Protein–RNA interactions for Protein: Q8N2M8

CLASRP, CLK4-associating serine/arginine rich protein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 674 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLASRPQ8N2M8 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CLASRPQ8N2M8 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CLASRPQ8N2M8 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CLASRPQ8N2M8 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CLASRPQ8N2M8 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CLASRPQ8N2M8 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CLASRPQ8N2M8 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CLASRPQ8N2M8 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CLASRPQ8N2M8 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CLASRPQ8N2M8 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CLASRPQ8N2M8 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
CLASRPQ8N2M8 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CLASRPQ8N2M8 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CLASRPQ8N2M8 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CLASRPQ8N2M8 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CLASRPQ8N2M8 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CLASRPQ8N2M8 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CLASRPQ8N2M8 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CLASRPQ8N2M8 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CLASRPQ8N2M8 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CLASRPQ8N2M8 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CLASRPQ8N2M8 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CLASRPQ8N2M8 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CLASRPQ8N2M8 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CLASRPQ8N2M8 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CLASRPQ8N2M8 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CLASRPQ8N2M8 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CLASRPQ8N2M8 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CLASRPQ8N2M8 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CLASRPQ8N2M8 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CLASRPQ8N2M8 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
CLASRPQ8N2M8 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
CLASRPQ8N2M8 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
CLASRPQ8N2M8 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
CLASRPQ8N2M8 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
CLASRPQ8N2M8 AC116351.2-201ENST00000606540 1585 ntBASIC24.39■■□□□ 1.5
CLASRPQ8N2M8 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
CLASRPQ8N2M8 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.5
CLASRPQ8N2M8 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
CLASRPQ8N2M8 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
CLASRPQ8N2M8 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
CLASRPQ8N2M8 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
CLASRPQ8N2M8 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
CLASRPQ8N2M8 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
CLASRPQ8N2M8 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
CLASRPQ8N2M8 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
CLASRPQ8N2M8 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
CLASRPQ8N2M8 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
CLASRPQ8N2M8 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CLASRPQ8N2M8 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CLASRPQ8N2M8 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CLASRPQ8N2M8 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CLASRPQ8N2M8 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CLASRPQ8N2M8 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CLASRPQ8N2M8 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CLASRPQ8N2M8 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CLASRPQ8N2M8 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CLASRPQ8N2M8 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CLASRPQ8N2M8 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CLASRPQ8N2M8 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CLASRPQ8N2M8 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CLASRPQ8N2M8 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CLASRPQ8N2M8 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CLASRPQ8N2M8 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
CLASRPQ8N2M8 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CLASRPQ8N2M8 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
CLASRPQ8N2M8 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CLASRPQ8N2M8 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CLASRPQ8N2M8 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CLASRPQ8N2M8 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CLASRPQ8N2M8 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CLASRPQ8N2M8 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CLASRPQ8N2M8 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
CLASRPQ8N2M8 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CLASRPQ8N2M8 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CLASRPQ8N2M8 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CLASRPQ8N2M8 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CLASRPQ8N2M8 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CLASRPQ8N2M8 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CLASRPQ8N2M8 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CLASRPQ8N2M8 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CLASRPQ8N2M8 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CLASRPQ8N2M8 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CLASRPQ8N2M8 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CLASRPQ8N2M8 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
CLASRPQ8N2M8 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CLASRPQ8N2M8 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CLASRPQ8N2M8 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CLASRPQ8N2M8 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
CLASRPQ8N2M8 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CLASRPQ8N2M8 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CLASRPQ8N2M8 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CLASRPQ8N2M8 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CLASRPQ8N2M8 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CLASRPQ8N2M8 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CLASRPQ8N2M8 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CLASRPQ8N2M8 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CLASRPQ8N2M8 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CLASRPQ8N2M8 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CLASRPQ8N2M8 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.2 ms