Protein–RNA interactions for Protein: Q96A33

CCDC47, Coiled-coil domain-containing protein 47, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 483 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC47Q96A33 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CCDC47Q96A33 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CCDC47Q96A33 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CCDC47Q96A33 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CCDC47Q96A33 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
CCDC47Q96A33 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CCDC47Q96A33 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CCDC47Q96A33 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CCDC47Q96A33 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CCDC47Q96A33 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CCDC47Q96A33 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CCDC47Q96A33 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CCDC47Q96A33 CACNA1A-247ENST00000637769 8648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CCDC47Q96A33 SLC29A4-202ENST00000396872 5685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
CCDC47Q96A33 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CCDC47Q96A33 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CCDC47Q96A33 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
CCDC47Q96A33 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CCDC47Q96A33 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
CCDC47Q96A33 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CCDC47Q96A33 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
CCDC47Q96A33 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CCDC47Q96A33 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CCDC47Q96A33 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CCDC47Q96A33 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CCDC47Q96A33 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CCDC47Q96A33 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CCDC47Q96A33 DAG1-219ENST00000538711 5582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CCDC47Q96A33 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCDC47Q96A33 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCDC47Q96A33 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCDC47Q96A33 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCDC47Q96A33 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCDC47Q96A33 CHST2-201ENST00000309575 4582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCDC47Q96A33 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
CCDC47Q96A33 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
CCDC47Q96A33 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCDC47Q96A33 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
CCDC47Q96A33 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCDC47Q96A33 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCDC47Q96A33 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCDC47Q96A33 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCDC47Q96A33 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
CCDC47Q96A33 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCDC47Q96A33 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCDC47Q96A33 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCDC47Q96A33 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCDC47Q96A33 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCDC47Q96A33 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCDC47Q96A33 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCDC47Q96A33 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CCDC47Q96A33 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CCDC47Q96A33 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CCDC47Q96A33 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CCDC47Q96A33 FAM46A-203ENST00000369756 5537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CCDC47Q96A33 GRB10-208ENST00000403097 5432 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CCDC47Q96A33 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CCDC47Q96A33 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CCDC47Q96A33 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CCDC47Q96A33 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
CCDC47Q96A33 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CCDC47Q96A33 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CCDC47Q96A33 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CCDC47Q96A33 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CCDC47Q96A33 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CCDC47Q96A33 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
CCDC47Q96A33 DACH1-202ENST00000613252 5233 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CCDC47Q96A33 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CCDC47Q96A33 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CCDC47Q96A33 SULF2-201ENST00000359930 4915 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CCDC47Q96A33 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CCDC47Q96A33 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CCDC47Q96A33 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CCDC47Q96A33 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CCDC47Q96A33 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CCDC47Q96A33 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CCDC47Q96A33 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
CCDC47Q96A33 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CCDC47Q96A33 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CCDC47Q96A33 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CCDC47Q96A33 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CCDC47Q96A33 STX6-201ENST00000258301 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CCDC47Q96A33 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CCDC47Q96A33 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CCDC47Q96A33 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
CCDC47Q96A33 CASR-204ENST00000638421 5088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CCDC47Q96A33 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CCDC47Q96A33 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CCDC47Q96A33 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CCDC47Q96A33 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CCDC47Q96A33 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CCDC47Q96A33 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CCDC47Q96A33 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CCDC47Q96A33 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CCDC47Q96A33 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CCDC47Q96A33 PLEKHG5-206ENST00000377748 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CCDC47Q96A33 ZBTB4-201ENST00000311403 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CCDC47Q96A33 SYNM-204ENST00000594047 6407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CCDC47Q96A33 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CCDC47Q96A33 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
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