Protein–RNA interactions for Protein: Q07092

COL16A1, Collagen alpha-1(XVI) chain, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,604 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL16A1Q07092 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
COL16A1Q07092 AC004951.3-201ENST00000418645 1148 ntBASIC27.03■■□□□ 1.92
COL16A1Q07092 PTPA-216ENST00000432651 857 ntTSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
COL16A1Q07092 FAAHP1-202ENST00000446499 1238 ntBASIC27.03■■□□□ 1.92
COL16A1Q07092 RCHY1-208ENST00000512706 1011 ntTSL 3 BASIC27.03■■□□□ 1.92
COL16A1Q07092 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
COL16A1Q07092 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
COL16A1Q07092 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
COL16A1Q07092 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
COL16A1Q07092 ASNS-206ENST00000437628 1638 ntTSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
COL16A1Q07092 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
COL16A1Q07092 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
COL16A1Q07092 CLN3-202ENST00000355477 1173 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
COL16A1Q07092 DBNDD2-202ENST00000360981 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
COL16A1Q07092 LY6E-213ENST00000522528 606 ntTSL 3 BASIC27.02■■□□□ 1.92
COL16A1Q07092 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
COL16A1Q07092 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
COL16A1Q07092 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
COL16A1Q07092 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
COL16A1Q07092 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
COL16A1Q07092 RASGRP2-208ENST00000394428 444 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.92
COL16A1Q07092 PLAC8-202ENST00000411416 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.92
COL16A1Q07092 AL845331.1-201ENST00000424978 1190 ntBASIC27.01■■□□□ 1.92
COL16A1Q07092 AL445685.1-201ENST00000425802 762 ntTSL 3 BASIC27.01■■□□□ 1.92
COL16A1Q07092 TSPY17P-201ENST00000450329 467 ntBASIC27.01■■□□□ 1.92
COL16A1Q07092 AC009078.2-202ENST00000463353 338 ntBASIC27.01■■□□□ 1.92
COL16A1Q07092 SNX5-210ENST00000481323 562 ntTSL 3 BASIC27.01■■□□□ 1.92
COL16A1Q07092 AC092119.3-201ENST00000612618 583 ntBASIC27.01■■□□□ 1.92
COL16A1Q07092 SMN2-213ENST00000614240 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.92
COL16A1Q07092 DBX1-201ENST00000524983 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.92
COL16A1Q07092 JPT1-203ENST00000409753 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
COL16A1Q07092 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
COL16A1Q07092 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
COL16A1Q07092 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
COL16A1Q07092 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
COL16A1Q07092 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
COL16A1Q07092 RAB28-202ENST00000330852 1715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
COL16A1Q07092 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
COL16A1Q07092 CABP1-201ENST00000288616 1369 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
COL16A1Q07092 POLR2D-202ENST00000409698 806 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
COL16A1Q07092 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
COL16A1Q07092 AL512604.3-201ENST00000569583 964 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
COL16A1Q07092 AC008481.3-201ENST00000585656 727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
COL16A1Q07092 AL671883.3-201ENST00000603274 991 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
COL16A1Q07092 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
COL16A1Q07092 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
COL16A1Q07092 LY6E-203ENST00000517503 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27■■□□□ 1.91
COL16A1Q07092 RPA2-201ENST00000313433 1237 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
COL16A1Q07092 PLPP5-202ENST00000422581 853 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
COL16A1Q07092 UNC93B7-201ENST00000509439 705 ntBASIC27■■□□□ 1.91
COL16A1Q07092 SPINT1-AS1-202ENST00000564302 643 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
COL16A1Q07092 MIR3652-201ENST00000579335 131 ntBASIC27■■□□□ 1.91
COL16A1Q07092 IFNL4P1-201ENST00000607083 540 ntBASIC27■■□□□ 1.91
COL16A1Q07092 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
COL16A1Q07092 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
COL16A1Q07092 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
COL16A1Q07092 DTNBP1-203ENST00000355917 1359 ntTSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
COL16A1Q07092 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
COL16A1Q07092 AZU1-201ENST00000233997 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
COL16A1Q07092 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC26.99■■□□□ 1.91
COL16A1Q07092 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC26.99■■□□□ 1.91
COL16A1Q07092 CYHR1-203ENST00000424149 1162 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
COL16A1Q07092 LAMTOR4-205ENST00000468582 621 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
COL16A1Q07092 AL031008.1-201ENST00000619963 541 ntBASIC26.99■■□□□ 1.91
COL16A1Q07092 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
COL16A1Q07092 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
COL16A1Q07092 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
COL16A1Q07092 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
COL16A1Q07092 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
COL16A1Q07092 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
COL16A1Q07092 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
COL16A1Q07092 HLA-G-205ENST00000428701 1578 ntAPPRIS P2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
COL16A1Q07092 SPDYE15P-201ENST00000424157 909 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
COL16A1Q07092 FIS1-207ENST00000474120 915 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
COL16A1Q07092 NECTIN3-AS1-204ENST00000476301 568 ntTSL 4 BASIC26.98■■□□□ 1.91
COL16A1Q07092 AC021066.1-201ENST00000549788 647 ntTSL 3 BASIC26.98■■□□□ 1.91
COL16A1Q07092 OAZ1-211ENST00000602676 1148 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
COL16A1Q07092 SNHG10-201ENST00000500370 1531 ntTSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
COL16A1Q07092 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
COL16A1Q07092 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
COL16A1Q07092 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
COL16A1Q07092 TCEAL2-202ENST00000372780 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
COL16A1Q07092 ST6GALNAC4P1-201ENST00000435385 499 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
COL16A1Q07092 CR769775.1-204ENST00000439760 747 ntTSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
COL16A1Q07092 DGUOK-AS1-203ENST00000453103 601 ntTSL 3 BASIC26.97■■□□□ 1.91
COL16A1Q07092 YPEL3-204ENST00000563788 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.97■■□□□ 1.91
COL16A1Q07092 AL353719.1-201ENST00000566847 864 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
COL16A1Q07092 RNPS1-224ENST00000569598 918 ntTSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
COL16A1Q07092 FAM104A-205ENST00000581110 512 ntTSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
COL16A1Q07092 ZNF667-AS1-208ENST00000594783 475 ntTSL 3 BASIC26.97■■□□□ 1.91
COL16A1Q07092 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
COL16A1Q07092 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
COL16A1Q07092 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
COL16A1Q07092 ADGRD1-AS1-202ENST00000542980 1277 ntTSL 4 BASIC26.96■■□□□ 1.91
COL16A1Q07092 MRPL46-202ENST00000558531 1002 ntTSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
COL16A1Q07092 CMTM3-210ENST00000565666 769 ntTSL 3 BASIC26.96■■□□□ 1.91
COL16A1Q07092 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
COL16A1Q07092 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC26.96■■□□□ 1.91
COL16A1Q07092 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
COL16A1Q07092 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.4 ms