Protein–RNA interactions for Protein: Q5BJE1

CCDC178, Coiled-coil domain-containing protein 178, humanhuman

Predictions only

Length 867 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC178Q5BJE1 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CCDC178Q5BJE1 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
CCDC178Q5BJE1 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CCDC178Q5BJE1 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CCDC178Q5BJE1 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CCDC178Q5BJE1 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CCDC178Q5BJE1 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CCDC178Q5BJE1 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CCDC178Q5BJE1 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
CCDC178Q5BJE1 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CCDC178Q5BJE1 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CCDC178Q5BJE1 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CCDC178Q5BJE1 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CCDC178Q5BJE1 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CCDC178Q5BJE1 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CCDC178Q5BJE1 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CCDC178Q5BJE1 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CCDC178Q5BJE1 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CCDC178Q5BJE1 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CCDC178Q5BJE1 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CCDC178Q5BJE1 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CCDC178Q5BJE1 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CCDC178Q5BJE1 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CCDC178Q5BJE1 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CCDC178Q5BJE1 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CCDC178Q5BJE1 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CCDC178Q5BJE1 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CCDC178Q5BJE1 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CCDC178Q5BJE1 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CCDC178Q5BJE1 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
CCDC178Q5BJE1 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CCDC178Q5BJE1 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CCDC178Q5BJE1 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CCDC178Q5BJE1 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CCDC178Q5BJE1 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CCDC178Q5BJE1 NBPF21P-201ENST00000425093 1451 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
CCDC178Q5BJE1 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CCDC178Q5BJE1 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CCDC178Q5BJE1 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CCDC178Q5BJE1 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CCDC178Q5BJE1 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
CCDC178Q5BJE1 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CCDC178Q5BJE1 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CCDC178Q5BJE1 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.31
CCDC178Q5BJE1 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CCDC178Q5BJE1 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CCDC178Q5BJE1 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CCDC178Q5BJE1 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CCDC178Q5BJE1 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CCDC178Q5BJE1 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CCDC178Q5BJE1 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CCDC178Q5BJE1 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CCDC178Q5BJE1 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CCDC178Q5BJE1 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CCDC178Q5BJE1 ELAC1-203ENST00000588577 694 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CCDC178Q5BJE1 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
CCDC178Q5BJE1 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CCDC178Q5BJE1 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CCDC178Q5BJE1 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CCDC178Q5BJE1 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CCDC178Q5BJE1 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CCDC178Q5BJE1 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CCDC178Q5BJE1 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CCDC178Q5BJE1 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CCDC178Q5BJE1 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CCDC178Q5BJE1 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CCDC178Q5BJE1 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CCDC178Q5BJE1 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CCDC178Q5BJE1 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CCDC178Q5BJE1 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CCDC178Q5BJE1 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CCDC178Q5BJE1 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CCDC178Q5BJE1 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CCDC178Q5BJE1 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CCDC178Q5BJE1 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CCDC178Q5BJE1 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CCDC178Q5BJE1 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CCDC178Q5BJE1 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CCDC178Q5BJE1 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
CCDC178Q5BJE1 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CCDC178Q5BJE1 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CCDC178Q5BJE1 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CCDC178Q5BJE1 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CCDC178Q5BJE1 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CCDC178Q5BJE1 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CCDC178Q5BJE1 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CCDC178Q5BJE1 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CCDC178Q5BJE1 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CCDC178Q5BJE1 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CCDC178Q5BJE1 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CCDC178Q5BJE1 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CCDC178Q5BJE1 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CCDC178Q5BJE1 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CCDC178Q5BJE1 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
CCDC178Q5BJE1 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CCDC178Q5BJE1 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CCDC178Q5BJE1 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CCDC178Q5BJE1 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CCDC178Q5BJE1 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CCDC178Q5BJE1 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34 ms