Protein–RNA interactions for Protein: Q14406

CSHL1, Chorionic somatomammotropin hormone-like 1, humanhuman

Predictions only

Length 222 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSHL1Q14406 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
CSHL1Q14406 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
CSHL1Q14406 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
CSHL1Q14406 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
CSHL1Q14406 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
CSHL1Q14406 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
CSHL1Q14406 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC19.68■□□□□ 0.74
CSHL1Q14406 ZSWIM8-220ENST00000604524 5465 ntTSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
CSHL1Q14406 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
CSHL1Q14406 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
CSHL1Q14406 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
CSHL1Q14406 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
CSHL1Q14406 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
CSHL1Q14406 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
CSHL1Q14406 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
CSHL1Q14406 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC19.67■□□□□ 0.74
CSHL1Q14406 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
CSHL1Q14406 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
CSHL1Q14406 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
CSHL1Q14406 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
CSHL1Q14406 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC19.67■□□□□ 0.74
CSHL1Q14406 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
CSHL1Q14406 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
CSHL1Q14406 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC19.67■□□□□ 0.74
CSHL1Q14406 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
CSHL1Q14406 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC19.67■□□□□ 0.74
CSHL1Q14406 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
CSHL1Q14406 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
CSHL1Q14406 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
CSHL1Q14406 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
CSHL1Q14406 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
CSHL1Q14406 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
CSHL1Q14406 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
CSHL1Q14406 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC19.66■□□□□ 0.74
CSHL1Q14406 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
CSHL1Q14406 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
CSHL1Q14406 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
CSHL1Q14406 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
CSHL1Q14406 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
CSHL1Q14406 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
CSHL1Q14406 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
CSHL1Q14406 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
CSHL1Q14406 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
CSHL1Q14406 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC19.66■□□□□ 0.74
CSHL1Q14406 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC19.66■□□□□ 0.74
CSHL1Q14406 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
CSHL1Q14406 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC19.66■□□□□ 0.74
CSHL1Q14406 ROR1-201ENST00000371079 5832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
CSHL1Q14406 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
CSHL1Q14406 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
CSHL1Q14406 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
CSHL1Q14406 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
CSHL1Q14406 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
CSHL1Q14406 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
CSHL1Q14406 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
CSHL1Q14406 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
CSHL1Q14406 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
CSHL1Q14406 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
CSHL1Q14406 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
CSHL1Q14406 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
CSHL1Q14406 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
CSHL1Q14406 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
CSHL1Q14406 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
CSHL1Q14406 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC19.65■□□□□ 0.74
CSHL1Q14406 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
CSHL1Q14406 RNPEPL1-201ENST00000270357 5658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
CSHL1Q14406 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
CSHL1Q14406 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
CSHL1Q14406 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
CSHL1Q14406 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC19.65■□□□□ 0.74
CSHL1Q14406 C3orf70-201ENST00000335012 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
CSHL1Q14406 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
CSHL1Q14406 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
CSHL1Q14406 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
CSHL1Q14406 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
CSHL1Q14406 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
CSHL1Q14406 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.74
CSHL1Q14406 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
CSHL1Q14406 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.74
CSHL1Q14406 EVC-201ENST00000264956 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
CSHL1Q14406 WDR90-201ENST00000293879 5488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
CSHL1Q14406 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
CSHL1Q14406 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
CSHL1Q14406 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC19.64■□□□□ 0.73
CSHL1Q14406 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
CSHL1Q14406 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
CSHL1Q14406 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
CSHL1Q14406 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
CSHL1Q14406 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
CSHL1Q14406 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
CSHL1Q14406 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
CSHL1Q14406 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
CSHL1Q14406 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
CSHL1Q14406 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
CSHL1Q14406 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC19.64■□□□□ 0.73
CSHL1Q14406 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
CSHL1Q14406 ADGRG2-210ENST00000379878 4803 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
CSHL1Q14406 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
CSHL1Q14406 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
CSHL1Q14406 CXXC4-201ENST00000394767 5565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.9 ms