Protein–RNA interactions for Protein: Q96CS3

FAF2, FAS-associated factor 2, humanhuman

Predictions only

Length 445 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAF2Q96CS3 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
FAF2Q96CS3 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
FAF2Q96CS3 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
FAF2Q96CS3 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
FAF2Q96CS3 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
FAF2Q96CS3 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
FAF2Q96CS3 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
FAF2Q96CS3 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
FAF2Q96CS3 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
FAF2Q96CS3 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
FAF2Q96CS3 CD2AP-201ENST00000359314 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
FAF2Q96CS3 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
FAF2Q96CS3 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
FAF2Q96CS3 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
FAF2Q96CS3 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
FAF2Q96CS3 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
FAF2Q96CS3 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
FAF2Q96CS3 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
FAF2Q96CS3 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
FAF2Q96CS3 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
FAF2Q96CS3 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
FAF2Q96CS3 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
FAF2Q96CS3 STX6-204ENST00000542060 4809 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
FAF2Q96CS3 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC20.59■□□□□ 0.89
FAF2Q96CS3 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
FAF2Q96CS3 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
FAF2Q96CS3 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
FAF2Q96CS3 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
FAF2Q96CS3 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
FAF2Q96CS3 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
FAF2Q96CS3 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
FAF2Q96CS3 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
FAF2Q96CS3 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.89
FAF2Q96CS3 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
FAF2Q96CS3 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
FAF2Q96CS3 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
FAF2Q96CS3 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
FAF2Q96CS3 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
FAF2Q96CS3 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
FAF2Q96CS3 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
FAF2Q96CS3 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
FAF2Q96CS3 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
FAF2Q96CS3 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
FAF2Q96CS3 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
FAF2Q96CS3 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
FAF2Q96CS3 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.89
FAF2Q96CS3 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.89
FAF2Q96CS3 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
FAF2Q96CS3 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
FAF2Q96CS3 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
FAF2Q96CS3 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
FAF2Q96CS3 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
FAF2Q96CS3 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
FAF2Q96CS3 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
FAF2Q96CS3 SREBF2-209ENST00000612482 5365 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
FAF2Q96CS3 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
FAF2Q96CS3 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
FAF2Q96CS3 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.88
FAF2Q96CS3 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
FAF2Q96CS3 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
FAF2Q96CS3 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
FAF2Q96CS3 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
FAF2Q96CS3 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
FAF2Q96CS3 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
FAF2Q96CS3 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
FAF2Q96CS3 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
FAF2Q96CS3 BRPF3-202ENST00000357641 6052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
FAF2Q96CS3 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
FAF2Q96CS3 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
FAF2Q96CS3 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
FAF2Q96CS3 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
FAF2Q96CS3 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC20.57■□□□□ 0.88
FAF2Q96CS3 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
FAF2Q96CS3 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
FAF2Q96CS3 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
FAF2Q96CS3 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
FAF2Q96CS3 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
FAF2Q96CS3 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
FAF2Q96CS3 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
FAF2Q96CS3 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
FAF2Q96CS3 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
FAF2Q96CS3 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
FAF2Q96CS3 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
FAF2Q96CS3 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
FAF2Q96CS3 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
FAF2Q96CS3 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
FAF2Q96CS3 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
FAF2Q96CS3 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
FAF2Q96CS3 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
FAF2Q96CS3 ZSWIM8-220ENST00000604524 5465 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
FAF2Q96CS3 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
FAF2Q96CS3 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
FAF2Q96CS3 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
FAF2Q96CS3 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
FAF2Q96CS3 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
FAF2Q96CS3 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
FAF2Q96CS3 ZDHHC18-202ENST00000374142 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
FAF2Q96CS3 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
FAF2Q96CS3 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
FAF2Q96CS3 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.5 ms