Protein–RNA interactions for Protein: Q5SRH9

TTC39A, Tetratricopeptide repeat protein 39A, humanhuman

Predictions only

Length 613 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTC39AQ5SRH9 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
TTC39AQ5SRH9 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
TTC39AQ5SRH9 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
TTC39AQ5SRH9 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
TTC39AQ5SRH9 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
TTC39AQ5SRH9 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
TTC39AQ5SRH9 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
TTC39AQ5SRH9 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
TTC39AQ5SRH9 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
TTC39AQ5SRH9 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
TTC39AQ5SRH9 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
TTC39AQ5SRH9 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
TTC39AQ5SRH9 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
TTC39AQ5SRH9 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
TTC39AQ5SRH9 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
TTC39AQ5SRH9 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
TTC39AQ5SRH9 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
TTC39AQ5SRH9 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
TTC39AQ5SRH9 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
TTC39AQ5SRH9 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
TTC39AQ5SRH9 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
TTC39AQ5SRH9 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
TTC39AQ5SRH9 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
TTC39AQ5SRH9 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
TTC39AQ5SRH9 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
TTC39AQ5SRH9 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
TTC39AQ5SRH9 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
TTC39AQ5SRH9 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
TTC39AQ5SRH9 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
TTC39AQ5SRH9 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
TTC39AQ5SRH9 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
TTC39AQ5SRH9 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
TTC39AQ5SRH9 ELAC1-203ENST00000588577 694 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
TTC39AQ5SRH9 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
TTC39AQ5SRH9 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
TTC39AQ5SRH9 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
TTC39AQ5SRH9 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
TTC39AQ5SRH9 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
TTC39AQ5SRH9 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
TTC39AQ5SRH9 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
TTC39AQ5SRH9 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
TTC39AQ5SRH9 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
TTC39AQ5SRH9 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
TTC39AQ5SRH9 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
TTC39AQ5SRH9 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
TTC39AQ5SRH9 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
TTC39AQ5SRH9 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC24.16■■□□□ 1.46
TTC39AQ5SRH9 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
TTC39AQ5SRH9 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
TTC39AQ5SRH9 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC24.16■■□□□ 1.46
TTC39AQ5SRH9 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
TTC39AQ5SRH9 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
TTC39AQ5SRH9 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC24.16■■□□□ 1.46
TTC39AQ5SRH9 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
TTC39AQ5SRH9 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
TTC39AQ5SRH9 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
TTC39AQ5SRH9 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
TTC39AQ5SRH9 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
TTC39AQ5SRH9 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
TTC39AQ5SRH9 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
TTC39AQ5SRH9 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
TTC39AQ5SRH9 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
TTC39AQ5SRH9 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
TTC39AQ5SRH9 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
TTC39AQ5SRH9 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
TTC39AQ5SRH9 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
TTC39AQ5SRH9 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
TTC39AQ5SRH9 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
TTC39AQ5SRH9 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
TTC39AQ5SRH9 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC24.15■■□□□ 1.46
TTC39AQ5SRH9 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
TTC39AQ5SRH9 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
TTC39AQ5SRH9 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
TTC39AQ5SRH9 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
TTC39AQ5SRH9 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
TTC39AQ5SRH9 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
TTC39AQ5SRH9 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
TTC39AQ5SRH9 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
TTC39AQ5SRH9 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
TTC39AQ5SRH9 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
TTC39AQ5SRH9 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
TTC39AQ5SRH9 TFP1-202ENST00000475455 1573 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
TTC39AQ5SRH9 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
TTC39AQ5SRH9 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
TTC39AQ5SRH9 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
TTC39AQ5SRH9 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
TTC39AQ5SRH9 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
TTC39AQ5SRH9 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
TTC39AQ5SRH9 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC24.14■■□□□ 1.45
TTC39AQ5SRH9 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
TTC39AQ5SRH9 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
TTC39AQ5SRH9 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
TTC39AQ5SRH9 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
TTC39AQ5SRH9 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
TTC39AQ5SRH9 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
TTC39AQ5SRH9 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
TTC39AQ5SRH9 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
TTC39AQ5SRH9 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
TTC39AQ5SRH9 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
TTC39AQ5SRH9 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.4 ms