Protein–RNA interactions for Protein: Q5JUK3

KCNT1, Potassium channel subfamily T member 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,230 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNT1Q5JUK3 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
KCNT1Q5JUK3 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
KCNT1Q5JUK3 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC20.78■□□□□ 0.92
KCNT1Q5JUK3 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
KCNT1Q5JUK3 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC20.78■□□□□ 0.92
KCNT1Q5JUK3 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
KCNT1Q5JUK3 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
KCNT1Q5JUK3 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
KCNT1Q5JUK3 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
KCNT1Q5JUK3 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
KCNT1Q5JUK3 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
KCNT1Q5JUK3 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
KCNT1Q5JUK3 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
KCNT1Q5JUK3 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
KCNT1Q5JUK3 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
KCNT1Q5JUK3 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
KCNT1Q5JUK3 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
KCNT1Q5JUK3 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC20.77■□□□□ 0.92
KCNT1Q5JUK3 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
KCNT1Q5JUK3 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
KCNT1Q5JUK3 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
KCNT1Q5JUK3 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
KCNT1Q5JUK3 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
KCNT1Q5JUK3 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
KCNT1Q5JUK3 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC20.77■□□□□ 0.92
KCNT1Q5JUK3 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC20.77■□□□□ 0.92
KCNT1Q5JUK3 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
KCNT1Q5JUK3 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
KCNT1Q5JUK3 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
KCNT1Q5JUK3 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
KCNT1Q5JUK3 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
KCNT1Q5JUK3 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
KCNT1Q5JUK3 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
KCNT1Q5JUK3 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
KCNT1Q5JUK3 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
KCNT1Q5JUK3 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
KCNT1Q5JUK3 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
KCNT1Q5JUK3 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.91
KCNT1Q5JUK3 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
KCNT1Q5JUK3 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
KCNT1Q5JUK3 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
KCNT1Q5JUK3 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
KCNT1Q5JUK3 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
KCNT1Q5JUK3 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
KCNT1Q5JUK3 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
KCNT1Q5JUK3 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC20.76■□□□□ 0.91
KCNT1Q5JUK3 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
KCNT1Q5JUK3 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
KCNT1Q5JUK3 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC20.76■□□□□ 0.91
KCNT1Q5JUK3 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
KCNT1Q5JUK3 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
KCNT1Q5JUK3 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
KCNT1Q5JUK3 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
KCNT1Q5JUK3 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
KCNT1Q5JUK3 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
KCNT1Q5JUK3 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
KCNT1Q5JUK3 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
KCNT1Q5JUK3 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
KCNT1Q5JUK3 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
KCNT1Q5JUK3 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
KCNT1Q5JUK3 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
KCNT1Q5JUK3 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC20.76■□□□□ 0.91
KCNT1Q5JUK3 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
KCNT1Q5JUK3 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
KCNT1Q5JUK3 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
KCNT1Q5JUK3 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
KCNT1Q5JUK3 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
KCNT1Q5JUK3 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
KCNT1Q5JUK3 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
KCNT1Q5JUK3 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
KCNT1Q5JUK3 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC20.75■□□□□ 0.91
KCNT1Q5JUK3 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
KCNT1Q5JUK3 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
KCNT1Q5JUK3 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
KCNT1Q5JUK3 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
KCNT1Q5JUK3 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
KCNT1Q5JUK3 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
KCNT1Q5JUK3 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
KCNT1Q5JUK3 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
KCNT1Q5JUK3 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
KCNT1Q5JUK3 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
KCNT1Q5JUK3 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
KCNT1Q5JUK3 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
KCNT1Q5JUK3 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC20.75■□□□□ 0.91
KCNT1Q5JUK3 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
KCNT1Q5JUK3 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
KCNT1Q5JUK3 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
KCNT1Q5JUK3 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
KCNT1Q5JUK3 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
KCNT1Q5JUK3 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
KCNT1Q5JUK3 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
KCNT1Q5JUK3 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
KCNT1Q5JUK3 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
KCNT1Q5JUK3 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
KCNT1Q5JUK3 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
KCNT1Q5JUK3 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
KCNT1Q5JUK3 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
KCNT1Q5JUK3 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
KCNT1Q5JUK3 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
KCNT1Q5JUK3 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.2 ms