Protein–RNA interactions for Protein: Q14008

CKAP5, Cytoskeleton-associated protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 2,032 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CKAP5Q14008 AC016582.3-201ENST00000589653 561 ntTSL 4 BASIC19.95■□□□□ 0.78
CKAP5Q14008 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
CKAP5Q14008 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CKAP5Q14008 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CKAP5Q14008 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CKAP5Q14008 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CKAP5Q14008 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
CKAP5Q14008 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CKAP5Q14008 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
CKAP5Q14008 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
CKAP5Q14008 CACYBP-202ENST00000405362 1059 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
CKAP5Q14008 NTAN1-211ENST00000622833 1049 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
CKAP5Q14008 NTAN1-212ENST00000624579 1115 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
CKAP5Q14008 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
CKAP5Q14008 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
CKAP5Q14008 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CKAP5Q14008 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
CKAP5Q14008 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CKAP5Q14008 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CKAP5Q14008 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CKAP5Q14008 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
CKAP5Q14008 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CKAP5Q14008 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CKAP5Q14008 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CKAP5Q14008 TFP1-202ENST00000475455 1573 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
CKAP5Q14008 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CKAP5Q14008 FAM210CP-201ENST00000445714 574 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
CKAP5Q14008 PACRGL-207ENST00000502938 810 ntTSL 4 BASIC19.93■□□□□ 0.78
CKAP5Q14008 SLC25A11-202ENST00000544061 952 ntTSL 3 BASIC19.93■□□□□ 0.78
CKAP5Q14008 P4HB-223ENST00000576390 439 ntTSL 4 BASIC19.93■□□□□ 0.78
CKAP5Q14008 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
CKAP5Q14008 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
CKAP5Q14008 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
CKAP5Q14008 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CKAP5Q14008 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
CKAP5Q14008 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
CKAP5Q14008 Z98884.1-201ENST00000451646 830 ntTSL 3 BASIC19.93■□□□□ 0.78
CKAP5Q14008 GLDC-219ENST00000640208 420 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
CKAP5Q14008 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
CKAP5Q14008 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CKAP5Q14008 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
CKAP5Q14008 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
CKAP5Q14008 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
CKAP5Q14008 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
CKAP5Q14008 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
CKAP5Q14008 OAF-202ENST00000531220 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.92■□□□□ 0.78
CKAP5Q14008 DUT-205ENST00000558813 769 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
CKAP5Q14008 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
CKAP5Q14008 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
CKAP5Q14008 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
CKAP5Q14008 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
CKAP5Q14008 BTBD1-202ENST00000379403 1467 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
CKAP5Q14008 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC19.92■□□□□ 0.78
CKAP5Q14008 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
CKAP5Q14008 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
CKAP5Q14008 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
CKAP5Q14008 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
CKAP5Q14008 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
CKAP5Q14008 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC19.92■□□□□ 0.78
CKAP5Q14008 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
CKAP5Q14008 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
CKAP5Q14008 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
CKAP5Q14008 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC19.91■□□□□ 0.78
CKAP5Q14008 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
CKAP5Q14008 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
CKAP5Q14008 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
CKAP5Q14008 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
CKAP5Q14008 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.91■□□□□ 0.78
CKAP5Q14008 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
CKAP5Q14008 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
CKAP5Q14008 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
CKAP5Q14008 C2orf69P3-201ENST00000565542 1120 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
CKAP5Q14008 CEMP1-202ENST00000567119 1374 ntAPPRIS P2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
CKAP5Q14008 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
CKAP5Q14008 AC027682.4-201ENST00000605277 798 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
CKAP5Q14008 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
CKAP5Q14008 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
CKAP5Q14008 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
CKAP5Q14008 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
CKAP5Q14008 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
CKAP5Q14008 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
CKAP5Q14008 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
CKAP5Q14008 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
CKAP5Q14008 IGFBP7-AS1-201ENST00000499667 1389 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
CKAP5Q14008 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
CKAP5Q14008 FUOM-203ENST00000368552 762 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
CKAP5Q14008 AC008105.2-201ENST00000420431 579 ntTSL 4 BASIC19.9■□□□□ 0.78
CKAP5Q14008 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
CKAP5Q14008 AC097662.2-201ENST00000641359 267 ntAPPRIS P1 BASIC19.9■□□□□ 0.78
CKAP5Q14008 AL031985.4-201ENST00000642138 673 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
CKAP5Q14008 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
CKAP5Q14008 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
CKAP5Q14008 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
CKAP5Q14008 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
CKAP5Q14008 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
CKAP5Q14008 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
CKAP5Q14008 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
CKAP5Q14008 METTL21A-201ENST00000272839 1210 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
CKAP5Q14008 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
CKAP5Q14008 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
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