Protein–RNA interactions for Protein: Q13421

MSLN, Mesothelin, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 630 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MSLNQ13421 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
MSLNQ13421 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
MSLNQ13421 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
MSLNQ13421 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
MSLNQ13421 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
MSLNQ13421 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
MSLNQ13421 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
MSLNQ13421 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
MSLNQ13421 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
MSLNQ13421 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
MSLNQ13421 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
MSLNQ13421 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
MSLNQ13421 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
MSLNQ13421 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
MSLNQ13421 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
MSLNQ13421 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
MSLNQ13421 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
MSLNQ13421 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC20.08■□□□□ 0.81
MSLNQ13421 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
MSLNQ13421 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
MSLNQ13421 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
MSLNQ13421 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
MSLNQ13421 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
MSLNQ13421 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
MSLNQ13421 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
MSLNQ13421 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
MSLNQ13421 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
MSLNQ13421 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
MSLNQ13421 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
MSLNQ13421 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
MSLNQ13421 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
MSLNQ13421 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
MSLNQ13421 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
MSLNQ13421 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
MSLNQ13421 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
MSLNQ13421 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
MSLNQ13421 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
MSLNQ13421 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
MSLNQ13421 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
MSLNQ13421 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
MSLNQ13421 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
MSLNQ13421 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
MSLNQ13421 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
MSLNQ13421 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
MSLNQ13421 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
MSLNQ13421 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
MSLNQ13421 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
MSLNQ13421 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
MSLNQ13421 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
MSLNQ13421 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
MSLNQ13421 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
MSLNQ13421 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
MSLNQ13421 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
MSLNQ13421 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
MSLNQ13421 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
MSLNQ13421 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
MSLNQ13421 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
MSLNQ13421 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
MSLNQ13421 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
MSLNQ13421 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
MSLNQ13421 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
MSLNQ13421 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
MSLNQ13421 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
MSLNQ13421 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
MSLNQ13421 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
MSLNQ13421 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
MSLNQ13421 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
MSLNQ13421 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
MSLNQ13421 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
MSLNQ13421 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
MSLNQ13421 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
MSLNQ13421 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
MSLNQ13421 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
MSLNQ13421 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
MSLNQ13421 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
MSLNQ13421 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
MSLNQ13421 FOXL2-201ENST00000330315 2917 ntAPPRIS P1 BASIC20.06■□□□□ 0.8
MSLNQ13421 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
MSLNQ13421 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC20.05■□□□□ 0.8
MSLNQ13421 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
MSLNQ13421 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
MSLNQ13421 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
MSLNQ13421 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
MSLNQ13421 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
MSLNQ13421 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
MSLNQ13421 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
MSLNQ13421 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
MSLNQ13421 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
MSLNQ13421 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
MSLNQ13421 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
MSLNQ13421 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
MSLNQ13421 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
MSLNQ13421 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
MSLNQ13421 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
MSLNQ13421 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
MSLNQ13421 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
MSLNQ13421 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
MSLNQ13421 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
MSLNQ13421 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
MSLNQ13421 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
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