Protein–RNA interactions for Protein: Q5VW36

FOCAD, Focadhesin, humanhuman

Predictions only

Length 1,801 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOCADQ5VW36 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
FOCADQ5VW36 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
FOCADQ5VW36 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
FOCADQ5VW36 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
FOCADQ5VW36 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
FOCADQ5VW36 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
FOCADQ5VW36 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
FOCADQ5VW36 LINC01184-202ENST00000501173 949 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
FOCADQ5VW36 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
FOCADQ5VW36 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
FOCADQ5VW36 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
FOCADQ5VW36 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
FOCADQ5VW36 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
FOCADQ5VW36 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
FOCADQ5VW36 METTL21A-201ENST00000272839 1210 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
FOCADQ5VW36 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
FOCADQ5VW36 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
FOCADQ5VW36 SPINK2-206ENST00000618802 608 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
FOCADQ5VW36 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
FOCADQ5VW36 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
FOCADQ5VW36 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
FOCADQ5VW36 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
FOCADQ5VW36 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
FOCADQ5VW36 RXFP4-201ENST00000368318 1240 ntAPPRIS P1 BASIC23.43■■□□□ 1.34
FOCADQ5VW36 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
FOCADQ5VW36 AC004803.1-203ENST00000539259 501 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
FOCADQ5VW36 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
FOCADQ5VW36 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
FOCADQ5VW36 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
FOCADQ5VW36 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
FOCADQ5VW36 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
FOCADQ5VW36 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
FOCADQ5VW36 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
FOCADQ5VW36 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
FOCADQ5VW36 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
FOCADQ5VW36 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
FOCADQ5VW36 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
FOCADQ5VW36 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
FOCADQ5VW36 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
FOCADQ5VW36 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
FOCADQ5VW36 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
FOCADQ5VW36 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
FOCADQ5VW36 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
FOCADQ5VW36 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
FOCADQ5VW36 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
FOCADQ5VW36 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
FOCADQ5VW36 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
FOCADQ5VW36 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
FOCADQ5VW36 IGFBP7-AS1-201ENST00000499667 1389 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
FOCADQ5VW36 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
FOCADQ5VW36 CROCCP4-202ENST00000633627 573 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
FOCADQ5VW36 AC097493.4-201ENST00000641197 219 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
FOCADQ5VW36 AL031985.4-201ENST00000642138 673 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
FOCADQ5VW36 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
FOCADQ5VW36 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
FOCADQ5VW36 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
FOCADQ5VW36 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
FOCADQ5VW36 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
FOCADQ5VW36 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
FOCADQ5VW36 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
FOCADQ5VW36 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
FOCADQ5VW36 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
FOCADQ5VW36 RCN1P1-201ENST00000400413 996 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
FOCADQ5VW36 PPP1R14BP5-201ENST00000440334 435 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
FOCADQ5VW36 NUBP2-206ENST00000565134 815 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
FOCADQ5VW36 RN7SL850P-201ENST00000579959 291 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
FOCADQ5VW36 AL445675.2-201ENST00000620291 557 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
FOCADQ5VW36 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
FOCADQ5VW36 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
FOCADQ5VW36 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
FOCADQ5VW36 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
FOCADQ5VW36 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
FOCADQ5VW36 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
FOCADQ5VW36 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
FOCADQ5VW36 CACYBP-202ENST00000405362 1059 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
FOCADQ5VW36 AL355355.2-201ENST00000442321 338 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
FOCADQ5VW36 DGCR10-201ENST00000609839 495 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
FOCADQ5VW36 AC133561.5-201ENST00000635547 218 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
FOCADQ5VW36 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
FOCADQ5VW36 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
FOCADQ5VW36 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
FOCADQ5VW36 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
FOCADQ5VW36 CEMP1-202ENST00000567119 1374 ntAPPRIS P2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
FOCADQ5VW36 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
FOCADQ5VW36 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
FOCADQ5VW36 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
FOCADQ5VW36 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
FOCADQ5VW36 AC211429.1-201ENST00000415277 523 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
FOCADQ5VW36 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
FOCADQ5VW36 CHAC1-203ENST00000487220 853 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
FOCADQ5VW36 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
FOCADQ5VW36 C17orf62-230ENST00000583617 866 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
FOCADQ5VW36 PHOSPHO2-206ENST00000616481 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
FOCADQ5VW36 PHOSPHO2-208ENST00000617738 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
FOCADQ5VW36 NTAN1-211ENST00000622833 1049 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
FOCADQ5VW36 NTAN1-212ENST00000624579 1115 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
FOCADQ5VW36 AC012414.5-201ENST00000564214 1602 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
FOCADQ5VW36 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
FOCADQ5VW36 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
FOCADQ5VW36 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.4 ms