Protein–RNA interactions for Protein: Q14457

BECN1, Beclin-1, humanhuman

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Length 450 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BECN1Q14457 MRC2-201ENST00000303375 5988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
BECN1Q14457 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
BECN1Q14457 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
BECN1Q14457 ADAP1-205ENST00000449296 2093 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
BECN1Q14457 KRT24-201ENST00000264651 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
BECN1Q14457 ADPGK-201ENST00000311669 2557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
BECN1Q14457 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
BECN1Q14457 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
BECN1Q14457 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
BECN1Q14457 CPSF3-201ENST00000238112 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
BECN1Q14457 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
BECN1Q14457 OGFOD2-201ENST00000228922 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
BECN1Q14457 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
BECN1Q14457 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
BECN1Q14457 SLC12A4-201ENST00000316341 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
BECN1Q14457 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
BECN1Q14457 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
BECN1Q14457 LDLRAD4-211ENST00000587757 2171 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.42
BECN1Q14457 ADAM33-203ENST00000379861 3674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
BECN1Q14457 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
BECN1Q14457 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.42
BECN1Q14457 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
BECN1Q14457 FAM213B-201ENST00000378424 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
BECN1Q14457 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
BECN1Q14457 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
BECN1Q14457 KLHL17-201ENST00000338591 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
BECN1Q14457 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
BECN1Q14457 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
BECN1Q14457 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
BECN1Q14457 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
BECN1Q14457 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
BECN1Q14457 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
BECN1Q14457 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
BECN1Q14457 MTSS1L-204ENST00000616026 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
BECN1Q14457 TBC1D4-204ENST00000431480 6347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
BECN1Q14457 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
BECN1Q14457 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
BECN1Q14457 CABP7-201ENST00000216144 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
BECN1Q14457 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
BECN1Q14457 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
BECN1Q14457 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC23.88■■□□□ 1.41
BECN1Q14457 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
BECN1Q14457 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC23.88■■□□□ 1.41
BECN1Q14457 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
BECN1Q14457 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
BECN1Q14457 HIPK1-207ENST00000369561 3777 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
BECN1Q14457 KRT15-203ENST00000393976 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
BECN1Q14457 CLIP2-201ENST00000223398 5563 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
BECN1Q14457 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
BECN1Q14457 ACVR1B-203ENST00000426655 1782 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
BECN1Q14457 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
BECN1Q14457 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
BECN1Q14457 DAG1-219ENST00000538711 5582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
BECN1Q14457 TTLL3-209ENST00000426895 2767 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
BECN1Q14457 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
BECN1Q14457 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC23.87■■□□□ 1.41
BECN1Q14457 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
BECN1Q14457 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
BECN1Q14457 PSPC1-201ENST00000338910 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
BECN1Q14457 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
BECN1Q14457 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
BECN1Q14457 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
BECN1Q14457 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
BECN1Q14457 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.87■■□□□ 1.41
BECN1Q14457 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
BECN1Q14457 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
BECN1Q14457 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
BECN1Q14457 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
BECN1Q14457 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
BECN1Q14457 ACD-202ENST00000393919 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
BECN1Q14457 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
BECN1Q14457 PRSS23-201ENST00000280258 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
BECN1Q14457 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
BECN1Q14457 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
BECN1Q14457 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
BECN1Q14457 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
BECN1Q14457 NUDT10-202ENST00000376006 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
BECN1Q14457 WWC1-201ENST00000265293 7130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
BECN1Q14457 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
BECN1Q14457 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
BECN1Q14457 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
BECN1Q14457 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
BECN1Q14457 PGAP3-206ENST00000579146 2220 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
BECN1Q14457 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
BECN1Q14457 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
BECN1Q14457 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
BECN1Q14457 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
BECN1Q14457 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
BECN1Q14457 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
BECN1Q14457 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC23.86■■□□□ 1.41
BECN1Q14457 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
BECN1Q14457 WNK2-202ENST00000395477 6834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
BECN1Q14457 RNF167-205ENST00000571816 1728 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
BECN1Q14457 PARP15-202ENST00000464300 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
BECN1Q14457 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
BECN1Q14457 UBE2Q2-208ENST00000569423 2969 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
BECN1Q14457 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
BECN1Q14457 ACHE-205ENST00000419336 1906 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
BECN1Q14457 WNK1-203ENST00000447667 1902 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
BECN1Q14457 DOLPP1-203ENST00000406974 2037 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
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