Protein–RNA interactions for Protein: Q08289

CACNB2, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit beta-2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 660 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNB2Q08289 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
CACNB2Q08289 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CACNB2Q08289 FGF8-201ENST00000320185 799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CACNB2Q08289 AL031133.1-201ENST00000406807 723 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
CACNB2Q08289 FAM8A6P-201ENST00000407496 1135 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
CACNB2Q08289 AC007731.5-201ENST00000429594 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CACNB2Q08289 SLC25A1P4-201ENST00000567977 778 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
CACNB2Q08289 RNF165-206ENST00000590330 1049 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CACNB2Q08289 AC139887.4-201ENST00000607877 719 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
CACNB2Q08289 ASRGL1-211ENST00000628829 1161 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CACNB2Q08289 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CACNB2Q08289 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CACNB2Q08289 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CACNB2Q08289 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CACNB2Q08289 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CACNB2Q08289 PTGES2-214ENST00000617202 1344 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CACNB2Q08289 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CACNB2Q08289 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CACNB2Q08289 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CACNB2Q08289 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CACNB2Q08289 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CACNB2Q08289 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CACNB2Q08289 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CACNB2Q08289 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CACNB2Q08289 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CACNB2Q08289 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CACNB2Q08289 BAD-201ENST00000309032 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CACNB2Q08289 MRPL52-201ENST00000311892 1042 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CACNB2Q08289 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CACNB2Q08289 HMGA1P5-201ENST00000412453 271 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
CACNB2Q08289 SAPCD2P2-201ENST00000431719 1174 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
CACNB2Q08289 SGO1-208ENST00000437051 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CACNB2Q08289 KRTCAP3-207ENST00000543753 956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CACNB2Q08289 CLN6-204ENST00000564752 900 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CACNB2Q08289 DCTN5-208ENST00000568589 772 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CACNB2Q08289 AC130371.2-201ENST00000619443 611 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
CACNB2Q08289 SPINK2-207ENST00000631082 392 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CACNB2Q08289 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CACNB2Q08289 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CACNB2Q08289 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CACNB2Q08289 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CACNB2Q08289 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
CACNB2Q08289 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CACNB2Q08289 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CACNB2Q08289 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CACNB2Q08289 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CACNB2Q08289 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CACNB2Q08289 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CACNB2Q08289 NDUFA10-214ENST00000620965 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CACNB2Q08289 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CACNB2Q08289 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CACNB2Q08289 FGF8-202ENST00000344255 707 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CACNB2Q08289 LINC01381-201ENST00000431650 466 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CACNB2Q08289 C16orf91-201ENST00000442039 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CACNB2Q08289 TOLLIP-AS1-201ENST00000530897 939 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
CACNB2Q08289 AL121894.2-201ENST00000602977 491 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
CACNB2Q08289 AL138966.2-201ENST00000621997 464 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
CACNB2Q08289 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CACNB2Q08289 CAMK4-210ENST00000512453 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CACNB2Q08289 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CACNB2Q08289 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CACNB2Q08289 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CACNB2Q08289 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CACNB2Q08289 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CACNB2Q08289 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CACNB2Q08289 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CACNB2Q08289 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CACNB2Q08289 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CACNB2Q08289 KRT17P2-202ENST00000326333 1174 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CACNB2Q08289 PTGDS-202ENST00000371625 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CACNB2Q08289 RNF152P1-201ENST00000397754 604 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
CACNB2Q08289 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CACNB2Q08289 AC007563.2-201ENST00000447289 552 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CACNB2Q08289 CHAC1-203ENST00000487220 853 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CACNB2Q08289 AP006284.1-202ENST00000527113 527 ntTSL 4 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CACNB2Q08289 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CACNB2Q08289 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
CACNB2Q08289 ULK4P3-205ENST00000568486 1158 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CACNB2Q08289 AL929554.1-201ENST00000568665 460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CACNB2Q08289 PSMD8-202ENST00000585598 541 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CACNB2Q08289 ZNF575-205ENST00000601282 1086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CACNB2Q08289 CYB561D2-210ENST00000607121 1004 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CACNB2Q08289 AP000692.2-201ENST00000608391 879 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
CACNB2Q08289 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CACNB2Q08289 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CACNB2Q08289 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CACNB2Q08289 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CACNB2Q08289 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CACNB2Q08289 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
CACNB2Q08289 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CACNB2Q08289 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CACNB2Q08289 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CACNB2Q08289 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CACNB2Q08289 DOC2A-209ENST00000564979 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CACNB2Q08289 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
CACNB2Q08289 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CACNB2Q08289 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CACNB2Q08289 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CACNB2Q08289 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CACNB2Q08289 HIST1H2APS4-201ENST00000362070 348 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.5 ms