Protein–RNA interactions for Protein: Q5TGL8

PXDC1, PX domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 231 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PXDC1Q5TGL8 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PXDC1Q5TGL8 ZBTB16-202ENST00000392996 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PXDC1Q5TGL8 CLCN2-205ENST00000457512 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PXDC1Q5TGL8 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PXDC1Q5TGL8 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PXDC1Q5TGL8 SEMA3B-209ENST00000456560 2221 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PXDC1Q5TGL8 ZNF623-203ENST00000526926 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PXDC1Q5TGL8 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
PXDC1Q5TGL8 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PXDC1Q5TGL8 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PXDC1Q5TGL8 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PXDC1Q5TGL8 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PXDC1Q5TGL8 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PXDC1Q5TGL8 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PXDC1Q5TGL8 NELFA-216ENST00000542778 2465 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PXDC1Q5TGL8 NTRK1-202ENST00000368196 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PXDC1Q5TGL8 CPT2-208ENST00000636891 2746 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PXDC1Q5TGL8 CPT2-210ENST00000637252 2739 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PXDC1Q5TGL8 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PXDC1Q5TGL8 RFTN1-201ENST00000334133 2982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PXDC1Q5TGL8 RUNX2-202ENST00000371432 5487 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PXDC1Q5TGL8 TCP11-201ENST00000244645 2018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PXDC1Q5TGL8 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PXDC1Q5TGL8 SPAST-202ENST00000345662 5116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PXDC1Q5TGL8 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PXDC1Q5TGL8 SKOR1-204ENST00000554240 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PXDC1Q5TGL8 MPP5-201ENST00000261681 5552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PXDC1Q5TGL8 SLC9A1-203ENST00000374086 2183 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PXDC1Q5TGL8 AC006064.2-201ENST00000501075 2196 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PXDC1Q5TGL8 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PXDC1Q5TGL8 DOLPP1-203ENST00000406974 2037 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PXDC1Q5TGL8 AMDHD2-203ENST00000413459 2049 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PXDC1Q5TGL8 PCDH7-201ENST00000361762 6403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PXDC1Q5TGL8 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PXDC1Q5TGL8 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PXDC1Q5TGL8 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PXDC1Q5TGL8 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PXDC1Q5TGL8 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PXDC1Q5TGL8 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PXDC1Q5TGL8 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PXDC1Q5TGL8 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PXDC1Q5TGL8 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PXDC1Q5TGL8 RASL11B-201ENST00000248706 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PXDC1Q5TGL8 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PXDC1Q5TGL8 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PXDC1Q5TGL8 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PXDC1Q5TGL8 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PXDC1Q5TGL8 C17orf113-201ENST00000587304 3746 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PXDC1Q5TGL8 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PXDC1Q5TGL8 STK39-201ENST00000355999 3820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PXDC1Q5TGL8 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
PXDC1Q5TGL8 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PXDC1Q5TGL8 FNDC5-201ENST00000373471 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PXDC1Q5TGL8 SHISA5-220ENST00000619810 2385 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
PXDC1Q5TGL8 SAMD5-201ENST00000367474 6089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
PXDC1Q5TGL8 CPEB2-207ENST00000507071 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PXDC1Q5TGL8 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
PXDC1Q5TGL8 RWDD4-202ENST00000327570 2590 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
PXDC1Q5TGL8 RNF187-201ENST00000305943 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PXDC1Q5TGL8 KCNMA1-278ENST00000640141 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
PXDC1Q5TGL8 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PXDC1Q5TGL8 RBM15B-201ENST00000563281 6641 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
PXDC1Q5TGL8 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PXDC1Q5TGL8 TTLL10-203ENST00000379290 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PXDC1Q5TGL8 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PXDC1Q5TGL8 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
PXDC1Q5TGL8 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
PXDC1Q5TGL8 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
PXDC1Q5TGL8 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
PXDC1Q5TGL8 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
PXDC1Q5TGL8 MAFB-201ENST00000373313 3393 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
PXDC1Q5TGL8 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PXDC1Q5TGL8 PCDH7-206ENST00000543491 4457 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
PXDC1Q5TGL8 SNAP47-201ENST00000315781 2367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PXDC1Q5TGL8 CCDC137-201ENST00000329214 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PXDC1Q5TGL8 HOXB3-205ENST00000470495 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PXDC1Q5TGL8 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PXDC1Q5TGL8 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
PXDC1Q5TGL8 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
PXDC1Q5TGL8 BET1L-203ENST00000382762 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
PXDC1Q5TGL8 PIGQ-206ENST00000422307 2052 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.22
PXDC1Q5TGL8 GCH1-204ENST00000491895 2943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
PXDC1Q5TGL8 TBC1D19-201ENST00000264866 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PXDC1Q5TGL8 AC068880.1-201ENST00000507289 2297 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
PXDC1Q5TGL8 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PXDC1Q5TGL8 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PXDC1Q5TGL8 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PXDC1Q5TGL8 IGSF9B-206ENST00000533871 5050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PXDC1Q5TGL8 PDK1-203ENST00000410055 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PXDC1Q5TGL8 SLC1A5-205ENST00000594991 2031 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PXDC1Q5TGL8 GUCY1B3-206ENST00000507146 2709 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PXDC1Q5TGL8 RALY-203ENST00000375114 6430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PXDC1Q5TGL8 PTGDR-201ENST00000306051 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PXDC1Q5TGL8 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PXDC1Q5TGL8 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PXDC1Q5TGL8 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PXDC1Q5TGL8 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PXDC1Q5TGL8 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
PXDC1Q5TGL8 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PXDC1Q5TGL8 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
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