Protein–RNA interactions for Protein: Q15637

SF1, Splicing factor 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 639 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SF1Q15637 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
SF1Q15637 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
SF1Q15637 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
SF1Q15637 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC19.34■□□□□ 0.69
SF1Q15637 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
SF1Q15637 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
SF1Q15637 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
SF1Q15637 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
SF1Q15637 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.69
SF1Q15637 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
SF1Q15637 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
SF1Q15637 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC19.33■□□□□ 0.68
SF1Q15637 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
SF1Q15637 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
SF1Q15637 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
SF1Q15637 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
SF1Q15637 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
SF1Q15637 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
SF1Q15637 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.33■□□□□ 0.68
SF1Q15637 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC19.33■□□□□ 0.68
SF1Q15637 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC19.33■□□□□ 0.68
SF1Q15637 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
SF1Q15637 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
SF1Q15637 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
SF1Q15637 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
SF1Q15637 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
SF1Q15637 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
SF1Q15637 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
SF1Q15637 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
SF1Q15637 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
SF1Q15637 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
SF1Q15637 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
SF1Q15637 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
SF1Q15637 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
SF1Q15637 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
SF1Q15637 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
SF1Q15637 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
SF1Q15637 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
SF1Q15637 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
SF1Q15637 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
SF1Q15637 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
SF1Q15637 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
SF1Q15637 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
SF1Q15637 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
SF1Q15637 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
SF1Q15637 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
SF1Q15637 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
SF1Q15637 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
SF1Q15637 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
SF1Q15637 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
SF1Q15637 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
SF1Q15637 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
SF1Q15637 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
SF1Q15637 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
SF1Q15637 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
SF1Q15637 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
SF1Q15637 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
SF1Q15637 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
SF1Q15637 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
SF1Q15637 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
SF1Q15637 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
SF1Q15637 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
SF1Q15637 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
SF1Q15637 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
SF1Q15637 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
SF1Q15637 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
SF1Q15637 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
SF1Q15637 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
SF1Q15637 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
SF1Q15637 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
SF1Q15637 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
SF1Q15637 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
SF1Q15637 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC19.3■□□□□ 0.68
SF1Q15637 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
SF1Q15637 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
SF1Q15637 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
SF1Q15637 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
SF1Q15637 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
SF1Q15637 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
SF1Q15637 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
SF1Q15637 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
SF1Q15637 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
SF1Q15637 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
SF1Q15637 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
SF1Q15637 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC19.3■□□□□ 0.68
SF1Q15637 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
SF1Q15637 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
SF1Q15637 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
SF1Q15637 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
SF1Q15637 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
SF1Q15637 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
SF1Q15637 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
SF1Q15637 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
SF1Q15637 FLT1-209ENST00000639477 6337 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
SF1Q15637 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
SF1Q15637 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
SF1Q15637 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
SF1Q15637 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
SF1Q15637 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
SF1Q15637 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
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