Protein–RNA interactions for Protein: Q13509

TUBB3, Tubulin beta-3 chain, humanhuman

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Length 450 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBB3Q13509 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
TUBB3Q13509 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
TUBB3Q13509 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
TUBB3Q13509 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
TUBB3Q13509 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
TUBB3Q13509 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
TUBB3Q13509 MYC-201ENST00000259523 2042 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
TUBB3Q13509 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC19.75■□□□□ 0.75
TUBB3Q13509 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
TUBB3Q13509 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
TUBB3Q13509 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
TUBB3Q13509 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
TUBB3Q13509 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
TUBB3Q13509 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
TUBB3Q13509 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
TUBB3Q13509 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
TUBB3Q13509 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
TUBB3Q13509 AC087482.1-204ENST00000636067 2431 ntTSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
TUBB3Q13509 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
TUBB3Q13509 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
TUBB3Q13509 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
TUBB3Q13509 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC19.74■□□□□ 0.75
TUBB3Q13509 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
TUBB3Q13509 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC19.74■□□□□ 0.75
TUBB3Q13509 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
TUBB3Q13509 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
TUBB3Q13509 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
TUBB3Q13509 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
TUBB3Q13509 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
TUBB3Q13509 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC19.74■□□□□ 0.75
TUBB3Q13509 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
TUBB3Q13509 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
TUBB3Q13509 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
TUBB3Q13509 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
TUBB3Q13509 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
TUBB3Q13509 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
TUBB3Q13509 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
TUBB3Q13509 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
TUBB3Q13509 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
TUBB3Q13509 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
TUBB3Q13509 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
TUBB3Q13509 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
TUBB3Q13509 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
TUBB3Q13509 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
TUBB3Q13509 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
TUBB3Q13509 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
TUBB3Q13509 SLC3A2-206ENST00000535296 2084 ntTSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
TUBB3Q13509 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
TUBB3Q13509 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
TUBB3Q13509 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
TUBB3Q13509 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
TUBB3Q13509 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC19.73■□□□□ 0.75
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TUBB3Q13509 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC19.73■□□□□ 0.75
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TUBB3Q13509 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
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TUBB3Q13509 AC004408.2-201ENST00000623613 2777 ntBASIC19.73■□□□□ 0.75
TUBB3Q13509 STARD3-219ENST00000580611 1989 ntTSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
TUBB3Q13509 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
TUBB3Q13509 SDCBP-204ENST00000447182 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
TUBB3Q13509 PRSS36-202ENST00000418068 2446 ntTSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
TUBB3Q13509 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC19.73■□□□□ 0.75
TUBB3Q13509 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
TUBB3Q13509 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
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TUBB3Q13509 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
TUBB3Q13509 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
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TUBB3Q13509 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
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TUBB3Q13509 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
TUBB3Q13509 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
TUBB3Q13509 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC19.72■□□□□ 0.75
TUBB3Q13509 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
TUBB3Q13509 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.72■□□□□ 0.75
TUBB3Q13509 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
TUBB3Q13509 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
TUBB3Q13509 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
TUBB3Q13509 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
TUBB3Q13509 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
TUBB3Q13509 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
TUBB3Q13509 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC19.72■□□□□ 0.75
TUBB3Q13509 CERS5-203ENST00000422340 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
TUBB3Q13509 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
TUBB3Q13509 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
TUBB3Q13509 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
TUBB3Q13509 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
TUBB3Q13509 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
TUBB3Q13509 NDOR1-203ENST00000427047 2315 ntTSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
TUBB3Q13509 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
TUBB3Q13509 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
TUBB3Q13509 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
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