Protein–RNA interactions for Protein: Q12789

GTF3C1, General transcription factor 3C polypeptide 1, humanhuman

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Length 2,109 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF3C1Q12789 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
GTF3C1Q12789 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
GTF3C1Q12789 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
GTF3C1Q12789 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
GTF3C1Q12789 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
GTF3C1Q12789 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
GTF3C1Q12789 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
GTF3C1Q12789 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
GTF3C1Q12789 TMEM235-204ENST00000551068 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
GTF3C1Q12789 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
GTF3C1Q12789 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
GTF3C1Q12789 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
GTF3C1Q12789 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
GTF3C1Q12789 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
GTF3C1Q12789 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
GTF3C1Q12789 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
GTF3C1Q12789 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
GTF3C1Q12789 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
GTF3C1Q12789 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
GTF3C1Q12789 AC005521.1-201ENST00000393351 872 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
GTF3C1Q12789 ATP5S-204ENST00000426751 1171 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
GTF3C1Q12789 AP001059.1-201ENST00000442785 523 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
GTF3C1Q12789 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
GTF3C1Q12789 C1QL1P1-201ENST00000568105 661 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
GTF3C1Q12789 AC145285.6-201ENST00000604632 637 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
GTF3C1Q12789 AC008735.6-201ENST00000635964 1292 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
GTF3C1Q12789 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
GTF3C1Q12789 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
GTF3C1Q12789 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
GTF3C1Q12789 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
GTF3C1Q12789 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
GTF3C1Q12789 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
GTF3C1Q12789 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
GTF3C1Q12789 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
GTF3C1Q12789 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
GTF3C1Q12789 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
GTF3C1Q12789 DECR2-212ENST00000627716 352 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
GTF3C1Q12789 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
GTF3C1Q12789 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
GTF3C1Q12789 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
GTF3C1Q12789 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
GTF3C1Q12789 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
GTF3C1Q12789 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
GTF3C1Q12789 HMGB3P22-201ENST00000442010 597 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
GTF3C1Q12789 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
GTF3C1Q12789 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
GTF3C1Q12789 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
GTF3C1Q12789 KRT18P22-201ENST00000402024 1347 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
GTF3C1Q12789 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
GTF3C1Q12789 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
GTF3C1Q12789 FUOM-203ENST00000368552 762 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
GTF3C1Q12789 AL445645.1-201ENST00000451318 1019 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
GTF3C1Q12789 AC011506.1-201ENST00000474329 610 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
GTF3C1Q12789 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
GTF3C1Q12789 KRT18P35-201ENST00000510488 1269 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
GTF3C1Q12789 AC117500.4-201ENST00000542797 617 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
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GTF3C1Q12789 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
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GTF3C1Q12789 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
GTF3C1Q12789 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC17.72■□□□□ 0.43
GTF3C1Q12789 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
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GTF3C1Q12789 PTCRA-201ENST00000304672 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
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GTF3C1Q12789 PTCRA-202ENST00000441198 1005 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
GTF3C1Q12789 PTCRA-203ENST00000446507 759 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
GTF3C1Q12789 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
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GTF3C1Q12789 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
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GTF3C1Q12789 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
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GTF3C1Q12789 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC17.71■□□□□ 0.43
GTF3C1Q12789 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
GTF3C1Q12789 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
GTF3C1Q12789 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
GTF3C1Q12789 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
GTF3C1Q12789 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
GTF3C1Q12789 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
GTF3C1Q12789 PRDX5-201ENST00000265462 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
GTF3C1Q12789 ING1-202ENST00000338450 1189 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
GTF3C1Q12789 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
GTF3C1Q12789 AL162231.1-203ENST00000416454 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.42
GTF3C1Q12789 KRT18P57-201ENST00000443599 1254 ntBASIC17.71■□□□□ 0.42
GTF3C1Q12789 CHAC1-203ENST00000487220 853 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.42
GTF3C1Q12789 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
GTF3C1Q12789 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.42
GTF3C1Q12789 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.42
GTF3C1Q12789 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
GTF3C1Q12789 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
GTF3C1Q12789 LINC01568-207ENST00000641790 1380 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
GTF3C1Q12789 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
GTF3C1Q12789 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
GTF3C1Q12789 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
GTF3C1Q12789 MLLT10-205ENST00000377100 1136 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
GTF3C1Q12789 SUV39H2-204ENST00000378325 1292 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
GTF3C1Q12789 AL109797.1-201ENST00000452501 835 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
GTF3C1Q12789 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
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