Protein–RNA interactions for Protein: Q15431

SYCP1, Synaptonemal complex protein 1, humanhuman

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Length 976 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYCP1Q15431 RANBP10-209ENST00000630626 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
SYCP1Q15431 UBE2Q2-208ENST00000569423 2969 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
SYCP1Q15431 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SYCP1Q15431 PRSS36-202ENST00000418068 2446 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
SYCP1Q15431 FOXD2-201ENST00000334793 4675 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
SYCP1Q15431 IMPAD1-201ENST00000262644 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SYCP1Q15431 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SYCP1Q15431 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SYCP1Q15431 RREB1-201ENST00000334984 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SYCP1Q15431 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SYCP1Q15431 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SYCP1Q15431 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SYCP1Q15431 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SYCP1Q15431 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SYCP1Q15431 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SYCP1Q15431 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SYCP1Q15431 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SYCP1Q15431 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SYCP1Q15431 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SYCP1Q15431 LONP1-201ENST00000360614 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SYCP1Q15431 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SYCP1Q15431 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SYCP1Q15431 MCCC1-214ENST00000610757 2410 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SYCP1Q15431 KMT5B-206ENST00000405515 2869 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SYCP1Q15431 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SYCP1Q15431 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SYCP1Q15431 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SYCP1Q15431 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SYCP1Q15431 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SYCP1Q15431 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SYCP1Q15431 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SYCP1Q15431 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SYCP1Q15431 ISOC1-201ENST00000173527 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SYCP1Q15431 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SYCP1Q15431 FIP1L1-203ENST00000358575 2180 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SYCP1Q15431 CIDEB-202ENST00000336557 2409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SYCP1Q15431 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SYCP1Q15431 PODN-203ENST00000395871 2744 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SYCP1Q15431 FAM213B-201ENST00000378424 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SYCP1Q15431 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SYCP1Q15431 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
SYCP1Q15431 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SYCP1Q15431 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SYCP1Q15431 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SYCP1Q15431 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SYCP1Q15431 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SYCP1Q15431 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SYCP1Q15431 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SYCP1Q15431 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SYCP1Q15431 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SYCP1Q15431 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SYCP1Q15431 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SYCP1Q15431 MYH7B-201ENST00000262873 6293 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SYCP1Q15431 UNC5B-201ENST00000335350 6841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SYCP1Q15431 SNAP47-202ENST00000366759 2362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SYCP1Q15431 MAFG-201ENST00000357736 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SYCP1Q15431 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SYCP1Q15431 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SYCP1Q15431 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SYCP1Q15431 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SYCP1Q15431 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SYCP1Q15431 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SYCP1Q15431 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SYCP1Q15431 GAS2L1-210ENST00000621062 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SYCP1Q15431 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SYCP1Q15431 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SYCP1Q15431 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SYCP1Q15431 SSC4D-201ENST00000275560 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SYCP1Q15431 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SYCP1Q15431 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SYCP1Q15431 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SYCP1Q15431 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SYCP1Q15431 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SYCP1Q15431 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SYCP1Q15431 ELOC-209ENST00000602840 2780 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SYCP1Q15431 GDF10-201ENST00000580279 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SYCP1Q15431 DAG1-221ENST00000541308 5676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SYCP1Q15431 MCTP1-218ENST00000515393 5396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SYCP1Q15431 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SYCP1Q15431 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SYCP1Q15431 SLC9A6-202ENST00000370698 4631 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SYCP1Q15431 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SYCP1Q15431 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SYCP1Q15431 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SYCP1Q15431 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SYCP1Q15431 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SYCP1Q15431 STARD3-219ENST00000580611 1989 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SYCP1Q15431 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SYCP1Q15431 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SYCP1Q15431 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SYCP1Q15431 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SYCP1Q15431 C19orf25-207ENST00000588871 2128 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SYCP1Q15431 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SYCP1Q15431 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SYCP1Q15431 AC007192.1-201ENST00000593731 5142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SYCP1Q15431 CDCA7L-203ENST00000406877 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SYCP1Q15431 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SYCP1Q15431 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SYCP1Q15431 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.11
SYCP1Q15431 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC21.95■■□□□ 1.11
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