Protein–RNA interactions for Protein: Q5VX71

SUSD4, Sushi domain-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 490 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SUSD4Q5VX71 AC073508.3-201ENST00000619697 1419 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
SUSD4Q5VX71 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
SUSD4Q5VX71 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
SUSD4Q5VX71 ASPHD1-203ENST00000483405 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
SUSD4Q5VX71 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
SUSD4Q5VX71 AL049597.2-201ENST00000565575 961 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
SUSD4Q5VX71 AC097662.2-201ENST00000641359 267 ntAPPRIS P1 BASIC24.79■■□□□ 1.56
SUSD4Q5VX71 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
SUSD4Q5VX71 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
SUSD4Q5VX71 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
SUSD4Q5VX71 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
SUSD4Q5VX71 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
SUSD4Q5VX71 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
SUSD4Q5VX71 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
SUSD4Q5VX71 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
SUSD4Q5VX71 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
SUSD4Q5VX71 TERF1P1-201ENST00000311003 1181 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
SUSD4Q5VX71 PRR31-201ENST00000371629 978 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
SUSD4Q5VX71 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
SUSD4Q5VX71 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
SUSD4Q5VX71 LY6L-201ENST00000562505 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
SUSD4Q5VX71 AP005263.1-201ENST00000579126 914 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
SUSD4Q5VX71 KRT18P22-201ENST00000402024 1347 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
SUSD4Q5VX71 ILK-203ENST00000420936 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
SUSD4Q5VX71 SLC25A3-211ENST00000548847 1369 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
SUSD4Q5VX71 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
SUSD4Q5VX71 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SUSD4Q5VX71 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SUSD4Q5VX71 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SUSD4Q5VX71 FSCN1P1-201ENST00000568912 1481 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
SUSD4Q5VX71 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
SUSD4Q5VX71 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
SUSD4Q5VX71 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SUSD4Q5VX71 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SUSD4Q5VX71 OXT-201ENST00000217386 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SUSD4Q5VX71 HES7-201ENST00000317814 678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SUSD4Q5VX71 B3GAT3P1-201ENST00000471720 806 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
SUSD4Q5VX71 ST20-202ENST00000485386 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SUSD4Q5VX71 TMA16-209ENST00000513272 803 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
SUSD4Q5VX71 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
SUSD4Q5VX71 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
SUSD4Q5VX71 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
SUSD4Q5VX71 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SUSD4Q5VX71 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SUSD4Q5VX71 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
SUSD4Q5VX71 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC24.76■■□□□ 1.55
SUSD4Q5VX71 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SUSD4Q5VX71 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SUSD4Q5VX71 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SUSD4Q5VX71 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
SUSD4Q5VX71 METTL5-201ENST00000260953 1010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SUSD4Q5VX71 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SUSD4Q5VX71 TAPBP-236ENST00000456592 817 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
SUSD4Q5VX71 TMEM185A-204ENST00000507237 903 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
SUSD4Q5VX71 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SUSD4Q5VX71 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SUSD4Q5VX71 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
SUSD4Q5VX71 AL445686.2-201ENST00000577528 1445 ntTSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
SUSD4Q5VX71 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
SUSD4Q5VX71 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SUSD4Q5VX71 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
SUSD4Q5VX71 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SUSD4Q5VX71 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SUSD4Q5VX71 MAGI2-AS3-203ENST00000424477 520 ntTSL 4 BASIC24.75■■□□□ 1.55
SUSD4Q5VX71 ZNF337-AS1-204ENST00000428254 817 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
SUSD4Q5VX71 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
SUSD4Q5VX71 AC103564.1-201ENST00000437330 562 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
SUSD4Q5VX71 SLC25A3P1-201ENST00000443844 931 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
SUSD4Q5VX71 AL445645.1-201ENST00000451318 1019 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
SUSD4Q5VX71 ABHD11-207ENST00000458339 890 ntTSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
SUSD4Q5VX71 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SUSD4Q5VX71 STAC3-202ENST00000546246 1014 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
SUSD4Q5VX71 SLC39A2-203ENST00000554422 1259 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SUSD4Q5VX71 CFL2-205ENST00000555765 632 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
SUSD4Q5VX71 AC026271.3-201ENST00000571884 352 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
SUSD4Q5VX71 RBM42-202ENST00000586618 771 ntTSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
SUSD4Q5VX71 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
SUSD4Q5VX71 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SUSD4Q5VX71 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SUSD4Q5VX71 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SUSD4Q5VX71 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
SUSD4Q5VX71 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SUSD4Q5VX71 ARMC10P1-201ENST00000313754 855 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
SUSD4Q5VX71 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
SUSD4Q5VX71 SELENOF-202ENST00000370554 1220 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SUSD4Q5VX71 AL731557.1-201ENST00000425264 744 ntTSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
SUSD4Q5VX71 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
SUSD4Q5VX71 AC134772.1-201ENST00000438872 885 ntTSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
SUSD4Q5VX71 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC24.74■■□□□ 1.55
SUSD4Q5VX71 AC126696.3-202ENST00000570159 553 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
SUSD4Q5VX71 NT5C-211ENST00000582170 653 ntTSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
SUSD4Q5VX71 CIRBP-217ENST00000588230 1013 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
SUSD4Q5VX71 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
SUSD4Q5VX71 AC008649.1-201ENST00000589557 516 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
SUSD4Q5VX71 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SUSD4Q5VX71 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SUSD4Q5VX71 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SUSD4Q5VX71 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SUSD4Q5VX71 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
SUSD4Q5VX71 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.8 ms