Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZW31

SYDE1, Rho GTPase-activating protein SYDE1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 735 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYDE1Q6ZW31 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SYDE1Q6ZW31 IDUA-201ENST00000247933 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
SYDE1Q6ZW31 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
SYDE1Q6ZW31 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
SYDE1Q6ZW31 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
SYDE1Q6ZW31 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
SYDE1Q6ZW31 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
SYDE1Q6ZW31 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
SYDE1Q6ZW31 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
SYDE1Q6ZW31 AC004408.2-201ENST00000623613 2777 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
SYDE1Q6ZW31 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
SYDE1Q6ZW31 SPTBN4-207ENST00000595535 6105 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
SYDE1Q6ZW31 KDM5C-203ENST00000375383 5122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
SYDE1Q6ZW31 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
SYDE1Q6ZW31 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.86
SYDE1Q6ZW31 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
SYDE1Q6ZW31 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
SYDE1Q6ZW31 ARMC6-220ENST00000546344 1814 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.86
SYDE1Q6ZW31 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
SYDE1Q6ZW31 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
SYDE1Q6ZW31 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
SYDE1Q6ZW31 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC20.39■□□□□ 0.85
SYDE1Q6ZW31 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.85
SYDE1Q6ZW31 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.85
SYDE1Q6ZW31 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.85
SYDE1Q6ZW31 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
SYDE1Q6ZW31 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
SYDE1Q6ZW31 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
SYDE1Q6ZW31 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
SYDE1Q6ZW31 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
SYDE1Q6ZW31 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
SYDE1Q6ZW31 FBXO31-201ENST00000311635 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SYDE1Q6ZW31 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SYDE1Q6ZW31 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
SYDE1Q6ZW31 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
SYDE1Q6ZW31 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SYDE1Q6ZW31 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
SYDE1Q6ZW31 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
SYDE1Q6ZW31 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SYDE1Q6ZW31 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SYDE1Q6ZW31 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SYDE1Q6ZW31 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
SYDE1Q6ZW31 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
SYDE1Q6ZW31 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
SYDE1Q6ZW31 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
SYDE1Q6ZW31 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
SYDE1Q6ZW31 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
SYDE1Q6ZW31 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
SYDE1Q6ZW31 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SYDE1Q6ZW31 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
SYDE1Q6ZW31 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
SYDE1Q6ZW31 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SYDE1Q6ZW31 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SYDE1Q6ZW31 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SYDE1Q6ZW31 SLC5A10-205ENST00000417251 1984 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
SYDE1Q6ZW31 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SYDE1Q6ZW31 GCGR-202ENST00000570996 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
SYDE1Q6ZW31 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
SYDE1Q6ZW31 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
SYDE1Q6ZW31 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SYDE1Q6ZW31 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SYDE1Q6ZW31 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SYDE1Q6ZW31 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
SYDE1Q6ZW31 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC20.37■□□□□ 0.85
SYDE1Q6ZW31 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
SYDE1Q6ZW31 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC20.37■□□□□ 0.85
SYDE1Q6ZW31 KCNQ5-201ENST00000342056 6688 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
SYDE1Q6ZW31 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SYDE1Q6ZW31 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SYDE1Q6ZW31 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
SYDE1Q6ZW31 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SYDE1Q6ZW31 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
SYDE1Q6ZW31 KIF26A-202ENST00000423312 5649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
SYDE1Q6ZW31 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SYDE1Q6ZW31 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SYDE1Q6ZW31 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
SYDE1Q6ZW31 SAMD14-203ENST00000503131 1938 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SYDE1Q6ZW31 SLC27A1-204ENST00000598424 2681 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
SYDE1Q6ZW31 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SYDE1Q6ZW31 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
SYDE1Q6ZW31 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC20.37■□□□□ 0.85
SYDE1Q6ZW31 INSR-201ENST00000302850 4721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SYDE1Q6ZW31 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SYDE1Q6ZW31 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SYDE1Q6ZW31 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
SYDE1Q6ZW31 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
SYDE1Q6ZW31 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
SYDE1Q6ZW31 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
SYDE1Q6ZW31 ROR1-201ENST00000371079 5832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SYDE1Q6ZW31 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SYDE1Q6ZW31 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SYDE1Q6ZW31 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SYDE1Q6ZW31 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SYDE1Q6ZW31 ORAI2-204ENST00000473939 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SYDE1Q6ZW31 ATP6V0E2-203ENST00000456496 2722 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SYDE1Q6ZW31 ATP6V0E2-213ENST00000615196 2727 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SYDE1Q6ZW31 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SYDE1Q6ZW31 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SYDE1Q6ZW31 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SYDE1Q6ZW31 ACVR1C-201ENST00000243349 8994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.7 ms