DM3 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
C18orf8Q96DM3 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
C18orf8Q96DM3 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
C18orf8Q96DM3 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
C18orf8Q96DM3 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
C18orf8Q96DM3 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
C18orf8Q96DM3 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC21.07■□□□□ 0.96
C18orf8Q96DM3 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
C18orf8Q96DM3 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
C18orf8Q96DM3 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
C18orf8Q96DM3 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
C18orf8Q96DM3 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
C18orf8Q96DM3 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
C18orf8Q96DM3 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
C18orf8Q96DM3 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
C18orf8Q96DM3 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
C18orf8Q96DM3 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
C18orf8Q96DM3 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
C18orf8Q96DM3 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
C18orf8Q96DM3 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
C18orf8Q96DM3 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
C18orf8Q96DM3 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
C18orf8Q96DM3 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
C18orf8Q96DM3 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
C18orf8Q96DM3 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
C18orf8Q96DM3 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
C18orf8Q96DM3 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
C18orf8Q96DM3 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
C18orf8Q96DM3 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
C18orf8Q96DM3 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
C18orf8Q96DM3 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
C18orf8Q96DM3 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
C18orf8Q96DM3 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
C18orf8Q96DM3 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
C18orf8Q96DM3 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
C18orf8Q96DM3 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
C18orf8Q96DM3 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
C18orf8Q96DM3 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
C18orf8Q96DM3 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
C18orf8Q96DM3 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
C18orf8Q96DM3 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
C18orf8Q96DM3 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
C18orf8Q96DM3 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC21.05■□□□□ 0.96
C18orf8Q96DM3 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
C18orf8Q96DM3 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC21.05■□□□□ 0.96
C18orf8Q96DM3 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
C18orf8Q96DM3 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
C18orf8Q96DM3 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
C18orf8Q96DM3 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
C18orf8Q96DM3 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
C18orf8Q96DM3 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
C18orf8Q96DM3 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
C18orf8Q96DM3 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
C18orf8Q96DM3 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
C18orf8Q96DM3 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
C18orf8Q96DM3 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.9 ms