Protein–RNA interactions for Protein: Q6NTF7

APOBEC3H, DNA dC->dU-editing enzyme APOBEC-3H, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 200 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOBEC3HQ6NTF7 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
APOBEC3HQ6NTF7 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
APOBEC3HQ6NTF7 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
APOBEC3HQ6NTF7 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
APOBEC3HQ6NTF7 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
APOBEC3HQ6NTF7 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
APOBEC3HQ6NTF7 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
APOBEC3HQ6NTF7 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
APOBEC3HQ6NTF7 DHRS4L2-202ENST00000397071 1117 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
APOBEC3HQ6NTF7 ATP5S-204ENST00000426751 1171 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
APOBEC3HQ6NTF7 AL109797.1-201ENST00000452501 835 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
APOBEC3HQ6NTF7 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
APOBEC3HQ6NTF7 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
APOBEC3HQ6NTF7 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
APOBEC3HQ6NTF7 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
APOBEC3HQ6NTF7 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
APOBEC3HQ6NTF7 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
APOBEC3HQ6NTF7 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
APOBEC3HQ6NTF7 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
APOBEC3HQ6NTF7 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
APOBEC3HQ6NTF7 PTCRA-201ENST00000304672 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
APOBEC3HQ6NTF7 AC099329.3-201ENST00000431549 602 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.61■■□□□ 1.37
APOBEC3HQ6NTF7 PTCRA-202ENST00000441198 1005 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
APOBEC3HQ6NTF7 PTCRA-203ENST00000446507 759 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
APOBEC3HQ6NTF7 AC011506.1-201ENST00000474329 610 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
APOBEC3HQ6NTF7 CHCHD6-204ENST00000508789 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
APOBEC3HQ6NTF7 TMEM235-204ENST00000551068 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
APOBEC3HQ6NTF7 AC026271.3-201ENST00000571884 352 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
APOBEC3HQ6NTF7 ARHGDIA-207ENST00000580685 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
APOBEC3HQ6NTF7 RPS27A-211ENST00000639844 606 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
APOBEC3HQ6NTF7 AC097662.2-201ENST00000641359 267 ntAPPRIS P1 BASIC23.61■■□□□ 1.37
APOBEC3HQ6NTF7 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
APOBEC3HQ6NTF7 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
APOBEC3HQ6NTF7 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
APOBEC3HQ6NTF7 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
APOBEC3HQ6NTF7 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
APOBEC3HQ6NTF7 AC073508.3-201ENST00000619697 1419 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
APOBEC3HQ6NTF7 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
APOBEC3HQ6NTF7 PRDX5-201ENST00000265462 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
APOBEC3HQ6NTF7 AC113347.1-201ENST00000413321 391 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
APOBEC3HQ6NTF7 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
APOBEC3HQ6NTF7 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
APOBEC3HQ6NTF7 B3GAT3P1-201ENST00000471720 806 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
APOBEC3HQ6NTF7 ASPHD1-203ENST00000483405 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
APOBEC3HQ6NTF7 SLC52A2-205ENST00000526752 710 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
APOBEC3HQ6NTF7 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
APOBEC3HQ6NTF7 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC23.6■■□□□ 1.37
APOBEC3HQ6NTF7 AC008735.6-201ENST00000635964 1292 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
APOBEC3HQ6NTF7 FSCN1P1-201ENST00000568912 1481 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
APOBEC3HQ6NTF7 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
APOBEC3HQ6NTF7 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
APOBEC3HQ6NTF7 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
APOBEC3HQ6NTF7 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
APOBEC3HQ6NTF7 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
APOBEC3HQ6NTF7 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
APOBEC3HQ6NTF7 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
APOBEC3HQ6NTF7 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
APOBEC3HQ6NTF7 PRR31-201ENST00000371629 978 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
APOBEC3HQ6NTF7 CRAT-202ENST00000393384 973 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
APOBEC3HQ6NTF7 TMEM185A-204ENST00000507237 903 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
APOBEC3HQ6NTF7 SIGLEC15-202ENST00000546268 1054 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
APOBEC3HQ6NTF7 SLC25A3-211ENST00000548847 1369 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
APOBEC3HQ6NTF7 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
APOBEC3HQ6NTF7 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
APOBEC3HQ6NTF7 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
APOBEC3HQ6NTF7 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
APOBEC3HQ6NTF7 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
APOBEC3HQ6NTF7 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
APOBEC3HQ6NTF7 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
APOBEC3HQ6NTF7 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
APOBEC3HQ6NTF7 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
APOBEC3HQ6NTF7 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
APOBEC3HQ6NTF7 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
APOBEC3HQ6NTF7 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
APOBEC3HQ6NTF7 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
APOBEC3HQ6NTF7 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
APOBEC3HQ6NTF7 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
APOBEC3HQ6NTF7 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
APOBEC3HQ6NTF7 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
APOBEC3HQ6NTF7 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
APOBEC3HQ6NTF7 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
APOBEC3HQ6NTF7 KRT18P35-201ENST00000510488 1269 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
APOBEC3HQ6NTF7 STAC3-202ENST00000546246 1014 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
APOBEC3HQ6NTF7 AP005263.1-201ENST00000579126 914 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
APOBEC3HQ6NTF7 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
APOBEC3HQ6NTF7 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
APOBEC3HQ6NTF7 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
APOBEC3HQ6NTF7 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
APOBEC3HQ6NTF7 KRT18P22-201ENST00000402024 1347 ntBASIC23.58■■□□□ 1.36
APOBEC3HQ6NTF7 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
APOBEC3HQ6NTF7 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
APOBEC3HQ6NTF7 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
APOBEC3HQ6NTF7 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
APOBEC3HQ6NTF7 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
APOBEC3HQ6NTF7 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
APOBEC3HQ6NTF7 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
APOBEC3HQ6NTF7 TERF1P1-201ENST00000311003 1181 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
APOBEC3HQ6NTF7 AL035541.1-201ENST00000424850 823 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
APOBEC3HQ6NTF7 AL445645.1-201ENST00000451318 1019 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
APOBEC3HQ6NTF7 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.1 ms