Protein–RNA interactions for Protein: Q53EU6

GPAT3, Glycerol-3-phosphate acyltransferase 3, humanhuman

Predictions only

Length 434 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPAT3Q53EU6 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
GPAT3Q53EU6 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
GPAT3Q53EU6 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
GPAT3Q53EU6 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
GPAT3Q53EU6 DYNC1LI2-201ENST00000258198 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
GPAT3Q53EU6 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
GPAT3Q53EU6 UNC5B-201ENST00000335350 6841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
GPAT3Q53EU6 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
GPAT3Q53EU6 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
GPAT3Q53EU6 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
GPAT3Q53EU6 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
GPAT3Q53EU6 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
GPAT3Q53EU6 PITPNC1-201ENST00000299954 6359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
GPAT3Q53EU6 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
GPAT3Q53EU6 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
GPAT3Q53EU6 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
GPAT3Q53EU6 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
GPAT3Q53EU6 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
GPAT3Q53EU6 MFHAS1-201ENST00000276282 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
GPAT3Q53EU6 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
GPAT3Q53EU6 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
GPAT3Q53EU6 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
GPAT3Q53EU6 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
GPAT3Q53EU6 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
GPAT3Q53EU6 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
GPAT3Q53EU6 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
GPAT3Q53EU6 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
GPAT3Q53EU6 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
GPAT3Q53EU6 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
GPAT3Q53EU6 IMPAD1-201ENST00000262644 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
GPAT3Q53EU6 ADAMTS19-201ENST00000274487 5234 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
GPAT3Q53EU6 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
GPAT3Q53EU6 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
GPAT3Q53EU6 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
GPAT3Q53EU6 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
GPAT3Q53EU6 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
GPAT3Q53EU6 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
GPAT3Q53EU6 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
GPAT3Q53EU6 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC18.6■□□□□ 0.57
GPAT3Q53EU6 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
GPAT3Q53EU6 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
GPAT3Q53EU6 CLIP2-202ENST00000361545 5445 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
GPAT3Q53EU6 RIOX2-201ENST00000333396 5347 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
GPAT3Q53EU6 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
GPAT3Q53EU6 AHCYL1-203ENST00000393614 4313 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
GPAT3Q53EU6 CREG2-201ENST00000324768 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
GPAT3Q53EU6 FAM91A1-201ENST00000334705 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
GPAT3Q53EU6 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
GPAT3Q53EU6 AC138430.1-201ENST00000586064 5409 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
GPAT3Q53EU6 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
GPAT3Q53EU6 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
GPAT3Q53EU6 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
GPAT3Q53EU6 RALY-203ENST00000375114 6430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
GPAT3Q53EU6 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
GPAT3Q53EU6 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
GPAT3Q53EU6 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
GPAT3Q53EU6 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
GPAT3Q53EU6 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
GPAT3Q53EU6 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
GPAT3Q53EU6 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
GPAT3Q53EU6 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
GPAT3Q53EU6 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
GPAT3Q53EU6 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
GPAT3Q53EU6 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
GPAT3Q53EU6 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
GPAT3Q53EU6 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
GPAT3Q53EU6 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
GPAT3Q53EU6 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
GPAT3Q53EU6 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
GPAT3Q53EU6 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
GPAT3Q53EU6 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC18.59■□□□□ 0.57
GPAT3Q53EU6 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
GPAT3Q53EU6 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
GPAT3Q53EU6 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
GPAT3Q53EU6 USP25-204ENST00000400183 5341 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
GPAT3Q53EU6 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
GPAT3Q53EU6 UBE3C-201ENST00000348165 5229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
GPAT3Q53EU6 RUSC2-202ENST00000455600 5636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
GPAT3Q53EU6 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
GPAT3Q53EU6 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
GPAT3Q53EU6 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC18.58■□□□□ 0.57
GPAT3Q53EU6 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
GPAT3Q53EU6 MAPK8IP3-202ENST00000356010 4456 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
GPAT3Q53EU6 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
GPAT3Q53EU6 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
GPAT3Q53EU6 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC18.58■□□□□ 0.56
GPAT3Q53EU6 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
GPAT3Q53EU6 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
GPAT3Q53EU6 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
GPAT3Q53EU6 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
GPAT3Q53EU6 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
GPAT3Q53EU6 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
GPAT3Q53EU6 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
GPAT3Q53EU6 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
GPAT3Q53EU6 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
GPAT3Q53EU6 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
GPAT3Q53EU6 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
GPAT3Q53EU6 PCDHA2-203ENST00000526136 5254 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
GPAT3Q53EU6 CADPS-201ENST00000283269 4591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
GPAT3Q53EU6 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.9 ms