Protein–RNA interactions for Protein: Q12983

BNIP3, BCL2/adenovirus E1B 19 kDa protein-interacting protein 3, humanhuman

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Length 259 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BNIP3Q12983 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC19.77■□□□□ 0.76
BNIP3Q12983 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
BNIP3Q12983 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
BNIP3Q12983 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
BNIP3Q12983 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
BNIP3Q12983 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC19.77■□□□□ 0.76
BNIP3Q12983 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
BNIP3Q12983 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC19.77■□□□□ 0.76
BNIP3Q12983 C12orf76-208ENST00000551185 496 ntTSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
BNIP3Q12983 AL355075.4-201ENST00000554988 638 ntBASIC19.77■□□□□ 0.76
BNIP3Q12983 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC19.77■□□□□ 0.76
BNIP3Q12983 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC19.77■□□□□ 0.76
BNIP3Q12983 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
BNIP3Q12983 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
BNIP3Q12983 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
BNIP3Q12983 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
BNIP3Q12983 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
BNIP3Q12983 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
BNIP3Q12983 FAM91A1-207ENST00000521166 2706 ntTSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
BNIP3Q12983 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC19.77■□□□□ 0.76
BNIP3Q12983 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
BNIP3Q12983 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.75
BNIP3Q12983 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.75
BNIP3Q12983 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
BNIP3Q12983 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
BNIP3Q12983 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
BNIP3Q12983 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
BNIP3Q12983 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
BNIP3Q12983 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
BNIP3Q12983 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
BNIP3Q12983 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
BNIP3Q12983 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
BNIP3Q12983 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC19.76■□□□□ 0.75
BNIP3Q12983 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
BNIP3Q12983 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
BNIP3Q12983 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
BNIP3Q12983 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
BNIP3Q12983 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
BNIP3Q12983 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
BNIP3Q12983 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
BNIP3Q12983 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
BNIP3Q12983 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
BNIP3Q12983 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
BNIP3Q12983 ATP6V0B-213ENST00000532642 1685 ntTSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
BNIP3Q12983 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
BNIP3Q12983 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
BNIP3Q12983 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
BNIP3Q12983 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
BNIP3Q12983 STXBP1-203ENST00000476182 566 ntTSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
BNIP3Q12983 AC134349.1-201ENST00000543969 385 ntTSL 3 BASIC19.76■□□□□ 0.75
BNIP3Q12983 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
BNIP3Q12983 AQP4-AS1-204ENST00000582605 525 ntTSL 4 BASIC19.76■□□□□ 0.75
BNIP3Q12983 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC19.76■□□□□ 0.75
BNIP3Q12983 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
BNIP3Q12983 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
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BNIP3Q12983 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
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BNIP3Q12983 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
BNIP3Q12983 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
BNIP3Q12983 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
BNIP3Q12983 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
BNIP3Q12983 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
BNIP3Q12983 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
BNIP3Q12983 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
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BNIP3Q12983 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
BNIP3Q12983 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
BNIP3Q12983 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
BNIP3Q12983 AC087499.1-201ENST00000418141 1075 ntBASIC19.75■□□□□ 0.75
BNIP3Q12983 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
BNIP3Q12983 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
BNIP3Q12983 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC19.75■□□□□ 0.75
BNIP3Q12983 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
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BNIP3Q12983 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
BNIP3Q12983 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC19.75■□□□□ 0.75
BNIP3Q12983 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
BNIP3Q12983 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
BNIP3Q12983 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
BNIP3Q12983 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC19.75■□□□□ 0.75
BNIP3Q12983 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
BNIP3Q12983 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
BNIP3Q12983 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
BNIP3Q12983 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
BNIP3Q12983 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
BNIP3Q12983 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
BNIP3Q12983 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
BNIP3Q12983 KRT8P12-201ENST00000468527 998 ntTSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
BNIP3Q12983 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
BNIP3Q12983 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
BNIP3Q12983 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
BNIP3Q12983 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
BNIP3Q12983 SLC39A4-201ENST00000276833 2297 ntTSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
BNIP3Q12983 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
BNIP3Q12983 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
BNIP3Q12983 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
BNIP3Q12983 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
BNIP3Q12983 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24 ms